chr1	840753	841210	840812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOC2L	51479	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	945769	946034	945890	Y	CCNL2,ATAD3B	PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	ISG15	769	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	1283060	1283625	1283139	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1,CCNL2	NA	NA	NA	NA	DVL1	330	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	1952050	1952360	1952259	Y	C1orf70,PRKCZ,GABRD	GABRD	NA	NA	NA	NA	GABRD	3270	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	2177615	2177829	2177732	Y	NADK,GNB1,TNFRSF14,SKI	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	35456	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,TNFRSF14,FAM213B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	7107	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	3111769	3111989	3111939	Y	PRDM16	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM16	128037	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	3229711	3230157	3229865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM16	245979	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr1	3231111	3231335	3231228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM16	247379	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	6943772	6944262	6943813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	100388	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	7177733	7177848	7177794	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-8P	99572	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr1	8137301	8137521	8137361	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	52503	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	8157417	8157780	8157543	Y	NA	NA	ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	72619	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr1	8272041	8272390	8272277	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	7384	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	8858188	8858497	8858477	Y	NA	RERE	NA	NA	NA	NA	RERE	17205	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	8964053	8964236	8964145	Y	ENO1	ENO1-IT1,ENO1	ENO1-AS1,ENO1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ENO1	26745	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	9222919	9223181	9223073	Y	SPSB1	GPR157	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A,GPR157	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPR157	35690	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	9223692	9223875	9223840	Y	NA	GPR157	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPR157	36463	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	9223907	9224260	9224149	Y	SPSB1	GPR157	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A	IMR90	Hi-C	24141950	GPR157	36678	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	10269964	10270260	10269995	Y	RBP7,PGD,KIF1B	KIF1B	NA	NA	NA	NA	KIF1B	1101	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	10804844	10805001	10804872	Y	NA	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	49706	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	10926873	10927035	10926954	Y	NA	NA	PEX14,CASZ1,APITD1-CORT,C1orf127	IMR90	Hi-C	24141950	CASZ1	72166	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	12050736	12051137	12050880	Y	NPPA,NPPB,MFN2	MFN2,MIIP	NA	NA	NA	NA	MFN2	12498	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	12485613	12485784	12485698	Y	PRAMEF1,AADACL4	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	189953	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	12616547	12616769	12616712	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	58968	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	12675687	12675874	12675779	Y	VPS13D	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	15111272	15111486	15111395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAZN	188072	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	16479299	16479465	16479382	Y	FBLIM1,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	241	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	16499761	16499895	16499826	Y	SPEN,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	19179	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	16500084	16500309	16500220	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	19502	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	RNU1-1	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-1	12489	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	17109	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr1	17417123	17417163	17417153	Y	NA	SDHB,PADI2	NA	NA	NA	NA	PADI2	26785	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	17518130	17518260	17518142	Y	NA	PADI1	NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3	IMR90	Hi-C	24141950	PADI1	11361	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	17578205	17578469	17578334	Y	NA	PADI1,PADI3	NA	NA	NA	NA	PADI3	4612	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	17865185	17865523	17865202	Y	ARHGEF10L	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	855	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	17867253	17867735	17867370	Y	NA	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	2923	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	17956441	17957463	17956793	Y	PADI4	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	92111	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	19264079	19264209	19264144	Y	IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	ALDH4A1	IMR90	Hi-C	24141950	IFFO2	16971	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	19274997	19275345	19275068	Y	IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	NA	NA	NA	NA	IFFO2	5835	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	19277155	19277462	19277361	Y	UBR4,IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	NA	NA	NA	NA	IFFO2	3718	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	19336477	19336714	19336579	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	55297	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr1	19337577	19337942	19337698	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	56397	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	21149682	21149798	21149749	Y	CAMK2N1,EIF4G3	HP1BP3	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	37866	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	21588176	21588724	21588522	Y	ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	81273	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	21663991	21664182	21664145	Y	EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	5815	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	24691833	24692082	24691893	Y	PNRC2,GRHL3	NIPAL3	NA	NA	NA	NA	NIPAL3	48202	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	26677301	26677628	26677413	Y	CATSPER4,ZNF683	UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	AIM1L	993	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	26678060	26678317	26678200	Y	CNKSR1,AIM1L	UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	AIM1L	304	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	27321452	27321840	27321632	Y	TMEM222,TRNP1,FAM46B	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	TRNP1	3254	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	27414370	27414629	27414488	Y	PIGV,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A1	76843	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	29503706	29504118	29503928	Y	NA	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2381	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	29504261	29504387	29504317	Y	YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2112	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	29565515	29565732	29565598	Y	SRSF4,PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	4487	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	90728	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr1	32253647	32254040	32253861	Y	LCK	BAI2,SPOCD1	NA	NA	NA	NA	BAI2	25153	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	32732571	32732683	32732626	Y	LCK	EIF3I,TMEM234,HDAC1	NA	NA	NA	NA	HDAC1	23004	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	32966228	32966602	32966575	Y	FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8A	NA	NA	NA	NA	ZBTB8A	36426	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	33428474	33429020	33428770	Y	NA	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	188	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	33446816	33447482	33446950	Y	RNF19B	RNF19B	RNF19B,AK2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19B	18530	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	33645848	33646140	33645995	Y	HPCA,PHC2,TRIM62	TRIM62	NA	NA	NA	NA	TRIM62	188	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	33804092	33804324	33804199	Y	NA	AL513327.1	NA	NA	NA	NA	AL513327.1	41117	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	33804359	33804743	33804679	Y	RNF19B,TRIM62,PHC2	AL513327.1	NA	NA	NA	NA	AL513327.1	41384	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	35891843	35891965	35891904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	129109	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	35892196	35892421	35892350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	128653	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	36616485	36616868	36616577	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	2312	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	36817040	36817280	36817137	Y	NA	STK40,LSM10	SH3D21,FAM176B	K562	ChIA-PET	22265404	STK40	32217	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr1	36839449	36839891	36839558	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	9606	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr1	36840093	36840535	36840445	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	8962	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	36849527	36849580	36849557	Y	EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	30	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	39327096	39327575	39327204	Y	NA	RRAGC,RP5-864K19.4,MYCBP	NA	NA	NA	NA	RP5-864K19.4	3424	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	39509536	39509726	39509631	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	19546	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	39624919	39625154	39625144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	79931	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	39644229	39644606	39644401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	99241	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	39657786	39658129	39657912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	112798	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	39857791	39857995	39857869	Y	NA	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	16156	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr1	40006104	40006751	40006634	Y	MFSD2A,PABPC4	PABPC4	NA	NA	NA	NA	PABPC4	33711	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	41633074	41633562	41633301	Y	SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	72264	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	42071739	42071927	42071841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	123395	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	179507	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.46996562026443
chr1	42367142	42367456	42367439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	132140	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	43405621	43405821	43405630	Y	CCDC30,CCDC23,ERMAP,SZT2,SLC2A1	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	16709	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	43406108	43407009	43406836	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	15521	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	45746932	45746947	45746939	Y	NA	ZSWIM5,HPDL	ZSWIM5,UROD,HECTD3	IMR90	Hi-C	24141950	ZSWIM5	22934	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	46102450	46102810	46102714	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	12688	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr1	46528388	46528566	46528496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	110179	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	48429188	48429510	48429349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-61P	482098	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	50763281	50763486	50763384	Y	NA	NA	AGBL4	IMR90	Hi-C	24141950	FAF1	660449	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	51056997	51057361	51057215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	366574	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	51298202	51298577	51298390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	125358	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	51475380	51475551	51475487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2C	50963	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	51475745	51476056	51475832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2C	51328	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	53168640	53169047	53168726	Y	NA	ZYG11B	SELRC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ZYG11B	21079	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	53482500	53482782	53482682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCP2	91599	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	54150852	54151742	54151620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF1	202665	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	54804829	54805209	54805022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP3	71943	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	57043287	57044160	57043621	Y	PRKAA2,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	64814	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	57297629	57297838	57297785	Y	NA	NA	DAB1,C1orf168,C8A,C8B	IMR90	Hi-C	24141950	PRKAA2	188634	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	59050239	59050578	59050488	Y	NA	DAB1,OMA1	MYSM1,FGGY,OMA1	IMR90	Hi-C	24141950	OMA1	39765	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	59280773	59281281	59281052	Y	FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	32988	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	34088	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr1	59369049	59370138	59369602	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	JUN	121264	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	59608749	59609120	59609039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	151190	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr1	59616706	59617089	59616861	Y	NA	NA	HSD52,FGGY,JUN,LOC100131060,MIR4711	IMR90	Hi-C	24141950	FGGY	143221	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	60157078	60157331	60157204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP2J2	233131	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	60174952	60174968	60174960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP2J2	215494	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	60598724	60598934	60598848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP2J2	208262	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr1	62057030	62057430	62057230	Y	NA	NA	NFIA,INADL	IMR90	Hi-C	24141950	TM2D1	131665	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	62208815	62209373	62208933	Y	NA	TM2D1,INADL	NA	NA	NA	NA	INADL	2666	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	62928310	62928608	62928459	Y	KANK4,USP1,USP1,ATG4C	USP1	NA	NA	NA	NA	USP1	28342	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	64197270	64197475	64197385	Y	NA	ROR1	ROR1,UBE2U,PGM1	IMR90	Hi-C	24141950	ROR1	40218	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	65363729	65364057	65363938	Y	JAK1	NA	NA	NA	NA	NA	JAK1	66130	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	65888047	65888596	65888066	Y	LEPR,LEPROT,LEPR,LEPROT	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	3777	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.74440624473826
chr1	65891768	65892129	65891951	Y	NA	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	7498	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr1	67374841	67375185	67375111	Y	SGIP1,WDR78	WDR78,MIER1	NA	NA	NA	NA	WDR78	13385	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	67883059	67883215	67883204	Y	NA	SERBP1	NA	NA	NA	NA	SERBP1	10883	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	68234822	68235039	68234951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG12	62111	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	68257383	68257657	68257565	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	39493	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr1	68572958	68573227	68573176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLS	123576	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	68639460	68639856	68639657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLS	56947	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	68849988	68850367	68850179	Y	NA	NA	LOC100289178,WLS,RPE65	IMR90	Hi-C	24141950	RPE65	63275	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	68858132	68858533	68858311	Y	NA	NA	WLS,LOC100289178	IMR90	Hi-C	24141950	RPE65	55109	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr1	70691921	70692281	70691982	Y	ANKRD13C,LRRC40,SRSF11	LRRC40,SRSF11	NA	NA	NA	NA	SRSF11	22556	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	70746826	70747040	70746993	Y	ANKRD13C	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD13C	71377	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	70807938	70808237	70808103	Y	NA	ANKRD13C,HHLA3	NA	NA	NA	NA	ANKRD13C	10180	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	72749220	72749791	72749447	Y	NEGR1	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	2803	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr1	72750417	72750888	72750606	Y	NA	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	4000	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	75168986	75169131	75169081	Y	NA	TYW3,CRYZ	NA	NA	NA	NA	TYW3	27705	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	76645391	76645540	76645467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC3	106987	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	77404135	77404353	77404238	Y	ST6GALNAC5	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-706A16.3	188415	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	77511618	77511728	77511673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-706A16.3	81040	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	78008083	78008322	78008203	Y	NA	NA	ZZZ3	IMR90	Hi-C	24141950	ZZZ3	138782	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	78021710	78022056	78021808	Y	AK5,AK5,FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	125048	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	78067790	78068312	78068066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	78792	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	114487	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	772913	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	85007374	85007584	85007581	Y	NA	GNG5,CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	30579	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	85667688	85667915	85667906	Y	NA	SYDE2	NA	NA	NA	NA	SYDE2	2959	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	85791287	85791404	85791348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	50514	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	85794698	85795078	85794848	Y	CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	53925	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.19552499579061
chr1	85795855	85796291	85796120	Y	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	55082	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr1	85796595	85797055	85796822	Y	CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	55822	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	85810010	85810182	85810130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	69237	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	86072885	86073441	86073156	Y	CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90	Hi-C	24141950	CYR61	28441	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	86077578	86077925	86077749	Y	DDAH1,CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYR61	33134	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	86078461	86078819	86078680	Y	DDAH1,CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYR61	34017	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr1	87082786	87082842	87082814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3GLB1	85417	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	87190718	87190974	87190846	Y	NA	SH3GLB1	NA	NA	NA	NA	SH3GLB1	22459	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	87691904	87692436	87692089	Y	NA	NA	LOC339524,LMO4	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	99715	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	89149109	89149398	89149189	Y	NA	PKN2	NA	NA	NA	NA	PKN2	1204	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	89358212	89358439	89358316	Y	PKN2,CCBL2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	2585	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	92183243	92183457	92183382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	186435	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	92189033	92189061	92189048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	180831	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	92198149	92198440	92198227	Y	TGFBR3	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	171452	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	92269494	92269966	92269778	Y	TGFBR3,RPAP2,GLMN	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	99926	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	92295673	92296022	92295848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	73870	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr1	93003662	93004045	93003868	Y	RPAP2,GLMN,RPL5,GFI1	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-59P	160446	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	93427945	93428408	93428079	Y	MTF2,DR1,FAM69A	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	2888	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	93634565	93634982	93634927	Y	MTF2	CCDC18,TMED5	NA	NA	NA	NA	CCDC18	8494	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	94007993	94008357	94008092	Y	FNBP1L,BCAR3	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	96305	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr1	94021310	94021626	94021469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	109622	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr1	94023703	94024059	94023930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	112015	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr1	94089710	94089715	94089713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	178022	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	94125861	94126246	94126059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAR3	184460	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr1	94128177	94128297	94128262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAR3	182409	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	94158601	94159338	94158654	Y	GCLM,DNTTIP2,BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCAR3	151368	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.84216874263356
chr1	94161111	94161471	94161388	Y	GCLM,DNTTIP2	NA	BCAR3	IMR90	Hi-C	24141950	BCAR3	149235	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	94167175	94167520	94167394	Y	BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCAR3	143186	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr1	94204695	94204800	94204748	Y	NA	NA	BCAR3,MIR760,DR1,DNTTIP2	IMR90	Hi-C	24141950	BCAR3	105906	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	94532879	94533090	94532990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLM	159913	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	94535371	94535770	94535449	Y	ARHGAP29	NA	NA	NA	NA	NA	GCLM	162405	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	94621912	94621923	94621919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP29	116701	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr1	94701813	94701865	94701839	Y	ARHGAP29	ARHGAP29	NA	NA	NA	NA	ARHGAP29	36759	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	94712395	94712617	94712502	Y	ARHGAP29	ARHGAP29	ABCA4,ARHGAP29,ABCD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP29	26007	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr1	94788386	94788592	94788436	Y	ARHGAP29,F3	ARHGAP29	ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP29	49762	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr1	94792807	94793133	94793077	Y	ARHGAP29	NA	ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP29	54183	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr1	94795618	94795987	94795955	Y	NA	NA	ARHGAP29,ABCA4,ABCD3	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP29	56994	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	96444068	96444298	96444183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P11	466188	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	98606055	98606462	98606113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	221450	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	100505302	100505632	100505358	Y	NA	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	3649	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	100858865	100858991	100858930	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	50281	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	108643279	108643407	108643343	Y	NA	NA	VAV3	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A24	98064	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	108741685	108742156	108741931	Y	FAM102B	SLC25A24	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	214	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	109469350	109469540	109469522	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	34566	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	109572587	109572654	109572620	Y	NA	WDR47,TAF13	NA	NA	NA	NA	WDR47	10196	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	109784080	109784425	109784202	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	CELSR2	IMR90	Hi-C	24141950	CELSR2	6216	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	110151943	110152270	110152107	Y	NA	AMPD2,GSTM4	NA	NA	NA	NA	AMPD2	4456	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	110778589	110778756	110778673	Y	NA	KCNC4	NA	NA	NA	NA	KCNC4	26624	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	110976504	110976901	110976673	Y	CD53	SLC16A4	HBXIP,SLC6A17,LOC440600,RBM15,PROK1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC16A4	44800	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	111441077	111441266	111441172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIF1	63435	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	113932415	113932748	113932683	Y	NA	MAGI3	NA	NA	NA	NA	MAGI3	1044	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	113949729	113949849	113949733	Y	NA	MAGI3,RP11-512F24.1	NA	NA	NA	NA	MAGI3	18358	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	114236415	114236760	114236542	Y	MAGI3	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF1	63351	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	114244987	114245321	114245197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF1	54790	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	115722074	115722498	115722181	Y	NGF	NA	NGF	IMR90	Hi-C	24141950	SIKE1	400768	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	116088478	116088732	116088606	Y	NA	NA	NGF,VANGL1,SYCP1	IMR90	Hi-C	24141950	VANGL1	93842	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	117103380	117103518	117103480	Y	NA	NAP1L4P1,CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	8143	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	120178530	120178767	120178634	Y	NA	ZNF697,PHGDH	NA	NA	NA	NA	ZNF697	9629	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	144871122	144871347	144871255	Y	PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF9	61378	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	145113904	145114998	145114671	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NBPF10,NOTCH2NL	SEC22B	NA	NA	NA	NA	SEC22B	19684	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.46996562026443
chr1	146774989	146775112	146775013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD1L	62698	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.29328749368591
chr1	148000699	148000802	148000795	Y	NA	RNVU1-13	NA	NA	NA	NA	RNVU1-13	8553	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	149816287	149817606	149817166	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2AA4	3037	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr1	149821015	149821647	149821349	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2AA4	372	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	149910900	149911536	149911461	Y	NA	SV2A,SF3B4,MTMR11	NA	NA	NA	NA	MTMR11	4109	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	149931955	149932255	149932237	Y	NA	SV2A,SF3B4,MTMR11,OTUD7B	MTMR11,SF3B4	IMR90	Hi-C	24141950	MTMR11	25164	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	149981648	149981889	149981683	Y	ANP32E,OTUD7B	OTUD7B	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	1023	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	150577042	150577503	150577391	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	22585	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	151913815	151914271	151914054	Y	S100A10	THEM4	S100A10,CELF3,THEM4,RORC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	33531	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	151918166	151918684	151918434	Y	NA	THEM4,S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	37882	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	152140379	152140745	152140485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	S100A11	121996	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	15.0942343460604
chr1	153541018	153541368	153541269	Y	PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13	S100A6,S100A4,S100A2,S100A16	NA	NA	NA	NA	S100A2	2652	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr1	153824989	153825297	153825210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	68154	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	KRTCAP2,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	155283531	155283932	155283776	Y	DCST1,EFNA1	HCN3,CLK2,FDPS,RUSC1	NA	NA	NA	NA	RUSC1	4755	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	155496665	155497012	155496914	Y	DCST1,HCN3,YY1AP1,ASH1L	ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L	33586	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	155535083	155535193	155535176	Y	HCN3	ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L	4485	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA	NA	NA	NA	NA	LMNA	44669	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	156468556	156468776	156468632	Y	MEF2D	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2D	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	156472693	156472952	156472780	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4073	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	156473111	156473378	156473326	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4491	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	156474686	156475018	156474923	Y	SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6066	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	156629760	156630406	156629967	Y	PAQR6,PAQR6,C1orf182,CCT3,ISG20L2,GPATCH4,HAPLN2	RP11-284F21.7,CRABP2	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	544	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	156895977	156896091	156896003	Y	LRRC71	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF11	117071	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	157964633	157965029	157964831	Y	OR10T2	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	3570	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	159859603	159860031	159859945	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2	C1orf204,SLAMF8	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC19	7922	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr1	160203977	160204039	160204035	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8	NA	NA	NA	NA	RP11-574F21.2	25495	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	160696081	160696317	160696161	Y	CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-312J18.5	166453	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr1	162508612	162508929	162508802	Y	UAP1	UHMK1,UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	20394	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	163006587	163006657	163006633	Y	RGS4,RGS4,RGS4	RGS4	C1orf110	IMR90	Hi-C	24141950	RGS4	29908	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	167135568	167135867	167135776	Y	NA	RP11-277B15.1	CD247,POU2F1,GPA33	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-277B15.1	5494	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.56772811815974
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	167322904	167323093	167323001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POU2F1	134838	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	168961520	168961569	168961544	Y	NA	NA	ATP1B1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP1B1	111366	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	171832189	171832290	171832196	Y	DNM3	DNM3	NA	NA	NA	NA	DNM3	23568	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	172972573	172972790	172972603	Y	PRDX6	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	471615	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	173984193	173984403	173984298	Y	GPR52,ZBTB37,RC3H1	RC3H1,RP11-160H22.3	NA	NA	NA	NA	RC3H1	5032	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	176024233	176024593	176024503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-318C24.1	135122	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	176244494	176244887	176244692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFWD2	69865	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	178378072	178378430	178378251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALGPS2	313870	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	179110934	179111289	179111201	Y	AXDND1,SOAT1,TOR3A,ABL2	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	62422	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	180249791	180250006	180249913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSOX1	127822	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	180250812	180250948	180250921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSOX1	128843	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	180921044	180921090	180921069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	68957	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr1	181081690	181081905	181081806	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	26052	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	181451162	181451821	181451484	Y	CACNA1E	NA	NA	NA	NA	NA	IER5	395524	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	182854499	182854851	182854644	Y	NA	DHX9	NA	NA	NA	NA	DHX9	47995	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	182998797	182999044	182998924	Y	NA	LAMC1	NA	NA	NA	NA	LAMC1	8202	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	183009080	183009399	183009240	Y	NA	LAMC1	NA	NA	NA	NA	LAMC1	18485	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	183133608	183133779	183133664	Y	LAMC2	NA	NA	NA	NA	NA	LAMC1	143013	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	183149947	183150219	183150157	Y	LAMC2	NA	NA	NA	NA	NA	LAMC1	159352	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	184005350	184005919	184005662	Y	RGL1,GLT25D2	TSEN15	RGL1	IMR90	Hi-C	24141950	TSEN15	12892	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	184033703	184034036	184033838	Y	NA	TSEN15	NA	NA	NA	NA	TSEN15	14892	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	184603995	184604243	184604119	Y	RNF2,EDEM3	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	117804	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	184922808	184923031	184922923	Y	EDEM3,SWT1,SWT1,RNF2,IVNS1ABP,FAM129A	FAM129A	NA	NA	NA	NA	FAM129A	18651	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	185264835	185265233	185265202	Y	NA	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	19228	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	187267139	187267250	187267195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	471054	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	193080839	193080969	193080896	Y	NA	GLRX2,CDC73	NA	NA	NA	NA	GLRX2	7595	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	197508366	197508752	197508559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1B	234074	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	198136529	198137056	198136658	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	12436	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	198465277	198465448	198465363	Y	NA	NA	PTPRC,ATP6V1G3	IMR90	Hi-C	24141950	NEK7	341184	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	198850238	198850638	198850585	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	503631	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	199142483	199142829	199142656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	211440	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	200457893	200457983	200457938	Y	NA	NA	C1orf98,NR5A2	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF281	80709	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	200783735	200784105	200783920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMSAP2	77049	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	200831452	200831819	200831500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMSAP2	124766	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	201426190	201426373	201426369	Y	NA	PHLDA3,RP11-134G8.7	NA	NA	NA	NA	PHLDA3	9992	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	201508517	201509575	201509484	Y	NA	RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	CSRP1	31933	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	201520953	201521395	201521173	Y	NA	RP11-134G8.7,CSRP1	NAV1,RPS10P7,IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	CSRP1	44369	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	201683757	201684240	201683949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPO9	112029	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	201717535	201717792	201717621	Y	NA	NA	IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	IPO9	78477	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	202217450	202217807	202217629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2T	91301	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	203101073	203101246	203101163	Y	NA	ADORA1,MYBPH	NA	NA	NA	NA	MYBPH	41695	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	111155	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.19552499579061
chr1	203491011	203491485	203491466	Y	PPFIA4,SNRPE	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	102204	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr1	203624863	203625211	203625050	Y	BTG2	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	31174	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	204043987	204044379	204044133	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	3744	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	204363456	204363666	204363499	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	15253	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr1	205144631	205144860	205144785	Y	NA	DSTYK	NA	NA	NA	NA	DSTYK	33867	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	205267691	205267999	205267801	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	20884	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	205410224	205410578	205410325	Y	DSTYK,TMCC2	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	12504	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	205418015	205418182	205418073	Y	NA	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	4900	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	206859136	206859493	206859328	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	2847	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	210710406	210710636	210710520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU5A-8P	164795	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543B16.1	309286	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	211837893	211837920	211837910	Y	NA	NEK2,RP11-122M14.1	NA	NA	NA	NA	NEK2	9040	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	212256975	212257253	212257095	Y	DTL,INTS7	RPL21P28	NA	NA	NA	NA	RPL21P28	33604	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	212659054	212659720	212659497	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	54825	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	212723252	212723516	212723384	Y	BATF3,ATF3	ATF3	ATF3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATF3	13160	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	212769584	212769966	212769788	Y	ANGEL2,PPP2R5A,ATF3,ATF3,ATF3	ATF3	NA	NA	NA	NA	ATF3	32908	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	214512112	214512120	214512117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD2	59667	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.19552499579061
chr1	214601098	214601566	214601506	Y	PTPN14	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	122226	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr1	214612784	214613126	214613017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	110666	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	214620076	214620672	214620502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	103120	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.74440624473826
chr1	217046388	217046574	217046481	Y	ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	755850	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	218550674	218551089	218550794	Y	NA	RP11-224O19.2,TGFB2	NA	NA	NA	NA	TGFB2	33097	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	218662454	218662669	218662563	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463,LOC643723	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TGFB2	144877	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	218669910	218670282	218669996	Y	NA	NA	TGFB2,LOC643723,LOC728463	IMR90	Hi-C	24141950	TGFB2	152333	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	218671989	218672275	218672071	Y	NA	NA	TGFB2,LOC643723,LOC728463	IMR90	Hi-C	24141950	TGFB2	154412	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	218847947	218848245	218848113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB2	330370	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	219455848	219455941	219455895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPLAL1	110662	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	219955751	219955972	219955860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPRS	262028	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	220399770	220399931	220399853	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	24981	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-378J18.3	121963	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	223095586	223095912	223095632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DISP1	109180	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	223901276	223901546	223901311	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	13981	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	223925260	223925580	223925340	Y	NA	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	37965	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.84216874263356
chr1	224690718	224691054	224690869	Y	WDR26	NA	CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	67983	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	224811590	224812043	224811760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR26	188855	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	225613143	225613456	225613257	Y	LBR,LBR	LBR	NA	NA	NA	NA	LBR	1171	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	225642606	225642805	225642652	Y	NA	LBR	EPHX1,LBR,ENAH,SRP9,TMEM63A,PYCR2,LEFTY2,C1orf55,H3F3A	IMR90	Hi-C	24141950	LBR	27979	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr1	226263544	226263865	226263697	Y	C1orf55	H3F3A	NA	NA	NA	NA	H3F3A	15992	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB	33608	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	227499470	227499818	227499796	Y	NA	CDC42BPA	NA	NA	NA	NA	CDC42BPA	4357	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	227976197	227976490	227976208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD4	55085	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	228124828	228124930	228124870	Y	ARF1,ARF1	WNT9A	NA	NA	NA	NA	WNT9A	8669	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	85938	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	6.86101561184565
chr1	229196056	229196102	229196080	Y	NA	NA	RHOU	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	208673	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	230220164	230220401	230220223	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	28628	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	231038131	231038454	231038293	Y	COG2,TTC13,GNPAT,C1orf131	C1orf198	NA	NA	NA	NA	C1orf198	34796	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr1	234254353	234254647	234254499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.1	236240	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	234738546	234738834	234738624	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4437	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr1	234908151	234908764	234908277	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRF2BP2	164880	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr1	235114050	235115068	235114636	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	175183	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	235242252	235242564	235242410	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	TOMM20	IRF2BP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TOMM20	47687	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr1	236080566	236081247	236080933	Y	LYST,GPR137B	NA	B3GALNT2,LYST,NID1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR137B	222585	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	236109486	236110063	236109737	Y	LYST	NA	LYST,NID1,GNG4,B3GALNT2	IMR90	Hi-C	24141950	GPR137B	193769	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	240306412	240306787	240306695	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	24668	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	242054721	242054907	242054820	Y	KMO	EXO1	NA	NA	NA	NA	EXO1	45452	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	244267717	244267933	244267824	Y	NA	NA	SDCCAG8,LOC339529,AKT3,ZNF238	IMR90	Hi-C	24141950	AKT3	255336	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	244417754	244418100	244418029	Y	AKT3,AKT3,ZNF238,ADSS	NA	LOC339529,AKT3,SDCCAG8,ZNF238	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	195336	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS,C1orf101	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	245255337	245255432	245255385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26B	60855	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr1	245939665	245940062	245939864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26B	623378	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	246035151	246035554	246035345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	633060	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr1	246038342	246038749	246038555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	629865	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr1	246948292	246948613	246948340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCCPDH	62943	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	247093396	247093478	247093437	Y	NA	AHCTF1	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	116	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	247206107	247206337	247206222	Y	NA	ZNF695,ZNF670	NA	NA	NA	NA	ZNF670	33776	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	247507326	247507475	247507401	Y	NA	ZNF496	ZNF670-ZNF695,AHCTF1,ZNF669,ZNF496	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF496	14178	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr1	249117788	249118228	249118121	Y	SH3BP5L	MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692	NA	NA	NA	NA	MIR3124	348	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.29328749368591
chr10	3133662	3133717	3133688	Y	PITRM1,PFKP	PFKP	NA	NA	NA	NA	PFKP	27137	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	3137708	3138098	3138049	Y	NA	PFKP	NA	NA	NA	NA	PFKP	31183	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr10	3216614	3216797	3216708	Y	NA	PITRM1	NA	NA	NA	NA	PITRM1	3611	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	3509617	3509911	3509759	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	296614	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr10	3510310	3510716	3510597	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	297307	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.46996562026443
chr10	3511181	3511689	3511507	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	298178	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr10	3524547	3524820	3524727	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	300653	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	3528683	3528786	3528735	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	296687	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr10	3845250	3845852	3845788	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	19777	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.01884686921208
chr10	3845999	3846426	3846282	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	20526	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	3846443	3847038	3846804	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	20970	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	3848037	3849536	3848891	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	22564	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr10	3850308	3850795	3850409	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	24835	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr10	3852273	3852886	3852712	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	26800	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr10	3928866	3929216	3928980	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	103393	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr10	3929991	3930887	3930290	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	104518	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr10	3932191	3932411	3932301	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	106718	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr10	3934486	3935471	3934810	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	109013	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	3984866	3985563	3985082	Y	KLF6	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	159393	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	3987998	3988450	3988285	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	162525	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.19552499579061
chr10	4218221	4218509	4218358	Y	NA	NA	KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	65595	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	4283808	4284356	4284092	Y	NA	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	4.11660936710739
chr10	4705159	4705783	4705486	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	12563	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr10	4713647	4713873	4713697	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	4473	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	4807724	4807860	4807810	Y	NA	AKR1E2	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AKR1E2	18961	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	4855217	4855416	4855349	Y	NA	AKR1E2	KLF6,NET1	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1E2	28396	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr10	5576341	5576485	5576413	Y	NET1,CALML3	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-463N16.6	59596	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	5587810	5588190	5587923	Y	NA	RP13-463N16.6	NA	NA	NA	NA	RP13-463N16.6	47891	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr10	5590507	5590769	5590638	Y	NA	RP13-463N16.6	NA	NA	NA	NA	RP13-463N16.6	45312	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	5590959	5591270	5591035	Y	NET1	RP13-463N16.6	NA	NA	NA	NA	RP13-463N16.6	44811	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr10	5770570	5770836	5770703	Y	NA	FAM208B	NA	NA	NA	NA	FAM208B	45769	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	6206285	6206560	6206485	Y	NA	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	21404	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	6240292	6240352	6240319	Y	IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	55411	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	6245814	6246792	6246043	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	60933	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr10	6321537	6321781	6321618	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	136656	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr10	6322373	6322594	6322421	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	137492	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	6341993	6342400	6342249	Y	IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3,PRKCQ	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	157112	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr10	6342540	6342669	6342624	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	157659	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	6443408	6443712	6443449	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKCQ	176551	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	6449763	6450038	6449901	Y	PRKCQ	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCQ	170225	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	8408171	8408387	8408297	Y	NA	NA	FLJ45983,GATA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	TAF3	549704	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	8662161	8662543	8662250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF3	803694	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	9281291	9281530	9281414	Y	NA	NA	FLJ45983,GATA3,TAF3	IMR90	Hi-C	24141950	TAF3	1422824	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	11917828	11918087	11917940	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	165082	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr10	11924114	11924319	11924232	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	158850	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr10	12195131	12195251	12195172	Y	CAMK1D	SEC61A2,CDC123,NUDT5	NA	NA	NA	NA	SEC61A2	25495	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr10	12455599	12455959	12455812	Y	SEC61A2,CAMK1D	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	66118	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	12490797	12491318	12490959	Y	SEC61A2,CAMK1D	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	101316	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	12747516	12747872	12747694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	358035	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	12749537	12749904	12749742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	360056	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.19552499579061
chr10	12961307	12961664	12961502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPTN	177785	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	12987890	12988351	12988184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPTN	151098	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	13131256	13131517	13131341	Y	NA	OPTN,CCDC3	CDC123,CAMK1D	IMR90	Hi-C	24141950	OPTN	7932	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	13908290	13908478	13908416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	281363	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr10	14624029	14624329	14624184	Y	DCLRE1C	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	121888	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	15178441	15178844	15178745	Y	NA	ACBD7,RPP38,NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	29848	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	15250805	15251188	15250997	Y	CDNF,MEIG1,C10orf111	NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	42113	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	17010242	17010673	17010572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	152715	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr10	17105178	17105416	17105257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	136637	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr10	17280857	17281170	17281014	Y	TRDMT1,VIM	TRDMT1,VIM,RP11-124N14.3	NA	NA	NA	NA	RP11-124N14.3	6025	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	17652629	17652974	17652802	Y	NA	PTPLA,STAM	NA	NA	NA	NA	PTPLA	4402	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	20203114	20203263	20203197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL5B	1256780	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	20249117	20249390	20249254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	1211726	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	20841595	20841995	20841796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	619121	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr10	21241912	21242237	21242078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	218879	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr10	21275860	21276132	21275996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	184984	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	21333319	21333508	21333415	Y	NEBL,C10orf113	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	127608	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr10	21389618	21389984	21389801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	71132	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	21430870	21431276	21431139	Y	NEBL,C10orf113	NEBL	NA	NA	NA	NA	NEBL	29840	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	21570991	21571411	21571151	Y	NA	NA	C10orf114,MLLT10,DNAJC1,C10orf140,PIP4K2A,NEBL	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-275N1.1	88468	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	21581688	21582509	21582285	Y	NA	NA	C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-275N1.1	77370	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr10	22519481	22519667	22519580	Y	BMI1,EBLN1	NA	COMMD3-BMI1,PIP4K2A,ARMC3,DNAJC1,LOC100499489	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COMMD3	83236	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	22629825	22629981	22629966	Y	DNAJC1	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	21685	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	22932460	22932672	22932594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	68812	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr10	31025766	31026097	31025992	Y	NA	NA	ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1,KIF5B,ZNF438	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	292769	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr10	32218329	32218518	32218508	Y	NA	ARHGAP12	NA	NA	NA	NA	ARHGAP12	2587	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	RP11-462L8.1,ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr10	33272272	33272613	33272373	Y	ITGB1,ITGB1,ITGB1	RP11-462L8.1,ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	20107	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr10	33415871	33415993	33415948	Y	NA	NA	ITGB1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	123151	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	33422989	33423776	33423207	Y	NA	NA	ITGB1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	130269	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr10	33432348	33432470	33432409	Y	NA	NA	NRP1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	139628	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	33797044	33797241	33797114	Y	NA	NA	PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	NRP1	173854	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	33798158	33798349	33798267	Y	NA	NA	PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	NRP1	174968	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr10	35431185	35431238	35431212	Y	NA	CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	17466	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	35755393	35755512	35755453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	221440	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	43936251	43936518	43936384	Y	NA	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-517P14.2	22065	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	48323344	48323752	48323648	Y	NA	RP11-463P17.1,ZNF488	SYT15,GPRIN2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-463P17.1	6445	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr10	51039519	51039692	51039605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OGDHL	71094	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	52037840	52038115	52037944	Y	SGMS1	DYNC1I2P1	SGMS1	IMR90	Hi-C	24141950	DYNC1I2P1	15102	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	52261858	52262194	52262143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	120729	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	53930569	53930919	53930744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKK1	141137	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	54422889	54423026	54422939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKK1	350833	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	60422217	60422354	60422286	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICC1	151317	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	61645173	61645419	61645305	Y	NA	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	18995	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	63658924	63659147	63659031	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	RTKN2	367319	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	63698832	63699053	63698915	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	RTKN2	327413	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	63823957	63824187	63824054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTKN2	202279	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	65097775	65098183	65098051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	86874	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	65930110	65930546	65930307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	269105	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	66085994	66086251	66086123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	424989	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	SIRT1	33037	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	70782889	70783013	70782952	Y	NA	KIAA1279	NA	NA	NA	NA	KIAA1279	36402	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	70821151	70821852	70821361	Y	DDX21,VPS26A,SRGN	SRGN	KIAA1279,DDX21,SRGN,VPS26A,SUPV3L1	IMR90	Hi-C	24141950	SRGN	24010	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr10	70853829	70854114	70853839	Y	NA	SRGN,VPS26A	NA	NA	NA	NA	SRGN	7967	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	71626507	71626840	71626632	Y	COL13A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL13A1	66863	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr10	71657953	71658245	71658099	Y	H2AFY2	NA	NA	NA	NA	NA	COL13A1	98309	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	71662112	71662205	71662157	Y	H2AFY2	NA	NA	NA	NA	NA	COL13A1	102468	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr10	71693212	71693346	71693279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFY2	117206	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr10	71840822	71841222	71841056	Y	NA	H2AFY2,AIFM2	NA	NA	NA	NA	H2AFY2	30270	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	72027304	72027694	72027415	Y	NA	PPA1	NA	NA	NA	NA	PPA1	35637	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	72416244	72416577	72416419	Y	ADAMTS14	ADAMTS14	ADAMTS14,PRF1,KIAA1274,C10orf27,SGPL1,PCBD1	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS14	13982	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	72593001	72593337	72593129	Y	SGPL1	RP11-399N22.3,SGPL1	NA	NA	NA	NA	SGPL1	19284	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr10	72609400	72609769	72609596	Y	NA	SGPL1,PCBD1	NA	NA	NA	NA	SGPL1	35683	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.84216874263356
chr10	73526896	73527242	73527133	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	4013	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	73528339	73528873	73528813	Y	CDH23,SPOCK2,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	2382	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	73568339	73568950	73568859	Y	NA	C10orf54,PSAP	NA	NA	NA	NA	C10orf54	37084	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	73620184	73620641	73620392	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PSAP	11058	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	73986513	73986881	73986533	Y	C10orf105,C10orf54,CDH23,CDH23	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	ASCC1	11621	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr10	74079380	74080359	74079580	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	32629	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	74080430	74080993	74080646	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	31995	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	74091361	74091474	74091418	Y	SPOCK2,DDIT4,DNAJB12	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	21514	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	74765472	74765512	74765492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	P4HA1	89220	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	74990824	74990933	74990931	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	DNAJC9	15687	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	75253773	75253975	75253905	Y	NA	RP11-137L10.6	NA	NA	NA	NA	PPP3CB	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	75666465	75666800	75666554	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G,PLAU	NA	NA	NA	NA	PLAU	135	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr10	75805462	75805520	75805491	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	49590	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	78753303	78753527	78753361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	642826	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	78974815	78975138	78974939	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	421215	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	79265772	79266169	79265902	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	130184	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr10	79324798	79325050	79324993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	71303	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	79670022	79670276	79670149	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	14102	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	80015725	80016226	80016048	Y	RPS24	NA	NA	NA	NA	NA	RPS24	224207	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	80734291	80734943	80734463	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	91849	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr10	80737664	80737999	80737882	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	88793	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	80911539	80911799	80911619	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	84747	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr10	82215085	82215437	82215324	Y	TSPAN14,SH2D4B	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	3163	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr10	82224459	82224735	82224582	Y	NA	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	12537	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	82257950	82258092	82258025	Y	NA	TSPAN14,RP11-137H2.4	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	35606	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	82258642	82258780	82258737	Y	TSPAN14	TSPAN14,RP11-137H2.4	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	34918	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr10	82288045	82288198	82288158	Y	TSPAN14,SH2D4B	RP11-137H2.4	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	5500	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	83712370	83712377	83712374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	1418672	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	88004394	88004782	88004588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRID1	119468	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	88160011	88160294	88160175	Y	NA	GRID1	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRID1	35761	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr10	88517208	88517667	88517486	Y	GLUD1,BMPR1A	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	2801	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	89519838	89520126	89519981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P1	55559	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	89896518	89896551	89896536	Y	NA	NA	PTEN,RNLS,KLLN	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380G5.3	193259	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	92921990	92922253	92922075	Y	HECTD2	NA	ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCGF5	55655	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr10	95200243	95200778	95200520	Y	CYP26C1,MYOF	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	39296	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	95218561	95218998	95218660	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	21076	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.74440624473826
chr10	95228207	95228553	95228471	Y	MYOF,CEP55,CEP55	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	11521	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	6.31213436289799
chr10	96943397	96943661	96943560	Y	SORBS1,SORBS1	NA	C10orf129,SORBS1	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM1	105120	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr10	97020432	97020603	97020519	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	28178	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	97026412	97026787	97026670	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	21994	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr10	97054774	97055369	97055126	Y	ENTPD1,PDLIM1	PDLIM1	PDLIM1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PDLIM1	5993	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	97148349	97148600	97148588	Y	NA	NA	PDLIM1	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM1	99568	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	97218383	97218641	97218563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SORBS1	100530	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr10	99174702	99174858	99174830	Y	ZFYVE27,PI4K2A,RRP12	RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16	RRP12	K562	ChIA-PET	22265404	PGAM1	9059	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	100153138	100153356	100153248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPS1	51328	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	101170653	101170798	101170732	Y	SLC25A28	GOT1,RP11-441O15.3	NA	NA	NA	NA	GOT1	17583	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	101381465	101381554	101381515	Y	NA	SLC25A28,ENTPD7	NA	NA	NA	NA	SLC25A28	3099	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	101677861	101678026	101677917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNMBP	89650	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr10	101765990	101766360	101766233	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	1316	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.74440624473826
chr10	101780024	101780319	101780173	Y	CUTC,WNT8B	DNMBP	DNMBP	MCF7	ChIA-PET	22265404	DNMBP	12348	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	101873975	101874319	101874110	Y	NA	NA	CPN1,ERLIN1,CHUK	IMR90	Hi-C	24141950	ERLIN1	71772	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	102284617	102284981	102284927	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1848	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	102488726	102488983	102488821	Y	NA	PAX2	PAX2	IMR90	Hi-C	24141950	PAX2	4377	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	5.21437186500269
chr10	102490299	102490653	102490523	Y	PAX2	PAX2	NA	NA	NA	NA	PAX2	2707	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	102490692	102490976	102490862	Y	NA	PAX2	NA	NA	NA	NA	PAX2	2384	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr10	102501164	102501306	102501235	Y	NA	PAX2	NA	NA	NA	NA	PAX2	7804	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	103124787	103125187	103124970	Y	NA	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12967	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr10	103514539	103514868	103514704	Y	NA	NPM3	NA	NA	NA	NA	NPM3	26302	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr10	104892620	104892981	104892840	Y	C10orf32,NT5C2	NA	NA	NA	NA	NA	NT5C2	58075	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	104903006	104903392	104903228	Y	C10orf32,NT5C2	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	47664	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	105208274	105208534	105208404	Y	NA	CALHM2	NA	NA	NA	NA	CALHM2	2126	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	105419490	105419843	105419666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	193458	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	105456300	105456542	105456434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	156759	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	106085298	106085504	106085412	Y	SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147	ITPRIP	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	10658	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	108990726	108990863	108990795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	2690448	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	112116359	112116685	112116467	Y	DUSP5,MXI1	NA	SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMNDC1	53650	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	112158460	112158738	112158533	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	95751	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	112186754	112186909	112186851	Y	SHOC2,DUSP5,BBIP1,BBIP1	NA	SMNDC1,DUSP5,SMC3	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	68687	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	112261043	112261328	112261185	Y	SHOC2,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	5447	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	112533972	112534336	112534061	Y	PDCD4	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD4	95229	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	112674359	112675211	112674854	Y	NA	PDCD4,BBIP1,SHOC2	NA	NA	NA	NA	BBIP1	1821	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	114531236	114531374	114531260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	176635	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	114709018	114709405	114709296	Y	TCF7L2	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	1009	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	114847181	114847492	114847280	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	139172	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	116080506	116080782	116080645	Y	AFAP1L2	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	81733	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	120632969	120633291	120633120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NANOS1	153937	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	121161203	121161864	121161442	Y	EIF3A	NA	NA	NA	NA	NA	RGS10	138356	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	123822805	123823045	123822957	Y	ATE1,DMBT1	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	76116	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	125047496	125047735	125047709	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BUB3	135703	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	126290018	126290347	126290264	Y	FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	RPS10P18	112871	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	126445536	126445891	126445571	Y	ZRANB1	FAM53B,METTL10,FAM175B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	14698	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	126749212	126749581	126749525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	98158	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	127858962	127859176	127859085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	275854	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	128258462	128258762	128258558	Y	NA	NA	FANK1,DHX32,ADAM12	IMR90	Hi-C	24141950	DOCK1	333216	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr10	128592998	128593177	128593088	Y	NA	DOCK1	NA	NA	NA	NA	DOCK1	1020	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	129721316	129721687	129721518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	200962	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	129742865	129742981	129742943	Y	NPS	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	179668	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	129789575	129789766	129789637	Y	PTPRE,PTPRE	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	132883	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr10	133879247	133879524	133879406	Y	NA	NA	BNIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STK32C	263827	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr10	135074691	135075148	135074934	Y	TUBGCP2,ADAM8	ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ZNF511	44831	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	268826	269269	268945	Y	TMEM80,TALDO1,SIGIRR,IRF7,IRF7,DEAF1,IFITM2,IFITM1,ATHL1	PSMD13,SIRT3,ATHL1,IFITM2,IFITM1	NA	NA	NA	NA	ATHL1	17866	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3,B4GALNT4	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	1053255	1053594	1053287	Y	NA	NA	MUC5B,MOB2,AP2A2	IMR90	Hi-C	24141950	AP2A2	130361	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	1147842	1148157	1148045	Y	NA	NA	MUC5B	MCF7	ChIA-PET	22265404	TOLLIP	180727	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	2913617	2913951	2913751	Y	NA	CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	SLC22A18	5000	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	2961841	2962060	2961969	Y	KCNQ1	SLC22A18,PHLDA2,NAP1L4	NA	NA	NA	NA	PHLDA2	13156	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	3443739	3443990	3443855	Y	NA	ZNF195	NA	NA	NA	NA	ZNF195	45291	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	6523174	6523531	6523244	Y	OR2D2	TRIM3,ARFIP2	NA	NA	NA	NA	ARFIP2	22508	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	8723535	8723638	8723587	Y	STK33	RPL27A	NA	NA	NA	NA	RPL27A	21577	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	9185386	9185638	9185566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND5A	99299	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	9422844	9423055	9422950	Y	NRIP3,IPO7	IPO7,SNORA23	NA	NA	NA	NA	IPO7	18675	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	9587499	9588027	9587720	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1	ZNF143,LOC644656	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WEE1	5201	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	9928220	9928312	9928249	Y	ADM	NA	SWAP70,LOC440028,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	SWAP70	244596	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	10323282	10323617	10323398	Y	NA	SBF2,RP11-351I24.1,ADM,AMPD3	NA	NA	NA	NA	RP11-351I24.1	31	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	10634601	10634999	10634904	Y	MRVI1,MRVI1,MRVI1	NA	NA	NA	NA	NA	RNF141	73824	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	10921943	10922208	10922068	Y	AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,EIF4G2,ZBED5	ZBED5,CTD-2003C8.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2003C8.2	3074	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	11998818	11999068	11999003	Y	MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-631K18.5	107370	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	12101706	12102070	12101803	Y	DKK3,DKK3,PARVA,MICALCL,MICAL2	RP13-631K18.5,MICAL2	MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	RP13-631K18.5	4368	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr11	12109558	12109847	12109697	Y	PARVA,MICALCL,MICAL2	RP13-631K18.5,MICAL2	MICAL2,TEAD1,MICALCL,DKK3,USP47	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP13-631K18.5	3120	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	12133218	12133350	12133292	Y	MICAL2	RP13-631K18.5,MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	19675	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	12180569	12180722	12180645	Y	MICAL2	NA	MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	67026	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	12181262	12181458	12181363	Y	MICALCL,MICAL2	NA	MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	67719	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	12184848	12185162	12185016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	71305	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	12186762	12187077	12186920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	73219	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	12188567	12188982	12188726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	75024	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr11	12197316	12197738	12197633	Y	MICAL2,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	83773	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	12204138	12204505	12204342	Y	MICAL2,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	90595	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	12204570	12205016	12204699	Y	MICAL2	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	91027	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr11	12309352	12309734	12309588	Y	TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	86998	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	12824175	12824668	12824395	Y	TEAD1	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	130206	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	13238046	13238305	13238120	Y	NA	NA	ARNTL,BTBD10,LOC100506305	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	57894	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	13327996	13328024	13328011	Y	NA	ARNTL	NA	NA	NA	NA	ARNTL	31797	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	16625688	16626709	16626131	Y	SOX6,SOX6	C11orf58	SOX6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C11orf58	5970	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	18426412	18426598	18426470	Y	NA	LDHA,AC084117.3	NA	NA	NA	NA	AC084117.3	1256	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	18546072	18546398	18546234	Y	SPTY2D1,TSG101	RP11-613F22.5,TSG101	NA	NA	NA	NA	TSG101	381	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	19649981	19650160	19650072	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	279710	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	19701731	19702025	19701818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	331460	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	19736892	19737150	19737126	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	366621	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	19957110	19957424	19957380	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	425807	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr11	27481800	27481840	27481820	Y	NA	LIN7C	NA	NA	NA	NA	LIN7C	44480	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	27956455	27956618	27956527	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	RP11-1033A18.1	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1033A18.1	45875	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	28128920	28129110	28128941	Y	METTL15	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	1065	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	33074022	33074030	33074026	Y	NA	DEPDC7,TCP11L1	NA	NA	NA	NA	TCP11L1	15059	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	33708893	33709097	33708996	Y	NA	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	46894	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	33711808	33712191	33712002	Y	CD59	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	43800	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	33713598	33714029	33713919	Y	CD59	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	41962	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	33742880	33743486	33743237	Y	NA	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	12505	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	34356172	34356320	34356246	Y	NA	RP1-145M24.1,ABTB2	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	622	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	34393112	34393337	34393189	Y	ABTB2	RP1-145M24.1,ABTB2	ABTB2,ELF5,NAT10,CAT	IMR90	Hi-C	24141950	ABTB2	15557	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	34675579	34675977	34675664	Y	ABTB2,CD44	NA	NA	NA	NA	NA	CAT	217107	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	35103874	35105511	35104330	Y	CD44	NA	CD44,PDHX,APIP,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	52906	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr11	35187357	35188072	35187739	Y	NA	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	28940	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	35257615	35257771	35257693	Y	CD44	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	99198	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	36211739	36211961	36211850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD9	97038	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	36521882	36522155	36522112	Y	NA	TRAF6	NA	NA	NA	NA	TRAF6	7667	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	40350817	40351004	40350911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124G5.1	1206980	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	41521921	41522321	41522121	Y	NA	RP11-124G5.1	NA	NA	NA	NA	RP11-124G5.1	35663	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	44123492	44123510	44123502	Y	NA	ACCS,EXT2	NA	NA	NA	NA	EXT2	8393	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	44590064	44591217	44590888	Y	CD82	CD82	NA	NA	NA	NA	CD82	6087	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	231118	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	46534596	46534834	46534715	Y	AMBRA1	NA	NA	NA	NA	NA	AMBRA1	78841	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	47844695	47845036	47844861	Y	NA	NUP160	NA	NA	NA	NA	NUP160	23071	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	48009293	48009653	48009420	Y	CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	9180	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	48077375	48077584	48077563	Y	FNBP4,PTPRJ	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	77262	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	57546018	57546724	57546105	Y	MED19,C11orf31	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	27303	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	59537612	59537828	59537719	Y	PATL1,STX3	MRPL16	NA	NA	NA	NA	MRPL16	38517	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	60753567	60754105	60753691	Y	SDHAF2,CD5,CD6	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM132A	63632	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	61565191	61565522	61565357	Y	NA	FEN1,TMEM258,FADS2,FADS1	NA	NA	NA	NA	FADS2	6739	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	62311446	62311797	62311501	Y	WDR74,STX5,NXF1,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	AHNAK	9910	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	62312037	62312397	62312245	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	AHNAK	9310	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	62320979	62321244	62321106	Y	NA	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	463	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr11	62321348	62321821	62321541	Y	NA	EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	63337722	63338129	63338119	Y	NA	PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	44226	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	63687620	63687907	63687858	Y	LGALS12,RCOR2	NAA40	NA	NA	NA	NA	NAA40	16524	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.29328749368591
chr11	65248969	65249218	65249208	Y	SNX32	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	FRMD8,SLC25A45,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	14015	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	65252951	65253044	65253026	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10189	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	65254949	65255610	65255242	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	7623	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr11	65256318	65257363	65256982	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612,POLA2,DPF2,SLC25A45,TIGD3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	5870	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.01884686921208
chr11	65259217	65259522	65259389	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3711	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr11	65259637	65259913	65259840	Y	SNX32,EFEMP2,DRAP1,C11orf68	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3320	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	65259930	65260851	65260542	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	2382	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	10.4287437300054
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	65537213	65537543	65537499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNASEH2C	50795	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.46996562026443
chr11	65670692	65670945	65670845	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	4648	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	65678943	65679154	65679019	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,CFL1,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,KLC2,FOSL1,SART1,DRAP1,C11orf68,BANF1	FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5434	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr11	65679250	65679576	65679373	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5012	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	10.4287437300054
chr11	65695608	65695878	65695746	Y	EHBP1L1,MAP3K11,RELA,DKFZp761E198	FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	DRAP1	10880	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	65782974	65783337	65783107	Y	FOSL1	BANF1,EIF1AD,CATSPER1,SF3B2	NA	NA	NA	NA	CATSPER1	8651	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr11	66659730	66659912	66659812	Y	CLCF1,RBM4	LRFN4	NA	NA	NA	NA	LRFN4	37612	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	67138852	67139479	67139267	Y	NA	POLD4,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.19552499579061
chr11	68121765	68121884	68121804	Y	ALDH3B1,C11orf24	LRP5	NA	NA	NA	NA	LRP5	43688	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	68238826	68238975	68238901	Y	TCIRG1,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,IGHMBP2,PPP6R3	PPP6R3	NA	NA	NA	NA	PPP6R3	12640	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	68273880	68274272	68274031	Y	NA	PPP6R3	NA	NA	NA	NA	PPP6R3	47694	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	69089155	69089700	69089444	Y	MRGPRD	MYEOV	CCND1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYEOV	29550	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	69182957	69183170	69183095	Y	ORAOV1,CCND1,MYEOV	NA	CCND1,MYEOV	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MYEOV	123352	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	69452524	69453230	69453220	Y	CCND1	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	625	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr11	69639961	69640299	69640038	Y	NA	NA	FGF3	K562	ChIA-PET	22265404	ORAOV1	151777	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	70079442	70079825	70079633	Y	ANO1,CTTN,FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1,ORAOV1,ANO1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FADD	32173	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	71650610	71650763	71650692	Y	NA	RP11-849H4.2,RNF121	NUMA1,IL18BP	IMR90	Hi-C	24141950	RNF121	12863	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	71769812	71769929	71769891	Y	NA	LRTOMT,NUMA1,LAMTOR1	NA	NA	NA	NA	LRTOMT	19453	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	72343411	72343720	72343689	Y	PDE2A	PDE2A	NA	NA	NA	NA	PDE2A	39915	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr11	72968455	72968625	72968568	Y	NA	ARHGEF17	P2RY6	MCF7	ChIA-PET	22265404	ARHGEF17	48709	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr11	73490470	73490918	73490608	Y	UCP2	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	5443	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	73860209	73860535	73860372	Y	C2CD3	PPME1,C2CD3	NA	NA	NA	NA	PPME1	19609	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	75946013	75946323	75946187	Y	NA	WNT11	C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WNT11	26233	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	76802149	76802401	76802277	Y	NA	CAPN5	NA	NA	NA	NA	CAPN5	26170	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	78000759	78000964	78000861	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	102891	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	78426480	78426845	78426663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	142561	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	82805889	82806270	82806080	Y	NA	RAB30	NA	NA	NA	NA	RAB30	24924	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	82918019	82918384	82918270	Y	PCF11,ANKRD42	ANKRD42,RP11-727A23.5,RP11-727A23.1	NA	NA	NA	NA	RP11-727A23.1	3663	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	85463912	85464270	85464111	Y	CREBZF,SYTL2,SYTL2,EED,SYTL2,SYTL2	NA	CCDC89	IMR90	Hi-C	24141950	SYTL2	55914	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	85521123	85521272	85521226	Y	SYTL2,SYTL2	SYTL2	NA	NA	NA	NA	SYTL2	939	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	86451588	86451883	86451813	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	48218	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	86454484	86454767	86454607	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	45334	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	90016507	90016673	90016590	Y	NA	RP11-121L10.3	NA	NA	NA	NA	RP11-121L10.3	2779	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	95610217	95610530	95610374	Y	NA	MTMR2	NA	NA	NA	NA	MTMR2	45949	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	95749380	95749532	95749413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR2	92901	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	95888064	95888524	95888506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	185820	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	95888692	95889856	95889448	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	184488	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	95976157	95976737	95976478	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	97607	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	95991442	95991675	95991614	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	82669	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	96006843	96007267	96007082	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	67077	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	96040167	96040456	96040282	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	33888	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr11	102216514	102216961	102216815	Y	TMEM123,BIRC3,BIRC2	BIRC3,BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC2	572	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	102297400	102297813	102297636	Y	BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123	TMEM123	BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM123	41302	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	103742967	103742991	103742981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-37O16.8	464582	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	103964860	103965229	103965142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-37O16.8	686475	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	107187292	107187599	107187573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWF19L2	138973	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	107986432	107986807	107986620	Y	NA	ACAT1	NA	NA	NA	NA	ACAT1	3436	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	108600247	108600616	108600285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX10	66495	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	111402540	111402739	111402658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIK2	68376	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	113945404	113945849	113945581	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	180660	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	114162155	114162496	114162247	Y	NA	NNMT	NA	NA	NA	NA	NNMT	35646	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr11	114162916	114163328	114163238	Y	NA	NNMT	NA	NA	NA	NA	NNMT	36407	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	115636671	115636982	115636754	Y	NA	NA	CADM1	IMR90	Hi-C	24141950	CADM1	262996	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	116857252	116857500	116857432	Y	SIK3	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	47267	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	116873672	116874047	116873840	Y	NA	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	30720	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	4.39104999158121
chr11	118800245	118800827	118800413	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5928	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	118806138	118806167	118806153	Y	NA	MIR4492,BCL9L	PHLDB1,TREH,DDX6,MIR4492,BCL9L,FOXR1,UPK2	IMR90	Hi-C	24141950	BCL9L	11821	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	120302835	120303154	120303088	Y	OAF,ARHGEF12	NA	NA	NA	NA	NA	GRIK4	77314	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	122596029	122596361	122596043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	71646	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	122888881	122889273	122889127	Y	NA	RPL34P23,SNORD14D,SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	RPL34P23	15302	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	123293400	123293723	123293427	Y	NA	NA	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	SCN3B	230229	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	124514246	124514548	124514258	Y	OR8G1,OR8D1,OR8D2,OR8B4,OR8B8,OR8B12,OR8A1	TBRG1,SPA17,SIAE	NA	NA	NA	NA	TBRG1	23514	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	124552795	124553089	124552942	Y	OR8B4,C11orf61	SPA17,SIAE	NA	NA	NA	NA	SIAE	10514	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	125033403	125033516	125033451	Y	NA	PKNOX2	NA	NA	NA	NA	PKNOX2	820	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	125904022	125904031	125904027	Y	NA	CDON	NA	NA	NA	NA	CDON	27199	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	126001132	126001515	126001324	Y	CDON	NA	CDON	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	69902	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	128366966	128367159	128367092	Y	ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	88294	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	128367325	128367539	128367441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	87914	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	129013172	129013631	129013445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	557719	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	129251937	129252027	129251992	Y	BARX2	NA	NA	NA	NA	NA	NFRKB	511458	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	130321179	130321606	130321259	Y	ADAMTS15	ADAMTS15	NA	NA	NA	NA	ADAMTS15	4310	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr11	131759058	131759559	131759199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	974654	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	131924772	131924995	131924886	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	1140368	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr11	134124453	134124658	134124640	Y	NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2	VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8	NA	NA	NA	NA	ACAD8	3064	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	298364	298488	298415	Y	IQSEC3	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC77	197951	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	1511133	1511360	1511261	Y	ERC1	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL14	189971	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	1698978	1699322	1699295	Y	NA	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	2009	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	2749982	2750016	2749999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP4	152103	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	3450642	3450947	3450795	Y	NA	NA	PRMT8,EFCAB4B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-543P15.1	131546	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	3563518	3563854	3563701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543P15.1	244422	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	4666420	4666590	4666540	Y	NA	C12orf4,RAD51AP1,DYRK4	NA	NA	NA	NA	DYRK4	2780	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	4845288	4845672	4845482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA9	89027	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	5915509	5915755	5915702	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	391126	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr12	6202352	6202551	6202452	Y	CD9,ANO2	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	104330	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	6325035	6325634	6325452	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	18154	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr12	6389072	6389528	6389363	Y	CD9,PLEKHG6,PLEKHG6	RP1-96H9.5	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP1-96H9.5	11481	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	6404239	6404667	6404531	Y	NA	RP1-96H9.5,TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-96H9.5	26648	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr12	6873427	6873901	6873603	Y	C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162	COPS7A,PTMS,MLF2	LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5	IMR90	Hi-C	24141950	MLF2	740	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	7034730	7034838	7034794	Y	ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	3104	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	36298	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr12	8136037	8136329	8136183	Y	NA	SLC2A3,FOXJ2	SLC2A3,FOXJ2	IMR90	Hi-C	24141950	FOXJ2	46970	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	9491229	9491519	9491373	Y	NA	NA	C12orf33,LOC144571	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTMAP4	100302	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	9912135	9912729	9912724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC2B	108006	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	9986583	9986922	9986755	Y	NA	CLEC2B	NA	NA	NA	NA	CLEC2B	33813	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	10869298	10869573	10869459	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGOHB	105076	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr12	11721730	11722060	11721927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	78728	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	11731456	11731873	11731547	Y	TAS2R43,TAS2R42	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	68915	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	11987514	11987811	11987531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	186726	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	11987992	11988316	11988087	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	187204	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	12164191	12164556	12164498	Y	NA	NA	ETV6,LOC338817,CDKN1B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-267J23.4	97541	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	12532834	12533375	12533099	Y	DUSP16,CDKN1B,APOLD1,BCL2L14,LOH12CR1	LOH12CR1	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	24821	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	12911881	12912260	12911941	Y	NA	CDKN1B	NA	NA	NA	NA	CDKN1B	45889	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	13025126	13025347	13025203	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	RPL13AP20	1086	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	13049170	13049423	13049295	Y	DUSP16	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	7454	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	13124934	13124993	13124963	Y	NA	RP11-392P7.6,HTR7P1,HEBP1	GPRC5D	IMR90	Hi-C	24141950	HTR7P1	25819	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	58675	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr12	13255105	13255488	13255167	Y	EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	59887	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	13357534	13357828	13357577	Y	NA	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	9884	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr12	13359236	13359687	13359415	Y	EMP1	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	11586	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr12	13376628	13377027	13376828	Y	NA	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	28978	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DERA	491593	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr12	16554253	16554721	16554664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DERA	492147	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	16970054	16970256	16970077	Y	LMO3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1018J11.1	169804	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	19566135	19566181	19566158	Y	NA	AEBP2,EEF1A1P4	NA	NA	NA	NA	AEBP2	11156	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	20543386	20543422	20543406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-146P	668017	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	20780077	20780376	20780084	Y	LST-3TM12,PDE3A	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	808173	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr12	20950319	20950359	20950339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	638190	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	20959036	20959191	20959158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	629358	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	20975224	20975562	20975349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	612987	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	50.497074903184
chr12	21059259	21059529	21059394	Y	SLCO1B3,LST-3TM12,SLCO1B1,SLCO1A2	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	529020	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	21666002	21666378	21666190	Y	NA	RECQL,GOLT1B	NA	NA	NA	NA	GOLT1B	13287	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	24819835	24820078	24819957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-662I13.1	298360	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	25402760	25403150	25403054	Y	LRMP,CASC1,KRAS	KRAS	NA	NA	NA	NA	KRAS	890	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137212	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	26267263	26267811	26267415	Y	NA	BHLHE41	NA	NA	NA	NA	BHLHE41	8249	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	26512613	26512980	26512754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE41	236553	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	26805266	26805775	26805502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPR2	178356	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	27484254	27484540	27484416	Y	FGFR1OP2,STK38L	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	467	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	27678444	27678624	27678473	Y	PPFIBP1	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	4080	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	27702695	27702969	27702865	Y	NA	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	28331	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.19552499579061
chr12	27746027	27746077	27746069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	71663	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	27748114	27748496	27748421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	73750	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	30945631	30945953	30945771	Y	NA	CAPRIN2,LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	24	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	31899631	31900083	31899901	Y	AMN1,H3F3C	AMN1,H3F3C	METTL20,AMN1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMN1	19523	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	31902136	31902566	31902240	Y	C12orf35,AMN1,H3F3C	AMN1,H3F3C	AMN1	K562	ChIA-PET	22265404	AMN1	22028	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	38493611	38493806	38493706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG10B	214574	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	41137156	41137542	41137225	Y	CNTN1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A13	639265	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	45626822	45627300	45627014	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	18998	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	45627812	45628672	45628351	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	19988	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	45820263	45820702	45820515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	212439	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	46786554	46786766	46786571	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	11092	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	46867492	46867759	46867536	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	92030	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	46888080	46888552	46888358	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	112618	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	46917975	46918280	46918143	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	142513	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr12	46918651	46918824	46918737	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	143189	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	47749691	47750629	47750307	Y	NA	NA	FAM113B,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RPAP3	347215	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	49594805	49595186	49594996	Y	NA	TUBA1C,TUBA1A	TUBA1A,TUBA1C,LMBR1L,DHH,TUBA1B	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TUBA1A	13698	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	49595765	49596022	49595888	Y	LMBR1L	TUBA1C,TUBA1A	TUBA1A,TUBA1B	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TUBA1A	14658	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr12	50460197	50460562	50460363	Y	NA	RACGAP1,SMARCD1	NA	NA	NA	NA	SMARCD1	16193	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	51536826	51537135	51537116	Y	CSRNP2	TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	27791	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	52241760	52242326	52241842	Y	SLC4A8,FIGNL2	NA	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ACVR1B	101125	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	52419301	52419935	52419633	Y	NR4A1,GRASP,NR4A1	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	4685	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	52426305	52426422	52426334	Y	NR4A1,GRASP,NR4A1	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11689	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr12	52542210	52542726	52542513	Y	KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	41058	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	52674043	52674518	52674247	Y	NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80	KRT81	NA	NA	NA	NA	KRT81	8800	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	52835077	52835369	52835228	Y	NA	NA	KRT75	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT81	151759	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	53339346	53339557	53339459	Y	EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1098	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	53340686	53341032	53340856	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	31	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	54012118	54012371	54012242	Y	PFDN5	ATF7,RP11-972K6.1	NA	NA	NA	NA	ATF7	5828	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	54133160	54133497	54133297	Y	ATF7,ATP5G2	CALCOCO1,SNORD81	ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5	IMR90	Hi-C	24141950	CALCOCO1	13631	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	54372759	54373189	54372957	Y	HOXC13,HOXC12,HOXC11,HOXC10	HOXC13,HOXC11,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1	NA	NA	NA	NA	HOXC10	3660	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	54400493	54400742	54400596	Y	HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC6,HOXC4	HOXC11,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC-AS1	8699	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	54411861	54412590	54411908	Y	COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4	HOXC11,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	12047	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	54563652	54563918	54563802	Y	NA	RP11-834C11.4,SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	16860	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	54746696	54746816	54746742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPZ1	53710	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	54777021	54777369	54777117	Y	NA	ITGA5	NA	NA	NA	NA	ITGA5	33875	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	55808460	55808880	55808766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL7B	264450	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	56877461	56877501	56877482	Y	NA	TIMELESS,SPRYD4,GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2	NA	NA	NA	NA	GLS2	2697	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	4.66549061605504
chr12	57079143	57079532	57079338	Y	NA	ATP5B,PTGES3,NACA	NA	NA	NA	NA	PTGES3	627	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	57402902	57402987	57402944	Y	NA	ZBTB39	NA	NA	NA	NA	ZBTB39	4672	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	58259163	58259391	58259220	Y	TSPAN31,CDK4,METTL21B,CTDSP2	CTDSP2	CTDSP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	CTDSP2	20641	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	58819259	58819609	58819396	Y	LRIG3,LRIG3	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	485935	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	59300729	59300915	59300862	Y	LRIG3,LRIG3	LRIG3	NA	NA	NA	NA	LRIG3	11388	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	62525889	62526278	62526197	Y	MON2,FAM19A2	NA	NA	NA	NA	NA	USP15	125841	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	62998747	62999127	62998791	Y	NA	RP11-631N16.2,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	3281	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	63051832	63051994	63051914	Y	MON2,PPM1H	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	56366	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	63118880	63119001	63118911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	123414	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	4.11660936710739
chr12	63124974	63125146	63125033	Y	C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	129508	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr12	63126917	63127025	63126971	Y	C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	131451	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr12	63149457	63149757	63149616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	153991	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	63177678	63177947	63177765	Y	C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1H	148870	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	63179567	63180349	63179723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1H	146468	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr12	63242425	63242574	63242486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1H	84243	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	63294376	63294638	63294612	Y	NA	PPM1H	NA	NA	NA	NA	PPM1H	32179	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	63740108	63740192	63740150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPY19L2	320527	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	64311746	64312216	64311964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	75673	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	64312639	64312950	64312683	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	76566	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	64349679	64350074	64349795	Y	TBK1	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	113606	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	65888975	65889352	65889198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-221N13.3	105297	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	4.66549061605504
chr12	65926688	65927190	65926918	Y	NA	NA	MSRB3,HMGA2,RPSAP52	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	67459	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	65930655	65931175	65930934	Y	HMGA2	NA	MSRB3,HMGA2,RPSAP52	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	63474	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.46996562026443
chr12	66004084	66004433	66004259	Y	NA	RP11-221N13.3,RP11-230G5.2	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	9435	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	66025227	66025796	66025503	Y	NA	RP11-221N13.3,RP11-230G5.2	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-230G5.2	8356	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	66042799	66043321	66043056	Y	NA	RP11-221N13.3,RP11-230G5.2	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-230G5.2	8647	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	66051570	66051762	66051716	Y	NA	RP11-230G5.2	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-230G5.2	17418	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	66135126	66135637	66135353	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	80274	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	66136008	66136292	66136116	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	79619	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr12	66216365	66216749	66216512	Y	HMGA2	HMGA2,RPSAP52	NA	NA	NA	NA	HMGA2	454	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	66237933	66238219	66238043	Y	HMGA2	HMGA2,RPSAP52	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	19179	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	66242690	66243107	66242729	Y	HMGA2	HMGA2,RPSAP52	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	23936	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	66285844	66286273	66285967	Y	IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-366L20.3	53986	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	66292016	66292293	66292025	Y	NA	RP11-366L20.3	NA	NA	NA	NA	RP11-366L20.3	47966	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	66311039	66311339	66311117	Y	HMGA2	RP11-366L20.3	NA	NA	NA	NA	RP11-366L20.3	28920	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	NA	NA	NA	NA	NA	HELB	65035	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr12	67404997	67405349	67405173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	55593	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	68705850	68706149	68706026	Y	IL22,SLC35E3,NUP107,MDM2,MDM1	MDM1	NA	NA	NA	NA	MDM1	18012	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr12	69150078	69150205	69150130	Y	NA	SLC35E3,MDM2	NA	NA	NA	NA	SLC35E3	12192	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	69163885	69164101	69163897	Y	SLC35E3	SLC35E3,MDM2	NA	NA	NA	NA	SLC35E3	25999	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	69227269	69227544	69227345	Y	SLC35E3	MDM2	NA	NA	NA	NA	MDM2	27313	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	75878955	75879237	75879096	Y	NA	GLIPR1,KRR1	NA	NA	NA	NA	GLIPR1	6495	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	76034915	76034997	76034960	Y	NA	NA	PHLDA1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	131499	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	76337836	76338217	76338130	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PHLDA1	87495	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	76371613	76372127	76371872	Y	NA	NA	OSBPL8,PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	53585	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr12	76375899	76376264	76376114	Y	NA	PHLDA1	PHLDA1,KRR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PHLDA1	49448	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr12	76414095	76414311	76414227	Y	NA	PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	11401	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.46996562026443
chr12	76414369	76415079	76414685	Y	NA	PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	10633	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr12	77425555	77425931	77425698	Y	OSBPL8	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	31429	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr12	79817950	79818263	79818028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	264614	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	79941021	79941361	79941199	Y	PAWR	NA	SYT1,PAWR,PPP1R12A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAWR	141516	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	80098707	80098999	80098853	Y	NA	PAWR	SYT1,PPP1R12A,PAWR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAWR	15830	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	82468212	82468399	82468268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC59	282185	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	84902694	84902984	84902888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRIQ1	525108	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	86051841	86052071	86051956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRIQ1	623749	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	87859416	87859560	87859488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf29	566063	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	89747699	89748479	89748073	Y	NA	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	2651	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	90274602	90274800	90274694	Y	POC1B,ATP2B1	NA	LOC338758	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B1	173525	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	92052949	92053298	92053124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTG1	484375	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	BTG1	NA	NA	NA	NA	BTG1	19275	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	93277124	93277496	93277306	Y	NA	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	43611	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr12	93890331	93890756	93890540	Y	NA	MRPL42	NA	NA	NA	NA	MRPL42	31067	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	93949724	93949882	93949803	Y	NA	SOCS2	NA	NA	NA	NA	SOCS2	11708	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	93971019	93971312	93971141	Y	NA	SOCS2	NA	NA	NA	NA	SOCS2	9429	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	94678246	94678308	94678278	Y	PLXNC1,TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	138437	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	94773845	94774167	94774046	Y	PLXNC1,TMCC3	RBMS2P1	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	42578	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	95069867	95070333	95070014	Y	TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC41	218103	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	95404686	95404921	95404803	Y	NA	NDUFA12	NA	NA	NA	NA	NDUFA12	9140	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	95492031	95492186	95492111	Y	NA	NR2C1	NA	NA	NA	NA	NR2C1	26552	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	96589359	96589977	96589479	Y	LTA4H,ELK3	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	3199	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr12	96592675	96593197	96592888	Y	LTA4H,ELK3	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	6515	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	96593675	96593812	96593739	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	7515	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	96613519	96613922	96613765	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	27359	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr12	96627063	96627293	96627178	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	40903	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	96631530	96631765	96631742	Y	CDK17	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	45370	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	96649758	96650321	96650168	Y	ELK3,CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	63598	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	96664847	96665248	96665048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	78687	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	96685157	96685428	96685293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	98997	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	96819131	96819446	96819342	Y	NA	CDK17	CDK17,ELK3,LTA4H	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP11	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	96828064	96828263	96828182	Y	NEDD1,NEDD1,CDK17	CDK17,RN7SKP11	LTA4H,ELK3,CDK17	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP11	8800	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	96842223	96842407	96842329	Y	NA	CDK17,RN7SKP11	CDK17	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP11	22959	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	101412491	101412895	101412554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP20	258992	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	102009746	102010171	102009968	Y	MYBPC1	NA	NA	NA	NA	NA	CHPT1	78554	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	104199621	104199645	104199634	Y	NA	NT5DC3	NA	NA	NA	NA	NT5DC3	33330	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	104613868	104614024	104613970	Y	CHST11,TXNRD1,TXNRD1	TXNRD1,RPL18AP3	NA	NA	NA	NA	TXNRD1	6311	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	104693849	104694220	104693862	Y	NA	RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3	NA	NA	NA	NA	EID3	1297	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr12	104997803	104998291	104998125	Y	TXNRD1,TXNRD1,CHST11	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	150730	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	105020354	105020448	105020373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	173281	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	105042709	105042954	105042777	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	195636	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	105177272	105177383	105177327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC41A2	173139	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.46996562026443
chr12	107377522	107377900	107377585	Y	RFX4,RIC8B,MTERFD3	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	1044	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	108877904	108878160	108878033	Y	SSH1,SELPLG,SELPLG	FICD	NA	NA	NA	NA	FICD	28802	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	109036250	109036518	109036431	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISCU	81892	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	109058635	109058851	109058743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CORO1C	64521	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	109084686	109085066	109084867	Y	SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	38306	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	109116964	109117579	109117192	Y	SELPLG,SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	5793	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	109117977	109118365	109118310	Y	SELPLG,SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	5007	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	109167575	109167781	109167683	Y	NA	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	44203	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	109209396	109209677	109209591	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	39689	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	109232143	109232504	109232328	Y	FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	16862	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr12	109248007	109248657	109248411	Y	SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	709	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	109570576	109570747	109570637	Y	ACACB	ALKBH2,UNG,RP11-968O1.5	NA	NA	NA	NA	RP11-968O1.5	23553	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	109900309	109900503	109900403	Y	KCTD10	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	12704	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	109900993	109901418	109901152	Y	KCTD10	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	11789	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	111058916	111059261	111059089	Y	NA	PPTC7,TCTN1	NA	NA	NA	NA	TCTN1	9084	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	111867956	111868269	111868101	Y	BRAP,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	26204	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	111875686	111876044	111875771	Y	BRAP,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	33934	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	111904763	111905142	111904953	Y	ALDH2,ATXN2	NA	NA	NA	NA	NA	SH2B3	63011	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	112464061	112464211	112464136	Y	NA	TMEM116,ERP29	NA	NA	NA	NA	ERP29	14941	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	113652796	113652994	113652903	Y	OAS1,OAS3,OAS2,SLC24A6,SDSL,TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	TPCN1	3861	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	113667617	113667862	113667654	Y	DTX1,IQCD,TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	10718	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	116193913	116194329	116194111	Y	NA	NA	TBX3,RBM19	IMR90	Hi-C	24141950	MED13L	518814	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	116661909	116662288	116662266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	50855	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	116701070	116701373	116701314	Y	MAP1LC3B2,MED13L	MED13L	NA	NA	NA	NA	MED13L	11770	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	116864232	116864472	116864363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00173	104755	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr12	116872040	116872309	116872217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00173	96918	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr12	116893494	116893818	116893640	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	MED13L,LINC00173,MAP1LC3B2,MIR4472-2,C12orf49	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00173	75409	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	116946088	116946451	116946189	Y	MED13L,MAP1LC3B2	LINC00173	LINC00173,MED13L,MAP1LC3B2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00173	22776	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	116946674	116946880	116946778	Y	NA	LINC00173	LINC00173,MED13L,MAP1LC3B2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00173	22347	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	116958826	116959052	116958939	Y	MED13L,MAP1LC3B2	LINC00173	LINC00173,MED13L,MIR4472-2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00173	10175	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	118012695	118013095	118012896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO21	386359	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	118263351	118263381	118263366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSR2	141407	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	119632995	119633391	119633197	Y	TMEM233	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA38	308626	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr12	120426531	120426889	120426594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIT	113436	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	120668258	120668871	120668569	Y	RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	31164	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr12	120669025	120669761	120669334	Y	RAB35,RNF10,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	31813	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	120956227	120956384	120956265	Y	COQ5	RNF10,COQ5	NA	NA	NA	NA	RNF10	12899	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	121245538	121245859	121245790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACADS	84000	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	121310801	121311113	121311060	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	29061	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	121471797	121472025	121471886	Y	P2RX4,CAMKK2,OASL	C12orf43	NA	NA	NA	NA	C12orf43	19492	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	122067749	122067897	122067832	Y	ORAI1	ORAI1,MORN3	NA	NA	NA	NA	ORAI1	5294	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.74440624473826
chr12	123362987	123363145	123363088	Y	NA	HIP1R,VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	15846	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	125049011	125049349	125049112	Y	NA	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	786	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	721	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	125231951	125232267	125232149	Y	UBC	NA	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	132947	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	125425237	125425455	125425374	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	25323	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	125550830	125551017	125550923	Y	NA	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	2905	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	131272601	131272867	131272734	Y	NA	STX2	NA	NA	NA	NA	STX2	48944	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	132288640	132288996	132288940	Y	SFSWAP	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	21942	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	132861217	132861370	132861294	Y	P2RX2,GALNT9	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-977J11.2	188977	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr12	132903795	132904258	132904060	Y	GALNT9	NA	NA	NA	NA	NA	FBRSL1	159879	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr12	132904307	132904701	132904477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBRSL1	159436	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.84216874263356
chr12	133021534	133022956	133022670	Y	POLE,DDX51,FBRSL1	FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FBRSL1	41181	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	20271500	20271544	20271543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH8	65712	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	20644269	20644474	20644387	Y	ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2	NA	NA	NA	NA	NA	GJA3	88714	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	20693405	20693544	20693484	Y	CRYL1	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	39644	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	20694627	20695029	20694906	Y	PSPC1,ZMYM5	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	38159	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	20735697	20735843	20735813	Y	PSPC1,ZMYM5	GJA3,GJB2	NA	NA	NA	NA	GJA3	2509	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	22111458	22111566	22111512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC20	79949	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	24045316	24045716	24045516	Y	NA	SACS,LINC00327	NA	NA	NA	NA	LINC00327	6606	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	24080861	24081253	24081061	Y	NA	LINC00327	NA	NA	NA	NA	LINC00327	42151	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	24148254	24148621	24148289	Y	SGCG,TNFRSF19	TNFRSF19	NA	NA	NA	NA	TNFRSF19	5745	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr13	24722927	24723324	24723037	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIPEP	261369	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	25082319	25082682	25082572	Y	PARP4	PARP4	NA	NA	NA	NA	PARP4	2266	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	25880585	25880813	25880618	Y	MTMR6,NUPL1	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	NUPL1	6923	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	26760531	26760858	26760712	Y	WASF3	RNF6	WASF3,RNF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF6	33933	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr13	27166168	27166184	27166175	Y	GPR12,WASF3	WASF3	NA	NA	NA	NA	WASF3	36328	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	27843033	27843378	27843206	Y	NA	RPL21,SNORD102,RASL11A	NA	NA	NA	NA	RASL11A	569	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	27957593	27957812	27957644	Y	RASL11A,GTF3A	GTF3A	CDX2,GSX1	IMR90	Hi-C	24141950	GTF3A	38869	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	28006253	28006341	28006297	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	GTF3A	9572	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	28025291	28025563	28025486	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	2552	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	28540285	28540611	28540449	Y	LNX2,CDX2	PDX1,CDX2	NA	NA	NA	NA	CDX2	2665	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	29293854	29294204	29294003	Y	NA	SLC46A3	NA	NA	NA	NA	SLC46A3	2747	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	31483566	31483936	31483755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX5AP	175921	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	31775014	31775311	31775185	Y	HSPH1	HSPH1,B3GALTL	NA	NA	NA	NA	B3GALTL	2941	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	33781660	33782051	33781892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	140716	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	33858244	33858802	33858357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	63965	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	193675	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr13	34729958	34730262	34730146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	339772	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr13	40350825	40350889	40350868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG6	123061	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	41651625	41651882	41651685	Y	NA	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	ELF1	18049	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	42035432	42035829	42035442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	152091	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	42140186	42140232	42140209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	256845	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	42705100	42705257	42705170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	139032	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	43632661	43632965	43632672	Y	NA	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	37322	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr13	43656094	43656342	43656191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	60755	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	44542732	44543742	44543446	Y	SERP2	NA	SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC122	90905	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr13	44848357	44848873	44848719	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	SERP2,NUFIP1,TSC22D1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	300410	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr13	44880536	44881091	44880742	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,LACC1,SERP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	268192	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr13	45288309	45288506	45288432	Y	KCTD4	NA	NUFIP1,TSC22D1,TSC22D1-AS1,SERP2,LINC00330	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	139026	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	45711306	45711547	45711428	Y	NA	GTF2F2	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	18656	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	50217217	50217337	50217325	Y	SETDB2,SETDB2,PHF11,PHF11,ARL11	EBPL	NA	NA	NA	NA	EBPL	46274	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	50597476	50597810	50597661	Y	RCBTB1,TRIM13	TRIM13	NA	NA	NA	NA	TRIM13	29452	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	51167597	51167659	51167628	Y	RNASEH2B	NA	DLEU2,DLEU1,DLEU7	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	233698	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	51176389	51176436	51176413	Y	NA	NA	DLEU2,DLEU1,DLEU7	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	242490	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	51464273	51464487	51464380	Y	NA	RNASEH2B	DLEU2,GUCY1B2,DLEU1	IMR90	Hi-C	24141950	RNASEH2B	17327	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	52401506	52401752	52401566	Y	NA	DHRS12,RP11-327P2.5	NA	NA	NA	NA	RP11-327P2.5	25073	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	52956042	52956135	52956089	Y	NA	THSD1	NA	NA	NA	NA	THSD1	22494	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	53190916	53191040	53191000	Y	NA	HNRNPA1L2,MRPS31P4,SUGT1	NA	NA	NA	NA	MRPS31P4	1223	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	53765519	53765549	53765534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	540675	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	56150088	56150466	56150451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	2925244	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	60716670	60717071	60716778	Y	NA	DIAPH3	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	19050	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	60723538	60723946	60723707	Y	NA	DIAPH3	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	12175	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	74228674	74228703	74228690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	465009	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	74708897	74709334	74709161	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	2503	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr13	75574471	75574561	75574516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	479689	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	75939887	75940324	75940051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	113926	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	76906421	76906696	76906559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD12	551844	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	80510902	80511186	80511006	Y	NA	NA	SPRY2	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY2	401900	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr13	80810111	80810307	80810235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	102779	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	80916096	80916414	80916232	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3010	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr13	88345046	88345403	88345227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	3652671	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	91863944	91864030	91864005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	134044	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	93899040	93899272	93899121	Y	NA	GPC6	NA	NA	NA	NA	GPC6	21945	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	99128638	99129073	99128919	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	99121	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	99931812	99933023	99932107	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC2	80784	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	99963491	99964160	99963691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC2	112463	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	100013491	100013836	100013585	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	137835	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	100738422	100738621	100738542	Y	NA	PCCA	NA	NA	NA	NA	PCCA	648	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	101046682	101046918	101046816	Y	A2LD1	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P47	143610	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	107182699	107183083	107182911	Y	EFNB2	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	35429	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	108103235	108103615	108103559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM155A	413468	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	109808669	109809037	109808800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRS2	627878	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	109921804	109922211	109922051	Y	NA	NA	IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	514704	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr13	110426988	110427362	110427201	Y	NA	IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	9553	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	110669788	110670084	110669997	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	232873	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.74440624473826
chr13	114147699	114148153	114147800	Y	F7,F10,PROZ,GRTP1	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	TMCO3	4389	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr13	114830489	114831626	114831334	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	64460	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr13	114884280	114884926	114884814	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	11160	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr13	114894223	114894969	114894576	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	1117	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr13	114906463	114906564	114906535	Y	RASA3	RASA3	RASA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	RASA3	10377	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	20803011	20803143	20803077	Y	NA	TTC5,CCNB1IP1,PARP2,RPPH1	NA	NA	NA	NA	CCNB1IP1	3540	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr14	21540493	21540634	21540528	Y	RNASE6,TOX4,HNRNPC,ARHGEF40	ARHGEF40,ZNF219	NA	NA	NA	NA	ARHGEF40	4064	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	21564675	21565076	21564876	Y	NA	ARHGEF40,ZNF219	NA	NA	NA	NA	ZNF219	5805	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	21684818	21685080	21685024	Y	OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	50573	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	23293879	23294567	23294288	Y	RBM23,C14orf119,SLC7A7,SLC7A7	MRPL52,MMP14,LRP10	REM2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MRPL52	2521	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr14	23307440	23308274	23307581	Y	SLC7A8,PSMB5,PSMB5,LRP10,MRPL52,MMP14	MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	MMP14	3674	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	23320228	23321035	23320800	Y	RBM23,C14orf119,ACIN1,SLC7A7,SLC7A7	MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	MMP14	16462	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr14	24454112	24454320	24454216	Y	DHRS4L2,DHRS4L2	DHRS4,DHRS4L2	NA	NA	NA	NA	DHRS4L2	16964	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	24861663	24861718	24861669	Y	IPO4,RABGGTA,RABGGTA	NFATC4,NYNRIN,KHNYN,SDR39U1	NA	NA	NA	NA	NYNRIN	4274	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	24894575	24894716	24894646	Y	PSME1,IRF9,TINF2,KHNYN	NYNRIN,KHNYN,SDR39U1	NA	NA	NA	NA	KHNYN	1776	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	27595143	27595156	27595150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26P3	1361960	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	27631441	27631502	27631472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26P3	1325614	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	31905446	31905450	31905448	Y	NA	HEATR5A,RP11-176H8.1	NA	NA	NA	NA	HEATR5A	17658	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	32800518	32800728	32800582	Y	AKAP6	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	151278	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr14	35090811	35090907	35090859	Y	NA	SNX6	NA	NA	NA	NA	SNX6	6482	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	35767605	35767844	35767749	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,NFKBIA,PSMA6	PSMA6	NA	NA	NA	NA	PSMA6	21766	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	37785804	37785829	37785809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPOL1	120686	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	39637578	39637824	39637713	Y	NA	PNN	NA	NA	NA	NA	TRAPPC6B	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	48109739	48110114	48110083	Y	MDGA2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL13AP2	441432	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	50439731	50439867	50439806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	66080	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	50467375	50468846	50468075	Y	RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D	RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	37101	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr14	50475850	50475934	50475889	Y	ARF6,C14orf182	RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	30013	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	50526790	50527127	50527082	Y	RPL36AL,ARF6,C14orf182	RP11-58E21.3	ARF6,C14orf182	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-58E21.3	20843	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	50562564	50562863	50562716	Y	RPL36AL,DNAAF2,NEMF,ARF6,ATP5S,C14orf182,METTL21D	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	56617	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr14	52110768	52111053	52110947	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	156950	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	52119936	52120349	52120008	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	166118	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	52163680	52163849	52163765	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	209862	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	53361596	53362059	53361840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FERMT2	55094	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	53416335	53416646	53416599	Y	GPR137C	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	507	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	54465835	54466164	54465918	Y	NA	BMP4	NA	NA	NA	NA	BMP4	42356	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	54573774	54574066	54573953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP4	150295	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr14	55115744	55116109	55115959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	83929	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr14	55120784	55121076	55120951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	88969	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr14	55144129	55144414	55144262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	112314	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	55152891	55153126	55153104	Y	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	121076	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	55173516	55173842	55173679	Y	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	141701	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr14	55240829	55240954	55240892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCH1	126616	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	55439267	55439511	55439438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDHD1	52312	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	55765939	55766288	55766115	Y	GCH1	FBXO34,RP11-665C16.6	NA	NA	NA	NA	RP11-665C16.6	29146	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr14	58748134	58748542	58748422	Y	ARID4A	PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A	NA	NA	NA	NA	RP11-349A22.5	14310	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr14	61108188	61108290	61108236	Y	NA	SIX1	NA	NA	NA	NA	SIX1	14687	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	61456427	61456721	61456474	Y	SLC38A6	SLC38A6,TRMT5	NA	NA	NA	NA	TRMT5	10351	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	61570265	61570959	61570637	Y	SLC38A6	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCH	81318	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	61571196	61571403	61571326	Y	SLC38A6	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCH	80874	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	61822624	61823005	61822699	Y	PRKCH	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCH	170347	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	61938268	61939375	61939158	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	95883	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	62058743	62058958	62058799	Y	HIF1A	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	23485	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	63829601	63829975	63829789	Y	WDR89,PPP2R5E,KCNH5,GPHB5	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5E	178117	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	64320785	64320937	64320842	Y	PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	3102	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	65231601	65231863	65231701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	62781	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr14	65273271	65273625	65273457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTB	70976	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	65525721	65526064	65525893	Y	NA	MAX	NA	NA	NA	NA	MAX	41349	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	65746592	65747003	65746788	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	FUT8	128307	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	66104549	66104610	66104580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	229239	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	66126309	66126626	66126333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	250999	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr14	67774949	67775062	67775003	Y	PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	49652	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	68555905	68556402	68556038	Y	PIGH	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	271409	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	68604521	68604895	68604639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	282018	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr14	68717033	68717146	68717097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	169767	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	69148442	69148779	69148611	Y	NA	CTD-2325P2.3	RAD51B,ZFP36L1	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2325P2.3	1503	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	69155852	69156106	69155979	Y	NA	CTD-2325P2.3	RAD51B,ZFP36L1	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2325P2.3	5570	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr14	69159987	69160257	69160134	Y	NA	CTD-2325P2.3	ZFP36L1,RAD51B	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2325P2.3	9705	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	69162018	69162337	69162187	Y	NA	CTD-2325P2.3	ZFP36L1,RAD51B	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2325P2.3	11736	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr14	69246726	69246992	69246942	Y	DCAF5	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	14198	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr14	69247587	69247770	69247677	Y	DCAF5,ZFP36L1	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	13420	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr14	69248827	69249033	69248912	Y	DCAF5	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	12157	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr14	69251306	69251504	69251405	Y	NA	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	9686	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	69252204	69252483	69252314	Y	NA	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	8707	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr14	69417780	69418181	69417964	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	25976	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	69851262	69851639	69851451	Y	NA	SLC39A9,ERH	NA	NA	NA	NA	SLC39A9	11093	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	70183177	70183631	70183340	Y	KIAA0247,SRSF5,SRSF5	SRSF5	NA	NA	NA	NA	SRSF5	7986	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	71797093	71797681	71797289	Y	PCNX	SIPA1L1	SIPA1L1,LOC145474	IMR90	Hi-C	24141950	SIPA1L1	11927	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr14	73131912	73132517	73132075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPF3	226292	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	74741846	74742137	74741995	Y	FCF1	ABCD4	NA	NA	NA	NA	ABCD4	25622	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	75033495	75033781	75033700	Y	NA	CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2207P18.2	47569	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	75038441	75039020	75038725	Y	NPC2,DLST	CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2207P18.2	42330	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr14	75040596	75041021	75040862	Y	LTBP2	CTD-2207P18.2	ISCA2,NPC2	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2207P18.2	40329	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr14	75041346	75041756	75041610	Y	NPC2	CTD-2207P18.2	ISCA2,NPC2	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2207P18.2	39594	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	75063394	75063798	75063525	Y	NPC2,LTBP2	CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2207P18.2	17552	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	75084188	75084360	75084254	Y	PGF,EIF2B2	CTD-2207P18.2	LTBP2,KIAA0317,FCF1,YLPM1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CTD-2207P18.2	2838	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	75086409	75086922	75086553	Y	PGF	CTD-2207P18.2	LTBP2,KIAA0317,FCF1,YLPM1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CTD-2207P18.2	5059	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	75087327	75087770	75087539	Y	PGF,EIF2B2,LTBP2	CTD-2207P18.2	YLPM1,NPC2,ISCA2,LTBP2,KIAA0317,FCF1	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2207P18.2	5977	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	76032638	76033032	76032887	Y	FOS,BATF,FLVCR2	FLVCR2,RP11-507E23.1	NA	NA	NA	NA	FLVCR2	9928	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	76076330	76076878	76076479	Y	BATF,FLVCR2,FLVCR2	FLVCR2,RP11-507E23.1,TTLL5,C14orf1	NA	NA	NA	NA	RP11-507E23.1	15781	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	76234838	76235006	76234846	Y	NA	NA	TGFB3,IFT43	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf1	109306	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	76843326	76843356	76843341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESRRB	68369	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	77422240	77422571	77422458	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.1	IRF2BPL,KIAA1737	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.1	10455	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	77431067	77431579	77431238	Y	NA	RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.1	1447	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr14	77591216	77591790	77591612	Y	TMED8,NGB	ZDHHC22	NA	NA	NA	NA	ZDHHC22	15287	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	78129695	78129950	78129826	Y	NA	SPTLC2,ALKBH1,SLIRP	NA	NA	NA	NA	ALKBH1	42413	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	78790799	78791229	78791102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCK1	526373	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	SNORA79,DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	88884161	88884478	88884321	Y	NA	SPATA7	NA	NA	NA	NA	SPATA7	34893	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	89669833	89670012	89669951	Y	FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	85926	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	91511263	91511534	91511399	Y	NA	C14orf159,RPS6KA5	NA	NA	NA	NA	C14orf159	13143	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	91528012	91528136	91528074	Y	SMEK1,CCDC88C,RPS6KA5	C14orf159,RPS6KA5	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	3032	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	91683304	91683542	91683359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	158324	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	91752749	91752962	91752855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	129226	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr14	91833483	91833974	91833648	Y	RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C	CCDC88C	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	48214	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr14	91926776	91927002	91926960	Y	NA	CCDC88C,SMEK1	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	44588	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	92970203	92970533	92970302	Y	ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	RIN3	NA	NA	NA	NA	RIN3	7585	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr14	92997430	92998230	92997929	Y	ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	RIN3	NA	NA	NA	NA	RIN3	19312	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	95724003	95724377	95724190	Y	DICER1,DICER1,CLMN	NA	NA	NA	NA	NA	CLMN	59866	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	96086261	96086587	96086424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNHG10	87052	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	99073187	99073437	99073313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	871779	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	505578	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr14	99657940	99658586	99658223	Y	C14orf177,BCL11B	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	286630	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	100071651	100072022	100071781	Y	NA	CCDC85C	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	3288	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr14	100220531	100220629	100220588	Y	NA	EML1	CYP46A1,EML1	IMR90	Hi-C	24141950	EML1	18501	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	101155057	101155401	101155388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WARS	313915	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr14	101159258	101159870	101159708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WARS	318116	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.46996562026443
chr14	102415545	102415736	102415629	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13129	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	102746257	102746658	102746398	Y	NA	MOK,ZNF839	NA	NA	NA	NA	MOK	22879	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	17695	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr14	103726827	103727460	103727139	Y	MARK3,TRAF3,TNFAIP2,EIF5,EIF5	NA	EIF5,CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,LOC100131366	IMR90	Hi-C	24141950	EIF5	70421	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	INF2	NA	NA	NA	NA	INF2	8988	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr14	105327046	105327788	105327205	Y	NA	RPS26P49	NA	NA	NA	NA	RPS26P49	31538	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	105438668	105438757	105438725	Y	KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	AHNAK2	3937	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr14	105439556	105439771	105439692	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2923	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.74440624473826
chr14	105491233	105491512	105491453	Y	NA	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	5748	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr14	105554572	105554923	105554752	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,AHNAK2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	69087	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr14	105557924	105558306	105558075	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,JAG2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	72439	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	C14orf80	5167	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr15	29407243	29407640	29407337	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	NDNL2	152393	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	30022522	30022814	30022806	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-680F8.1	57328	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr15	32384266	32384605	32384436	Y	CHRNA7	NA	NA	NA	NA	NA	CHRNA7	63575	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	33148173	33148432	33148370	Y	GREM1	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	242828	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	33299476	33299841	33299744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	394131	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	34625973	34627107	34626354	Y	NA	SLC12A6,NOP10,LPCAT4	NA	NA	NA	NA	SLC12A6	1154	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	35361327	35361523	35361425	Y	NA	NA	ATPBD4,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	82839	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	35590731	35591134	35590845	Y	NA	NA	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	312243	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	36910960	36911073	36911017	Y	MEIS2,C15orf41	C15orf41	NA	NA	NA	NA	C15orf41	41148	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	37249666	37249815	37249741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1P1	141006	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	38820654	38820765	38820702	Y	NA	RASGRP1	NA	NA	NA	NA	RASGRP1	35011	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	39559889	39560120	39560079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THBS1	311160	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	40179429	40179904	40179805	Y	NA	GPR176,EIF2AK4	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR176	31189	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	40180090	40180249	40180216	Y	NA	GPR176,EIF2AK4	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR176	30844	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	40210900	40211252	40211013	Y	GPR176	EIF2AK4	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR176	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr15	41074954	41075332	41075143	Y	NA	GCHFR,ZFYVE19,DNAJC17	NA	NA	NA	NA	GCHFR	20736	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	41220555	41220912	41220794	Y	NUSAP1,DLL4	VPS18,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	22248	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr15	41233721	41234461	41233781	Y	C15orf57,VPS18	VPS18,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	8699	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	41581854	41582095	41581909	Y	NA	OIP5-AS1,OIP5,NUSAP1	NA	NA	NA	NA	OIP5-AS1	7666	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	MGA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	42496	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	42228791	42229215	42228969	Y	MGA,JMJD7,TMEM87A,EHD4	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	33561	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr15	42232566	42232958	42232887	Y	EHD4	EHD4	SPTBN5	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	29818	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr15	42236399	42236774	42236695	Y	NA	EHD4	SPTBN5	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	26002	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr15	43415014	43415563	43415337	Y	NA	UBR1,RPS3AP47,TMEM62	NA	NA	NA	NA	TMEM62	1537	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr15	44319631	44319819	44319725	Y	NA	ACTBP7	NA	NA	NA	NA	ACTBP7	39249	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	44431053	44431468	44431357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD5	53982	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	44837233	44837387	44837300	Y	CTDSPL2,PATL2	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	9978	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	44838663	44839045	44838853	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	11408	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	45340934	45341315	45341066	Y	SPG11,B2M,SPATA5L1	SORD	NA	NA	NA	NA	SORD	27632	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	50201915	50201939	50201930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A2	270454	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	52153526	52153874	52153708	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	33701	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr15	52349753	52350120	52349937	Y	NA	CTD-2184D3.1,CTD-2184D3.5	NA	NA	NA	NA	CTD-2184D3.1	35372	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	58884938	58885321	58885256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	154856	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	59023904	59024166	59024035	Y	RNF111	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	ADAM10	16011	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	59085961	59086460	59086218	Y	NA	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	FAM63B	24570	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	60836612	60836644	60836628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	67235	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	60861865	60862603	60862448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	92488	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr15	60874514	60874871	60874792	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	105137	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	60883059	60884017	60883872	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	113682	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr15	60937521	60937640	60937631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	168144	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	62207321	62207567	62207441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	143105	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	62683990	62684402	62684060	Y	NA	TLN2	TLN2,MGC15885	IMR90	Hi-C	24141950	TLN2	3265	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	63142999	63143362	63143082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-244F12.1	100010	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	63439577	63439949	63439764	Y	NA	LACTB,RPS27L,RAB8B	NA	NA	NA	NA	RPS27L	8271	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	64538820	64539298	64539122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIB	85416	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	64540216	64540468	64540344	Y	HERC1,ZNF609	NA	NA	NA	NA	NA	PPIB	86812	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr15	64601637	64601745	64601727	Y	NA	CSNK1G1	NA	NA	NA	NA	CSNK1G1	44697	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	65127928	65128208	65128016	Y	NA	PIF1,PLEKHO2	PIF1	K562	ChIA-PET	22265404	PLEKHO2	3880	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr15	67359902	67360303	67360058	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	5801	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	67373443	67373710	67373534	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	19342	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr15	67399103	67399775	67399548	Y	SMAD3	SMAD3,RP11-342M21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-342M21.2	37502	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr15	67440675	67441024	67440815	Y	SMAD3	RP11-342M21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-342M21.2	3398	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr15	67442347	67443164	67443030	Y	SMAD3	RP11-342M21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-342M21.2	5070	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr15	67488498	67488886	67488594	Y	SMAD3	RPS24P16	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	33898	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	67490281	67490446	67490307	Y	SMAD3	RPS24P16	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	32338	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	67516633	67516865	67516859	Y	NA	RPS24P16,IQCH,AAGAB	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	5919	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	68132387	68132778	68132514	Y	PIAS1	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	211739	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	68894151	68894553	68894360	Y	CORO2B,CORO2B,CORO2B	CORO2B	NA	NA	NA	NA	CORO2B	24843	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	70767457	70767783	70767604	Y	TLE3	NA	C15orf50,KIF23,LOC145837,TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	286149	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	70877631	70877741	70877691	Y	NA	NA	UACA	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	176191	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	71084406	71084742	71084644	Y	UACA,LARP6	UACA	UACA,LARP6,LRRC49	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	30474	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.46996562026443
chr15	71155799	71156069	71155993	Y	NA	LRRC49,LARP6,THAP10	NA	NA	NA	NA	LARP6	11301	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	71615809	71616164	71615988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	432685	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	72383313	72383702	72383619	Y	CELF6,SENP8,SENP8	SENP8,MYO9A	NA	NA	NA	NA	SENP8	20897	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	72518614	72519346	72519221	Y	ARIH1,PKM2	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9A	109696	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	72832767	72832969	72832868	Y	PKM2,CELF6,CELF6,ADPGK,ARIH1	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	68100	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	73926570	73926835	73926736	Y	PML	NPTN,CD276	C15orf60	IMR90	Hi-C	24141950	NPTN	2095	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	74226590	74227025	74226821	Y	NA	LOXL1	NA	NA	NA	NA	LOXL1	10260	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	74930641	74931010	74930809	Y	ARID3B,CSK	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	41800	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	75018665	75019349	75018947	Y	SCAMP2,C15orf39,CYP1A1	EDC3	NA	NA	NA	NA	EDC3	32032	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	75422284	75422708	75422389	Y	MAN2C1,CSK,C15orf39	NA	PPCDC,C15orf39,RPP25	IMR90	Hi-C	24141950	C15orf39	63276	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	75959061	75959441	75959310	Y	SNX33	SNUPN,SNX33,IMP3	NA	NA	NA	NA	IMP3	20014	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	77332766	77333147	77332913	Y	PSTPIP1	TSPAN3	NA	NA	NA	NA	TSPAN3	41179	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	78110975	78112297	78111796	Y	HMG20A,LINGO1,DNAJA4,ACSBG1	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	255769	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	78703506	78703610	78703558	Y	DNAJA4,DNAJA4,DNAJA4	IREB2	CIB2,WDR61,CRABP1,IDH3A,ACSBG1,DNAJA4,IREB2	IMR90	Hi-C	24141950	IREB2	24163	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	79280826	79281229	79281127	Y	CTSH	CTSH	NA	NA	NA	NA	CTSH	40910	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	79289232	79289594	79289505	Y	NA	CTSH	NA	NA	NA	NA	CTSH	49316	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr15	82156047	82156216	82156161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEX3B	180266	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	82339167	82339811	82339478	Y	MEX3B	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	2685	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	83954950	83955303	83955151	Y	BNC1	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD1	220844	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr15	85455479	85455863	85455740	Y	SLC28A1	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	65808	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	85458286	85458507	85458420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	63164	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	85645018	85645768	85645040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	123347	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	85861581	85861931	85861753	Y	PDE8A,AKAP13	NA	AKAP13	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP13	59871	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	85956762	85957097	85956878	Y	AKAP13,PDE8A	AKAP13	NA	NA	NA	NA	AKAP13	34960	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr15	85987048	85987479	85987219	Y	AKAP13,AKAP13	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	65246	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr15	86088256	86088945	86088625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	166454	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	86211201	86211615	86211423	Y	AKAP13,KLHL25	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	124646	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	86267591	86267810	86267701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	68451	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	89672226	89672631	89672291	Y	ABHD2	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	5095	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	89683953	89684135	89684061	Y	ABHD2	HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	6227	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	90223736	90224077	90223949	Y	NA	KIF7,PEX11A	NA	NA	NA	NA	PEX11A	7937	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	90441878	90442278	90442169	Y	C15orf38	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	6304	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	90944087	90944636	90944284	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	14637	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr15	91331328	91331736	91331526	Y	NA	CTD-3094K11.1	NA	NA	NA	NA	CTD-3094K11.1	49218	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	93344993	93345488	93345070	Y	CHD2	FAM174B	NA	NA	NA	NA	FAM174B	5626	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	12383	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	93520042	93520437	93520098	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	95516	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	93864881	93865242	93865107	Y	NA	RP11-266O8.1	NA	NA	NA	NA	RP11-266O8.1	11095	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr15	96867031	96867104	96867071	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2	63	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr15	96872860	96873000	96872921	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	MIR1469	1490	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	96884042	96884481	96884402	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	MIR1469	9552	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr15	96890448	96891058	96890571	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	4408	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	96895727	96895870	96895799	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	261	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr15	99270923	99271213	99270975	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	80723	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	99395486	99396002	99395689	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	205286	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	99409255	99409515	99409377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	219055	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	100651295	100651582	100651483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	379529	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr15	101261855	101262549	101262221	Y	NA	NA	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINS	120420	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr15	101481026	101481320	101481182	Y	LRRK1	LRRK1	NA	NA	NA	NA	LRRK1	23606	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	101783359	101783726	101783540	Y	CHSY1	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	6411	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr15	101986303	101986813	101986523	Y	CHSY1,TM2D3	NA	NA	NA	NA	NA	PCSK6	76592	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	121563	121849	121614	Y	TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	RHBDF1	2505	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr16	729341	729555	729445	Y	NA	C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,RHBDL1,STUB1,JMJD8,WDR24,FBXL16,METRN,FAM173A,HAGHL	NA	NA	NA	NA	STUB1	1117	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	1349375	1349723	1349678	Y	NA	UBE2I,BAIAP3	NA	NA	NA	NA	UBE2I	3825	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	1979729	1980160	1979842	Y	TSC2,MLST8,DNASE1L2,C16orf79,ABCA3,CCDC154,NME3,NUBP2,TBL3,RNF151	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3	NUBP2,FAHD1,IGFALS,C16orf73,HS3ST6,MAPK8IP3,SPSB3,EME2,NME3,MRPS34,HAGH,LINC00254	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB10	27349	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	2478608	2478672	2478640	Y	RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2	CCNF,C16orf59,TBC1D24	NA	NA	NA	NA	CCNF	1213	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	2557760	2557909	2557835	Y	SRRM2,PDPK1,CEMP1	C16orf59,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0C	3962	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	2885761	2886144	2885824	Y	NA	PRSS21,PRSS22,FLYWCH2	NA	NA	NA	NA	PRSS22	20027	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRSS22	11760	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1	NA	NA	NA	NA	TNFRSF12A	12221	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr16	4264073	4264474	4264297	Y	SRL	NA	NA	NA	NA	NA	TFAP4	56602	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr16	4343991	4344084	4344046	Y	NA	TFAP4	CREBBP,ADCY9,SRL,VASN,GLIS2,PAM16,CORO7-PAM16,TRAP1,TFAP4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	22915	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	4993356	4993730	4993477	Y	PPL	PPL	UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPL	15012	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	5666199	5666502	5666317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	520390	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	6353433	6353832	6353638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1207624	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	9171086	9171431	9171335	Y	C16orf72,USP7	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	12074	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	10965393	10965955	10965450	Y	NA	CIITA	NA	NA	NA	NA	CIITA	3100	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	11086769	11086952	11086818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	50424	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr16	11194136	11194543	11194329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMI2	146933	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr16	11284462	11284734	11284689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMI2	56742	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	11422424	11422652	11422552	Y	NA	NA	CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2,TXNDC11	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	74388	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	11591931	11591962	11591945	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136275	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	11960558	11960748	11960653	Y	NA	RSL1D1,GSPT1	ZC3H7A,RSL1D1,BCAR4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RSL1D1	17116	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	12008398	12008797	12008598	Y	NA	GSPT1	NA	NA	NA	NA	GSPT1	459	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr16	14423320	14423633	14423477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260142	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	14424623	14424858	14424825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	261445	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	14529113	14529156	14529135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	195429	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	15576237	15576428	15576343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf45	50085	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	15583408	15583655	15583541	Y	NDE1,C16orf45	NA	KIAA0430	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf45	57256	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr16	15684514	15685137	15684868	Y	NDE1,NDE1,KIAA0430	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	49886	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	15738027	15738375	15738313	Y	NA	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	2903	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	15766632	15767024	15766843	Y	KIAA0430,NDE1,NDE1	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	31508	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	17685725	17686159	17686027	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	122987	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	19222406	19222654	19222461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPRIPL2	99152	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	19714468	19714843	19714656	Y	NA	IQCK	NA	NA	NA	NA	IQCK	10935	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	21313038	21313456	21313158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM159	145340	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	21375136	21375337	21375232	Y	DNAH3,CRYM,METTL9	NA	NA	NA	NA	NA	SLC7A5P2	154349	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	21637887	21638686	21638408	Y	CRYM,METTL9,IGSF6	METTL9	NA	NA	NA	NA	METTL9	31348	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr16	22221382	22221539	22221458	Y	EEF2K	EEF2K	NA	NA	NA	NA	EEF2K	5779	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	22349127	22349159	22349143	Y	POLR3E	POLR3E	NA	NA	NA	NA	POLR3E	42397	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	23419986	23420351	23420270	Y	NA	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	42150	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	23518606	23518950	23518778	Y	GGA2	GGA2,UBFD1,EARS2	NA	NA	NA	NA	GGA2	12366	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	23531974	23532033	23532005	Y	NA	GGA2,UBFD1,EARS2	NA	NA	NA	NA	GGA2	658	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	26721789	26721801	26721795	Y	NA	NA	C16orf82	IMR90	Hi-C	24141950	NSMCE1	556314	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	27533512	27533805	27533694	Y	JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	25429	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	29702683	29703007	29702845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC7A5P1	79722	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	6.31213436289799
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	1336	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	31129616	31130225	31129940	Y	ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS	ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8	NA	NA	NA	NA	KAT8	4541	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	31888684	31889219	31888998	Y	ARMC5,ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	5605	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	48400459	48400723	48400564	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	79590	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	49316261	49316466	49316357	Y	CBLN1,C16orf78	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	664202	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr16	50679822	50680132	50679910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYLD	93829	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr16	51572702	51572897	51572800	Y	NA	NA	SALL1	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA1P48	104770	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	51761214	51761312	51761265	Y	NA	NA	SALL1	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA1P48	83547	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	53802432	53802770	53802659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	66557	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	56581201	56581558	56581471	Y	MT3,GNAO1,BBS2	BBS2	MT1X,MT4,MT1B,NUP93,MT2A,MT1IP,MT1G,MT1H,OGFOD1,BBS2,MT3,AMFR,NUDT21,MT1A,MT1DP	IMR90	Hi-C	24141950	BBS2	29006	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	56641054	56641530	56641359	Y	MT2A,MT1E	MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT2A	943	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr16	56644047	56644457	56644379	Y	NLRC5,HERPUD1	MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT2A	3936	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	56645516	56645845	56645554	Y	MT2A,MT1M,MT1E,MT1A	MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT1L	3543	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr16	56646552	56646712	56646632	Y	NA	MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT1L	2676	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	56813469	56813757	56813613	Y	NA	NA	MIR138-2	IMR90	Hi-C	24141950	NUP93	51452	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	57103047	57103214	57103125	Y	NLRC5	CPNE2	NA	NA	NA	NA	CPNE2	21235	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	NA	NA	NA	NA	NA	KATNB1	50262	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	7.13545623631947
chr16	57841964	57842337	57842236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIFC3	52620	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	59002662	59002836	59002667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOT2	236401	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	65020062	65020376	65020219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	137639	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	65036446	65036851	65036669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	121164	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	65103847	65103999	65103923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	54016	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	65105283	65105525	65105355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	52490	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	65153548	65154160	65153979	Y	CDH11	CDH11	NA	NA	NA	NA	CDH11	3855	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr16	66416297	66416567	66416426	Y	CDH5	LINC00920,BEAN1	NA	NA	NA	NA	LINC00920	23860	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	66416918	66416958	66416940	Y	NA	LINC00920,BEAN1	NA	NA	NA	NA	LINC00920	23469	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	66555983	66556387	66556198	Y	CKLF	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1	NA	NA	NA	NA	TK2	28060	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	66587187	66587393	66587288	Y	NA	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1,CMTM3	NA	NA	NA	NA	CKLF-CMTM1	2697	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr16	66960903	66961306	66961106	Y	PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD	FAM96B,CES2	NA	NA	NA	NA	FAM96B	5020	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	66988106	66988414	66988274	Y	NA	FAM96B,CES2	NA	NA	NA	NA	CES2	21759	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	67149596	67149757	67149715	Y	LRRC29,LRRC29,FAM65A,ATP6V0D1,C16orf70	C16orf70,B3GNT9,FBXL8,TRADD	NA	NA	NA	NA	C16orf70	7735	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	67435763	67435871	67435819	Y	NA	ZDHHC1	NA	NA	NA	NA	ZDHHC1	12865	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	67561753	67561884	67561820	Y	HSF4,SLC9A5,TPPP3,FAM65A	ATP6V0D1,FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	FAM65A	11432	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	PLA2G15	5331	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr16	69106233	69106613	69106351	Y	NA	HAS3,CHTF8	NA	NA	NA	NA	HAS3	30854	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	69345968	69346332	69346034	Y	NA	VPS4A,PDF,NIP7,COG8	NA	NA	NA	NA	VPS4A	2709	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	69432325	69432475	69432421	Y	TERF2	TERF2,CYB5B	NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TERF2	7999	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	69444205	69444538	69444372	Y	NA	TERF2,CYB5B	NFAT5,CYB5B,TERF2,COG8,NIP7,TMED6,MIR1538,NQO1,WWP2,NOB1	IMR90	Hi-C	24141950	TERF2	3731	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr16	69563572	69563696	69563627	Y	NA	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	33301	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	69564577	69564882	69564731	Y	WWP2	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	32115	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	4.39104999158121
chr16	70424558	70424975	70424714	Y	NA	DDX19A,ST3GAL2	NA	NA	NA	NA	DDX19A	45826	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	73159100	73159118	73159110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	67503	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	74353064	74353398	74353241	Y	FA2H	PSMD7,RP11-252A24.2	NA	NA	NA	NA	PSMD7	24391	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	74545615	74545910	74545763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLG1	93102	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	74701397	74701877	74701440	Y	RFWD3	RFWD3	NA	NA	NA	NA	RFWD3	2618	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr16	74702224	74702291	74702259	Y	NA	RFWD3	NA	NA	NA	NA	RFWD3	3445	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr16	74991657	74991945	74991906	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	ZNRF1	38983	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	76269107	76269317	76269211	Y	NA	RPL18P13	NA	NA	NA	NA	RPL18P13	1586	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	78908280	78908607	78908407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	776970	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	81026963	81027197	81027054	Y	NA	CENPN,ATMIN	NA	NA	NA	NA	CENPN	10906	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	81439497	81439896	81439576	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	36879	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr16	81666319	81666849	81666608	Y	PLCG2,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	103853	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	81693209	81693442	81693326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	77260	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	81701284	81701528	81701406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	69174	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	82397637	82397646	82397642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH6	195806	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	84633108	84633501	84633306	Y	ZDHHC7,KIAA0513,CRISPLD2,COTL1	COTL1,KLHL36	NA	NA	NA	NA	COTL1	16182	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	84676809	84677221	84677048	Y	KIAA1609	COTL1,KLHL36	KIAA1609,COTL1,USP10,KLHL36,ZDHHC7	IMR90	Hi-C	24141950	KLHL36	2910	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr16	84862837	84863219	84863017	Y	CRISPLD2	CRISPLD2	NA	NA	NA	NA	CRISPLD2	11247	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	85038009	85038299	85038256	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	4842	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr16	85586399	85586765	85586561	Y	KIAA0182,KIAA0182,GINS2	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134914	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr16	86541340	86541581	86541457	Y	FOXF1	MTHFSD	NA	NA	NA	NA	MTHFSD	45260	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	86587305	86587716	86587504	Y	NA	MTHFSD,FOXC2,FOXL1	NA	NA	NA	NA	MTHFSD	464	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	86985410	86985767	86985608	Y	FOXC2,FOXL1	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	377436	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr16	87072481	87072526	87072504	Y	NA	NA	FOXC2,FLJ30679,MTHFSD,FOXL1,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	MAP1LC3B	343075	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	87490621	87490719	87490682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO31	66873	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	87774219	87774566	87774531	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	23032	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	88701263	88701663	88701374	Y	SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZC3H18,CYBA	CYBA,MVD	NA	NA	NA	NA	CYBA	13897	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	88991704	88992157	88991819	Y	NA	NA	TRAPPC2L,GALNS	MCF7	ChIA-PET	22265404	GALNS	70326	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr16	89313669	89314138	89313993	Y	ZNF276,ZNF778	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	31551	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	89382399	89382987	89382651	Y	ZNF276,ZNF276,SPATA2L,C16orf7,ANKRD11	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	100281	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr16	89573610	89573931	89573734	Y	NA	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	18285	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr16	89579992	89580270	89580045	Y	ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7	ANKRD11,SPG7,RPL13	NA	NA	NA	NA	SPG7	24667	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	597415	597783	597745	Y	NA	RPS4XP17,VPS53,FAM57A	NA	NA	NA	NA	VPS53	25174	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	773525	773702	773655	Y	RNMTL1	NA	NA	NA	NA	NA	GLOD4	89944	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr17	872261	872610	872409	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	8400	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	881410	881576	881449	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	400	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr17	881812	881896	881869	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	802	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	932596	932954	932809	Y	NA	TIMM22	NXN	IMR90	Hi-C	24141950	TIMM22	34239	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	1014015	1014933	1014151	Y	PITPNA,CRK,ABR	NA	NA	NA	NA	NA	ABR	115382	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	1390195	1390341	1390268	Y	MYO1C,MYO1C,MYO1C	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	3765	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.19552499579061
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	1241	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.01884686921208
chr17	2040718	2040966	2040824	Y	PAFAH1B1,SCARF1,WDR81	NA	NA	NA	NA	NA	HIC1	85270	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr17	3453416	3453706	3453615	Y	OR1G1,OR1A2,OR1A1,OR1E2,TRPV3	NA	NA	NA	NA	NA	SHPK	83910	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	4205148	4205753	4205440	Y	P2RX1,ATP2A3,ZZEF1,ZMYND15,ZMYND15,SMTNL2,SMTNL2,ARRB2,UBE2G1	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39874	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	6655808	6656203	6655969	Y	RNASEK,GABARAP,XAF1	SLC13A5,XAF1	XAF1,MIR4520A,ALOX15P1,MIR4520B,MED31,C17orf100,FBXO39,TEKT1	IMR90	Hi-C	24141950	XAF1	563	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	6656419	6656747	6656461	Y	RNASEK,GABARAP,XAF1	SLC13A5,XAF1	NA	NA	NA	NA	XAF1	19	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	6660646	6660876	6660666	Y	NA	SLC13A5,XAF1	NA	NA	NA	NA	XAF1	3880	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	6790647	6790875	6790776	Y	SLC16A11,DLG4,DLG4	NA	NA	NA	NA	NA	AC027763.2	122793	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	7380968	7381115	7381038	Y	EIF5A	TMEM102,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	ZBTB4	4467	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	7389589	7389989	7389739	Y	C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A	CHRNB1,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	POLR2A	3904	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	7456067	7456382	7456285	Y	ACAP1,WRAP53,CD68,CD68,TNFSF12	TNFSF12,TNFSF12-TNFSF13,SENP3,EIF4A1,SNORD10,CD68,MPDU1,AC113189.5	NA	NA	NA	NA	TNFSF12-TNFSF13	5651	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	7737438	7738736	7737971	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	20328	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	18450	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	13194	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	12120	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	11508	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	HES7	4224	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr17	8090038	8090540	8090163	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	1024	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	8804087	8804508	8804237	Y	NDEL1,PIK3R5,PIK3R5	NA	NA	NA	NA	NA	NTN1	118351	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	10581804	10582199	10582113	Y	MYH4	SCO1,TMEM220	NA	NA	NA	NA	SCO1	17493	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	13249594	13249869	13249742	Y	HS3ST3A1	NA	HS3ST3B1,HS3ST3A1	IMR90	Hi-C	24141950	ELAC2	330090	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	13575065	13575361	13575332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX10-AS1	395451	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	5.48881248947652
chr17	14105008	14105251	14105153	Y	COX10,HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	97149	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	15860629	15861165	15860792	Y	ADORA2B,ZSWIM7,TTC19	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	14398	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	15959345	15959465	15959410	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	58314	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	16319642	16320463	16320033	Y	NA	UBB,TRPV2	NA	NA	NA	NA	TRPV2	2786	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr17	16375722	16375971	16375775	Y	TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	17496	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	31288	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	17615930	17616232	17616056	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	33143	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	17654001	17654381	17654093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	71214	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	17847220	17847305	17847263	Y	NA	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	26431	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	17861466	17861608	17861562	Y	SMCR8	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	12128	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	17862888	17863023	17862956	Y	NA	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	10713	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	19656390	19656618	19656531	Y	MAPK7,MAPK7	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH3A2	106941	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	19913206	19913926	19913276	Y	ULK2,AKAP10	AKAP10,SPECC1	NA	NA	NA	NA	SPECC1	2549	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr17	19967569	19967807	19967644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1	56912	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	20688064	20688832	20688343	Y	NA	SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	2106	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	25410571	25410806	25410743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208296	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	25659975	25660361	25659997	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40873	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	25680204	25680481	25680340	Y	LGALS9,WSB1	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61102	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr17	26458610	26458889	26458687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	91847	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	27530741	27530989	27530946	Y	NA	MYO18A	MYO18A,TAOK1,NUFIP2	IMR90	Hi-C	24141950	MYO18A	25311	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	27619094	27619880	27619581	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	27791459	27791862	27791696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4523	75779	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	27919265	27919579	27919303	Y	NA	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1	NA	NA	NA	NA	GIT1	193	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	28258246	28258478	28258304	Y	NA	SSH2	NA	NA	NA	NA	SSH2	2952	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	29609076	29609437	29609257	Y	NA	EVI2A	NA	NA	NA	NA	EVI2A	37465	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVI2A	229790	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr17	30778136	30778420	30778202	Y	ZNF207	PSMD11,CDK5R1	NA	NA	NA	NA	PSMD11	8857	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	34871446	34871455	34871448	Y	NA	ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2	NA	NA	NA	NA	PIGW	17392	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	35177105	35177136	35177121	Y	NA	NA	AATF,LHX1	IMR90	Hi-C	24141950	AATF	127039	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	35682301	35682446	35682421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACACA	82463	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	36103612	36103841	36103732	Y	HNF1B	HNF1B	NA	NA	NA	NA	HNF1B	375	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	36480536	36480738	36480637	Y	NA	MRPL45,SOCS7	NA	NA	NA	NA	SOCS7	25373	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	36748013	36748410	36748212	Y	NA	SRCIN1	ARHGAP23	IMR90	Hi-C	24141950	SRCIN1	11773	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	36758537	36758835	36758687	Y	NA	SRCIN1	NA	NA	NA	NA	SRCIN1	1348	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	37558786	37559227	37559071	Y	NA	FBXL20,MED1	NA	NA	NA	NA	FBXL20	2010	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	37751880	37751882	37751881	Y	NA	STARD3	NA	NA	NA	NA	STARD3	39436	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	38470934	38471197	38471090	Y	IKZF3,WIPF2,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	7490	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	38674878	38675250	38674921	Y	TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4	NA	IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IGFBP4	77176	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	39218168	39218609	39218458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT20	178689	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	39656265	39656585	39656468	Y	KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP2-4,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9,KRT37	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	25975	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	39683248	39683750	39683386	Y	NA	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	688	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	39685394	39685532	39685463	Y	KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	2834	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	39686458	39686891	39686666	Y	KRT19	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	3898	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	39703962	39704520	39704217	Y	NA	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	21402	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	39949116	39949497	39949168	Y	KRT14,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	7933	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	41478754	41478975	41478864	Y	ARL4D	ARL4D	NA	NA	NA	NA	ARL4D	4427	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	41500242	41500532	41500387	Y	NA	ARL4D	NA	NA	NA	NA	ARL4D	25915	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	41546132	41546290	41546231	Y	NA	DHX8	LOC100130581,ARL4D,DHX8	IMR90	Hi-C	24141950	DHX8	12943	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr17	41546701	41546836	41546769	Y	NA	DHX8	DHX8,ARL4D,LOC100130581	IMR90	Hi-C	24141950	DHX8	12397	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr17	42101631	42102033	42102001	Y	C17orf105,CD300LG,LSM12	NAGS,TMEM101,LSM12,G6PC3	NA	NA	NA	NA	TMEM101	2317	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	42198947	42199210	42199140	Y	NA	C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.56772811815974
chr17	42620927	42621257	42621090	Y	FZD2	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,ITGA2B,DBF4B,C17orf104,CCDC43	IMR90	Hi-C	24141950	FZD2	11668	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	43084352	43084694	43084637	Y	NA	NMT1	NA	NA	NA	NA	NMT1	42284	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	43170304	43170536	43170449	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP	NMT1,DCAKD,ACBD4,PLCD3	NA	NA	NA	NA	DCAKD	33831	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr17	43398309	43398621	43398414	Y	NA	MAP3K14	LOC100133991,FMNL1,MAP3K14,TEX34,ARHGAP27	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K14	5895	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	43449108	43449433	43449167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	56694	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	43660811	43661173	43660906	Y	ACBD4,FMNL1,PLEKHM1	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHM1	94696	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	43919032	43919225	43919129	Y	STH	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	50523	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr17	44113965	44114105	44114069	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	144217	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	44198532	44198560	44198547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	228784	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	44234299	44234706	44234578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	264551	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	44240473	44240874	44240856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	270725	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr17	44847625	44847956	44847902	Y	WNT3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	50092	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr17	45717975	45718065	45718017	Y	NA	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	6777	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	45771013	45771467	45771041	Y	NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	46171	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	45778272	45778788	45778511	Y	SNX11,SNX11,ITGB3,C17orf57,NPEPPS,SP2,OSBPL7,CDK5RAP3,TBKBP1,TBX21	NA	NA	NA	NA	NA	KPNB1	53430	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	46314423	46314444	46314434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	135704	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	46318516	46318700	46318601	Y	SKAP1,HOXB4	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	139797	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	46583139	46583523	46583310	Y	SKAP1	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3	HOXB2,HOXB3,HOXB4,SKAP1,HOXB8,HOXB1,HOXB9	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HOXB-AS1	35390	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	46642274	46642589	46642562	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	12884	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	46643791	46644035	46643913	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	11438	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	46644443	46644754	46644601	Y	HOXB9,HOXB8,HOXB6	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	10719	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	46654606	46654947	46654902	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9	NA	NA	NA	NA	HOXB4	526	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.19552499579061
chr17	46662223	46662405	46662377	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB4	6750	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr17	46662684	46663231	46662943	Y	HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB5	6092	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.46996562026443
chr17	46680378	46680812	46680678	Y	NA	HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	HOXB6	24	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr17	46696942	46697254	46696999	Y	NA	HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	HOXB9	4585	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	46702579	46702749	46702606	Y	HOXB2,HOXB3,SNF8,HOXB5,HOXB6,HOXB7,HOXB8,HOXB9	HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	HOXB9	740	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	47017432	47017466	47017449	Y	NA	ATP5G1,UBE2Z,SNF8,RNU1-42P	NA	NA	NA	NA	SNF8	3013	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	35619	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr17	48105016	48105270	48105136	Y	XYLT2,LRRC59,ITGA3	ITGA3	LOC284080,ITGA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	ITGA3	26062	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	48139711	48140314	48140012	Y	XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3	ITGA3,PDK2	NA	NA	NA	NA	ITGA3	8379	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	PPP1R9B,COL1A1	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	48467638	48467952	48467795	Y	NA	XYLT2,MRPL27,EME1,LRRC59,ACSF2	NA	NA	NA	NA	LRRC59	4962	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	48716257	48716537	48716480	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	6119	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr17	48726648	48726741	48726695	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	16510	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	48908408	48908498	48908454	Y	NA	TOB1	TOB1,LOC400604,SPAG9,LINC00483	IMR90	Hi-C	24141950	TOB1	34841	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	55477911	55478459	55478198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	146699	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	55568668	55569013	55568840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	237456	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	55734748	55734863	55734779	Y	DYNLL2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	190554	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	55763716	55764071	55763861	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	161346	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	55912487	55912699	55912681	Y	NA	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	12718	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	55938337	55938724	55938439	Y	SUPT4H1,CUEDC1	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	12920	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	55951789	55952442	55952113	Y	SRSF1,MKS1,MKS1,BZRAP1,MRPS23	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	26372	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	55952714	55953105	55953007	Y	NA	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	27297	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	55976255	55976501	55976378	Y	OR4D2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	50838	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	55977135	55977456	55977362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	51718	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	56025910	56026308	56026041	Y	SUPT4H1	CUEDC1,VEZF1	NA	NA	NA	NA	CUEDC1	4376	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	56426877	56426962	56426920	Y	MTMR4,SUPT4H1	MIR142,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	1492	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	56428194	56428499	56428372	Y	VEZF1,MTMR4,SUPT4H1	MIR142	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	56587640	56587744	56587729	Y	PPM1E,DYNLL2,MKS1,SEPT4,MTMR4	MTMR4,SEPT4	NA	NA	NA	NA	MTMR4	5522	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	57231530	57231848	57231723	Y	NA	TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	670	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	57409690	57409997	57409875	Y	YPEL2	YPEL2	NA	NA	NA	NA	YPEL2	2640	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	57830594	57831044	57830806	Y	VMP1,RNFT1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	47607	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	57831888	57832338	57832062	Y	VMP1,RNFT1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	48901	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	57853705	57854627	57854148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	62000	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	57860256	57860659	57860446	Y	DHX40,VMP1,CA4	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	55968	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr17	57861698	57862055	57862024	Y	RNFT1	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	54572	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	57863159	57864676	57863979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	51951	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.19552499579061
chr17	57866887	57867071	57866969	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	49556	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	57881973	57882438	57882250	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	34189	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	57884074	57884248	57884161	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	32379	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	57902814	57903248	57902913	Y	YPEL2,VMP1,RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	13379	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	57905350	57905555	57905420	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	11072	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	57906379	57907270	57906882	Y	RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	9357	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	57922999	57923843	57923122	Y	PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	6372	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	58804933	58805128	58805031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAS3	52119	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	60255991	60256253	60256151	Y	MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	115348	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	60897286	60897580	60897414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	194524	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	60973132	60973339	60973182	Y	TLK2	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	270370	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	61043121	61043648	61043243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	340359	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr17	61451328	61451417	61451341	Y	NA	NA	MIR548W,MARCH10	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	70322	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	61629052	61629111	61629082	Y	NA	DCAF7,TACO1	NA	NA	NA	NA	DCAF7	3230	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	62339620	62339793	62339707	Y	CEP95	TEX2	NA	NA	NA	NA	TEX2	959	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	62491373	62491767	62491605	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	POLG2	219	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	62526246	62526643	62526459	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	DDX5	23929	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	62675748	62676312	62676051	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2,LOC146880	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMURF2	19562	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.19552499579061
chr17	62703261	62703596	62703473	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF2	47075	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	62958497	62958860	62958615	Y	NA	LRRC37A3,AMZ2P1	NA	NA	NA	NA	AMZ2P1	10834	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	63030127	63030512	63030385	Y	NA	GNA13	AMZ2P1	IMR90	Hi-C	24141950	GNA13	20445	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	63510856	63511230	63511043	Y	NA	AXIN2	NA	NA	NA	NA	AXIN2	44535	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	63550809	63551200	63551034	Y	NA	AXIN2	NA	NA	NA	NA	AXIN2	4565	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	63552177	63552345	63552261	Y	NA	AXIN2	NA	NA	NA	NA	AXIN2	3420	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	84165	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr17	63654769	63655153	63655091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	99004	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	63747410	63747660	63747535	Y	CEP112,CEP112,AXIN2	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	191645	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	63911055	63911226	63911141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP112	274976	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	CEP112	NA	NA	NA	NA	CEP112	7870	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	64455929	64456369	64456061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	159175	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr17	64463185	64463416	64463350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	166431	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	64505568	64505880	64505716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	208814	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	64518890	64518971	64518949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	222136	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	64617261	64617362	64617312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	320507	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	64948296	64948612	64948339	Y	CACNG4	NA	CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HELZ	291493	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	65386872	65387224	65386898	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	15297	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	65389377	65389540	65389482	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	17802	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	65418011	65418377	65418257	Y	HELZ,PSMD12,PITPNC1,BPTF	PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	46436	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	65437128	65437554	65437154	Y	HELZ,PITPNC1,BPTF	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	65553	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	65487114	65487504	65487449	Y	HELZ,PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	115539	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	66374808	66375131	66375016	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	76523	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	66379549	66379922	66379702	Y	SLC16A6,WIPI1	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	71732	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	67270709	67270940	67270826	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCA5	50445	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	68361449	68361732	68361545	Y	KCNJ2	NA	MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ2	198635	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	69629735	69629997	69629863	Y	NA	LOC124685	LOC100499467,LINC00511	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	14616	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	70147771	70147892	70147832	Y	NA	SOX9	SOX9,LOC100499467	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SOX9	32610	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	70194547	70194569	70194559	Y	NA	NA	LOC100499467,SOX9	IMR90	Hi-C	24141950	SOX9	79386	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	70335121	70335458	70335290	Y	NA	NA	LOC100499467,SOX9	IMR90	Hi-C	24141950	SOX9	219960	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr17	70403681	70403886	70403813	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	217484	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	70417215	70417683	70417549	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	203687	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr17	70423161	70423493	70423326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	197877	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	70461830	70461987	70461862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	159383	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	70462396	70462597	70462589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	158773	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	70610080	70610203	70610142	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	LOC100499467	MCF7	ChIA-PET	22265404	RPL32P33	11167	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr17	70712408	70712674	70712489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00511	77797	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr17	72809186	72809552	72809426	Y	KIF19,RAB37,KCTD2,FADS6,GRIN2C	NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	TMEM104	38564	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	73696530	73696897	73696707	Y	SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	ITGB4	18511	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	73891396	73891618	73891569	Y	NA	WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1	NA	NA	NA	NA	TRIM65	312	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	74264426	74264836	74264522	Y	NA	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	RNF157	29972	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	74269060	74269291	74269140	Y	RHBDF2,JMJD6,H3F3B,UNK,SPHK1,RNF157,FAM100B	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	RNF157	34606	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	74413626	74413718	74413672	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1,UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	33570	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	74723995	74724371	74724344	Y	FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	METTL23	3083	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	75118026	75118235	75118074	Y	NA	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	37228	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr17	75199050	75199385	75199187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	118252	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	75281264	75281453	75281354	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	200466	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	75281811	75282557	75281917	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201013	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr17	75282703	75283463	75282995	Y	SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201905	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	75319028	75319523	75319372	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238230	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr17	75319670	75320031	75319742	Y	MGAT5B,SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238872	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr17	75384636	75384998	75384811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	303838	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMC6	171692	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	14.5453530971128
chr17	76338337	76338836	76338651	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	15322	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	76356993	76357093	76357047	Y	SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	2835	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	76879007	76879631	76879400	Y	CYTH1,ENGASE,CANT1,USP36	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39838	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	76879876	76880180	76879977	Y	NA	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39289	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	76929562	76929807	76929665	Y	CANT1	TIMP2,LGALS3BP	TIMP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TIMP2	10093	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	77776510	77776898	77776679	Y	CCDC40	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	3028	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	77787297	77787609	77787349	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	13815	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	78228476	78228940	78228764	Y	GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213	SLC26A11,SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	RNF213	3725	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV,NPTX1	NA	NA	NA	NA	NPTX1	20369	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.19552499579061
chr17	78735331	78735538	78735429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPTOR	218712	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	78763390	78763671	78763525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	199727	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr17	78844194	78844503	78844331	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	118895	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	79017666	79018027	79017910	Y	AZI1,BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	10718	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	79056542	79056873	79056681	Y	NA	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	49594	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	79316253	79317268	79317090	Y	NA	SLC38A10	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,C17orf56,C17orf89,LINC00482,MIR3186,C17orf70,FSCN2,NPLOC4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	48906	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	79370754	79371569	79371407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	103407	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	79375864	79375954	79375909	Y	DYSFIP1,BAHCC1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	108517	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	79451287	79451558	79451462	Y	AATK,AZI1,BAHCC1	ACTG1	NA	NA	NA	NA	ACTG1	37315	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	79546845	79547000	79546944	Y	PCYT2	C17orf70	NA	NA	NA	NA	C17orf70	27858	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	79942701	79942868	79942785	Y	SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62	PYCR1,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	10018	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr17	80188750	80189250	80189000	Y	NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CCDC57	20044	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr17	80215337	80215590	80215470	Y	SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	14017	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	222573	222827	222703	Y	NA	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	43223	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	235900	236290	236249	Y	NA	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	29760	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr18	2223503	2223515	2223509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	345993	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	2302701	2302761	2302738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	266747	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	2350863	2351242	2350869	Y	NA	NA	METTL4	IMR90	Hi-C	24141950	METTL4	218266	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	2516331	2516615	2516492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	52893	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	3594733	3596177	3595596	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	185127	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr18	3963204	3963605	3963405	Y	DLGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	553598	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	8801229	8801479	8801315	Y	CCDC165	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	193786	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	9743544	9744009	9743684	Y	VAPA,RAB31	RAB31	NA	NA	NA	NA	RAB31	37382	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr18	9838439	9838883	9838628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	73116	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	11846235	11846388	11846281	Y	GNAL,GNAL	CHMP1B	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	3007	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	11859926	11860218	11860181	Y	CHMP1B	CHMP1B,MPPE1	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	10531	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr18	12048672	12049055	12049000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPA2	69648	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr18	12059774	12060081	12059918	Y	NA	NA	GNAL,IMPA2	IMR90	Hi-C	24141950	IMPA2	80750	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.56772811815974
chr18	12347442	12347507	12347473	Y	CEP76,AFG3L2	TUBB6,AFG3L2	NA	NA	NA	NA	AFG3L2	27806	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	12864190	12864369	12864245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	63273	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	13137958	13138425	13138153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	148597	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	20913960	20914007	20913982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM241	101918	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	21808250	21808465	21808434	Y	OSBPL1A	NA	NA	NA	NA	NA	CABYR	91308	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	21975077	21975273	21975220	Y	OSBPL1A	OSBPL1A,IMPACT	NA	NA	NA	NA	OSBPL1A	571	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	32558962	32559433	32559316	Y	ZNF397,ZNF396,ZNF24,MAPRE2,MAPRE2	MAPRE2	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	4070	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	33040584	33040905	33040747	Y	NA	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	35050	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	33071303	33071471	33071398	Y	NA	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	4484	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	33876540	33877026	33876703	Y	NA	FHOD3	NA	NA	NA	NA	FHOD3	863	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr18	34107164	34107375	34107280	Y	RPRD1A,FHOD3	NA	NA	NA	NA	NA	FHOD3	231487	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	34392785	34392973	34392879	Y	NA	KIAA1328,TPGS2	NA	NA	NA	NA	KIAA1328	14096	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	35000619	35000729	35000675	Y	CELF4	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	593461	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	36850987	36851328	36851158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	62311	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	43543003	43543287	43543010	Y	PSTPIP2,EPG5	EPG5	NA	NA	NA	NA	EPG5	1953	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	44372138	44372406	44372272	Y	RNF165,PIAS2	NA	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	123049	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	44675442	44676177	44675810	Y	NA	HDHD2,IER3IP1	NA	NA	NA	NA	HDHD2	551	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	45529364	45529594	45529519	Y	NA	NA	SMAD2,ZBTB7C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD2	73849	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	45688048	45688324	45688110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232533	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	46349762	46350033	46349891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	125048	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	46365443	46365671	46365554	Y	SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	109410	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	46467138	46467469	46467322	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	7612	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	3149	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr18	46523478	46523814	46523611	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD7	48397	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr18	46524155	46524830	46524741	Y	NA	SMAD7	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD7	49074	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	47548085	47548102	47548094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO5B	171361	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr18	52490491	52490717	52490508	Y	RAB27B	NA	RAB27B	MCF7	ChIA-PET	22265404	RAB27B	107400	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	54439234	54439547	54439439	Y	WDR7	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL1	122403	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	56188177	56188434	56188359	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	77429	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	56188664	56188776	56188720	Y	NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	77087	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr18	56192839	56193142	56192990	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	72721	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr18	56193191	56193601	56193321	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	72262	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	11.8009468523745
chr18	56208513	56208704	56208597	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	57159	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	56208933	56209328	56209119	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	56535	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr18	56212323	56212488	56212463	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	53375	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr18	56232351	56232608	56232443	Y	MALT1	SNORD28	NA	NA	NA	NA	SNORD28	33255	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	56337372	56337558	56337406	Y	MALT1	ALPK2,MALT1	NA	NA	NA	NA	MALT1	754	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr18	56359373	56359598	56359412	Y	NA	MALT1	NA	NA	NA	NA	MALT1	22755	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	56533618	56533625	56533622	Y	ZNF532	NA	NA	NA	NA	NA	MALT1	197000	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	60118389	60118639	60118544	Y	KIAA1468,ZCCHC2	NA	PHLPP1,ZCCHC2	IMR90	Hi-C	24141950	ZCCHC2	69601	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	66679870	66680014	66679942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMX3	299335	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	74755425	74755811	74755618	Y	MBP,MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	222862	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	74766602	74767022	74766743	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	234039	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	74775208	74775557	74775363	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	242645	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	74779066	74780013	74779875	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	246503	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	74785699	74786042	74785858	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	253136	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	74789913	74790245	74790119	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	257350	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	74803559	74803662	74803615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	270996	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	74808374	74808713	74808562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	275811	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	74813361	74814191	74813850	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	280798	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	74826312	74827078	74826635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	293749	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	75149077	75149342	75149210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	616514	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	75529879	75530144	75530012	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	997316	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	77153646	77154504	77153944	Y	ATP9B,NFATC1,NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr18	77558494	77558673	77558529	Y	NA	NA	KCNG2,PQLC1,CTDP1,RBFA,TXNL4A	IMR90	Hi-C	24141950	CTDP1	120693	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	290136	290651	290316	Y	RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	743	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr19	342831	343179	342882	Y	MIER2	MIER2	NA	NA	NA	NA	MIER2	33	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	511222	511648	511350	Y	RNF126,GZMM	MADCAM1,TPGS1,CDC34	NA	NA	NA	NA	TPGS1	5923	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	751766	752111	751822	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42964	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr19	753188	753320	753238	Y	C19orf20	PALM,PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	41755	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr19	823657	823956	823874	Y	BSG,PRSS57,PTBP1,LPPR3,PRTN3,ELANE,AZU1	PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	MIR4745	20717	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr19	1207906	1208235	1208159	Y	NA	SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP	NA	NA	NA	NA	STK11	20500	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr19	1445282	1445452	1445336	Y	C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2	GAMT,DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6	NA	NA	NA	NA	RPS15	8924	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	5.48881248947652
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	2095281	2095723	2095416	Y	NA	MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MOB3A	609	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	2165096	2165788	2165320	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	2632	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	2478921	2479315	2479258	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	4801	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	2494705	2495117	2494880	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	20585	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	2524971	2525260	2525066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	50851	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr19	2540691	2541097	2540881	Y	TIMM13	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	66571	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr19	2545643	2546037	2545824	Y	DOT1L,GADD45B,GNG7	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	71523	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	TLE2,AES	NA	NA	NA	NA	TLE2	9782	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	3360183	3360356	3360294	Y	TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	2622	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	3428769	3429112	3428821	Y	TLE2,NFIC	NA	NA	NA	NA	NA	DOHH	69826	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	3555158	3555442	3555300	Y	C19orf28	HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	HMG20B	15333	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	3562421	3562565	3562489	Y	NA	HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	HMG20B	8210	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr19	4456385	4456784	4456737	Y	UBXN6,UBXN6	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	566	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	4634649	4634985	4634807	Y	CCDC94,SEMA6B,TICAM1	TNFAIP8L1,C19orf10	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L1	2545	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	4677231	4677531	4677381	Y	NA	TNFAIP8L1,C19orf10,DPP9	NA	NA	NA	NA	C19orf10	8849	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	4870294	4870493	4870397	Y	SEMA6B,TICAM1	TICAM1,PLIN3,UHRF1	NA	NA	NA	NA	PLIN3	4514	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr19	4912030	4912419	4912247	Y	NA	PLIN3,UHRF1	NA	NA	NA	NA	UHRF1	10938	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	5091152	5091532	5091191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4B	124027	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr19	5287522	5287818	5287647	Y	NA	RPL32P34	NA	NA	NA	NA	RPL32P34	11777	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr19	5578316	5578496	5578453	Y	NA	SAFB,SAFB2	NA	NA	NA	NA	SAFB	42550	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	6056849	6057757	6057360	Y	DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	80696	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr19	6108978	6109271	6109224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88312	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	6539979	6540238	6540076	Y	NA	TUBB4A,TNFSF9	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	10969	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	6556475	6556744	6556665	Y	RFX2,TNFSF9,VAV1,EMR1,TNFSF14	TNFSF9,CD70	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	27465	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	6579838	6580006	6579922	Y	NA	CD70	NA	NA	NA	NA	CD70	22108	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	7254620	7254884	7254780	Y	NA	INSR	NA	NA	NA	NA	INSR	37161	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	7907381	7907869	7907475	Y	PNPLA6,PNPLA6,KIAA1543,FBN3,LASS4,EVI5L,FLJ22184,CTXN1	EVI5L,LRRC8E	NA	NA	NA	NA	EVI5L	14262	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	8488784	8489136	8488939	Y	PRAM1,MYO1F	RAB11B,MARCH2,HNRNPM	NA	NA	NA	NA	MARCH2	12630	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	9420483	9420931	9420837	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	11517	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr19	9783821	9783976	9783959	Y	NA	ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	45	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	9903168	9903577	9903239	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	32915	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	10148640	10148857	10148749	Y	NA	C19orf66	NA	NA	NA	NA	C19orf66	45941	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	10949257	10949551	10949405	Y	CDC37,KEAP1,KRI1,ILF3,QTRT1,DNM2,SPC24,SMARCA4,SMARCA4	TMED1,CARM1	NA	NA	NA	NA	TMED1	4263	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr19	11248443	11248964	11248826	Y	NA	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	15520	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	11404382	11404791	11404593	Y	ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159	DOCK6,CCDC159	NA	NA	NA	NA	DOCK6	33225	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	12404552	12404928	12404719	Y	ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44	CTD-2666L21.3,ZNF44,ZNF563	NA	NA	NA	NA	ZNF44	850	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr19	13123653	13124120	13123822	Y	WDR83,TNPO2,TNPO2,NFIX,CACNA1A	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	19231	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	13166882	13167358	13167036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRMT1	59023	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	13944151	13944331	13944193	Y	CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4	ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	39877	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	13944359	13944683	13944571	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15	ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	40085	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	13957204	13959386	13957586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	52930	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr19	13975574	13976059	13975671	Y	CACNA1A,LPHN1,CC2D1A,C19orf57	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	38955	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	16441306	16441578	16441415	Y	RAB8A,HSH2D,MED26,EPS15L1,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	7678	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	17190539	17191239	17190954	Y	HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	5948	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	17200566	17201240	17200825	Y	MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	15975	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	17208293	17208806	17208572	Y	NA	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	23702	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	17218539	17219391	17218963	Y	MED26,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	33948	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	17345747	17345835	17345791	Y	NA	USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1	NA	NA	NA	NA	NR2F6	8914	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr19	19623798	19624201	19624001	Y	NA	NDUFA13,YJEFN3	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	344	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	23309445	23309479	23309469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF724P	121713	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	28219787	28220540	28220091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1481908	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	28232492	28232748	28232631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1469700	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	30447917	30448294	30448014	Y	NA	URI1	NA	NA	NA	NA	URI1	35366	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr19	33532238	33532582	33532339	Y	RHPN2,GPATCH1,PDCD5,ANKRD27,NUDT19,CEP89,C19orf40	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	21212	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	33963951	33964351	33964166	Y	NA	PEPD	NA	NA	NA	NA	PEPD	46349	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	34992713	34992833	34992773	Y	NA	WTIP	NA	NA	NA	NA	WTIP	22839	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	35453242	35453666	35453504	Y	ZNF792	ZNF30,ZNF792,GRAMD1A	NA	NA	NA	NA	ZNF792	289	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr19	36135988	36136183	36136108	Y	ARHGAP33	HAUS5,RBM42,ETV2,COX6B1	NA	NA	NA	NA	COX6B1	942	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	36648389	36648571	36648491	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	19912	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	36757480	36757645	36757542	Y	NA	ZNF565	ZNF146	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF565	22321	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	36891925	36892272	36892205	Y	NA	ZFP14	NA	NA	NA	NA	ZFP14	23824	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	37246589	37246720	37246657	Y	NA	ZNF850	NA	NA	NA	NA	ZNF850	15007	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr19	37322216	37322466	37322299	Y	ZFP14,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF829,ZNF829,ZNF585B,ZNF568,ZNF420,ZNF383,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345	ZNF345,ZNF790	NA	NA	NA	NA	ZNF345	16797	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	38490005	38490506	38490269	Y	YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	94137	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr19	38493976	38494435	38494152	Y	YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	98108	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr19	38575229	38575296	38575264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPF1	143058	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.74440624473826
chr19	39149253	39149575	39149354	Y	SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12964	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr19	39182594	39182977	39182723	Y	PAK4,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	46305	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.46996562026443
chr19	39184148	39184440	39184342	Y	C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	47859	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr19	39550329	39550402	39550365	Y	EID2B,LGALS7,PAPL	PAPL	SAMD4B,FBXO27,GMFG	IMR90	Hi-C	24141950	PAPL	22151	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	39564346	39564568	39564426	Y	ZFP36,HNRNPL,NFKBIB	PAPL,PAK4	PAPL,SAMD4B,GMFG,LRFN1	IMR90	Hi-C	24141950	PAPL	7985	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	39894353	39894945	39894613	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	508	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	40939716	40940068	40940022	Y	SERTAD1	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	8544	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr19	41254580	41254859	41254762	Y	SHKBP1,ADCK4	ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,MIA-RAB4B,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	SNRPA	38	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	41260796	41261188	41261093	Y	SERTAD1,CYP2A13,CYP2B6,CYP2A6,ADCK4,ITPKC	ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,MIA-RAB4B,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	C19orf54	5338	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	41681944	41682199	41682187	Y	NA	RPL36P16,CYP2S1,AXL	CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	RPL36P16	8178	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr19	41729438	41729579	41729517	Y	ATP5SL,ATP5SL,AXL	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	6330	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr19	41731541	41731893	41731762	Y	NA	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	8433	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	41814398	41814719	41814610	Y	HNRNPUL1,TMEM91,TGFB1,CCDC97,B9D2	HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1	NA	NA	NA	NA	CCDC97	304	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	42379575	42379860	42379642	Y	ZNF574,DEDD2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1	RPS19,ARHGEF1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	5368	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr19	42774379	42774759	42774668	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	3690	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	NA	NA	NA	NA	CIC	5303	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr19	43835548	43835842	43835742	Y	NA	NA	TEX101	IMR90	Hi-C	24141950	PSG9	63866	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	44261449	44261664	44261525	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4	NA	NA	NA	NA	SMG9	4307	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	44287065	44287299	44287223	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	3656	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	44288540	44288860	44288798	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	5131	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227,ZNF233	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	45844650	45844836	45844820	Y	FBXO46,PPP1R13L	KLC3,ERCC2	NA	NA	NA	NA	KLC3	9958	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.19552499579061
chr19	45954905	45955186	45955133	Y	GIPR,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,BLOC1S3,PPM1N,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,RTN2	FOSB	IMR90	Hi-C	24141950	FOSB	14067	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	45980345	45980732	45980359	Y	GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N	FOSB,ERCC1,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	ERCC1	259	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	606	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.46996562026443
chr19	47792934	47793257	47793053	Y	NA	CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	16792	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	48101913	48102072	48101991	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85416	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	48896382	48896733	48896528	Y	GRIN2D	TMEM143,SYNGR4,KDELR1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	3572	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	48996099	48996379	48996219	Y	NA	GRWD1,CYTH2	NA	NA	NA	NA	CYTH2	25810	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	49466802	49467527	49467169	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	244	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr19	49590520	49590786	49590652	Y	NA	SNRNP70,LIN7B,C19orf73,PPFIA3	NA	NA	NA	NA	SNRNP70	3844	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	49698080	49698342	49698211	Y	NA	TRPM4	NA	NA	NA	NA	TRPM4	39082	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	49832847	49832906	49832877	Y	PTH2	TEAD2	NA	NA	NA	NA	TEAD2	30808	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	49896315	49896677	49896489	Y	BCL2L12	TEAD2	NA	NA	NA	NA	TEAD2	32601	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	50116585	50116794	50116665	Y	NA	NOSIP,PRR12,RRAS,SCAF1	NA	NA	NA	NA	PRR12	23685	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	51010284	51010518	51010437	Y	KLK4,ACPT,SYT3,SHANK1,LOC342918	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	2092	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	51059944	51060288	51060130	Y	NA	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	47334	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr19	51896075	51896247	51896161	Y	SIGLEC14	ETFB	NA	NA	NA	NA	ETFB	28403	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	119534	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr19	52674093	52674226	52674127	Y	ZNF836	ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	ZNF836	1197	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	53129559	53129725	53129643	Y	ZNF160,ZNF616,ZNF766,ZNF808,ZNF701,ZNF611,ZNF611,ZNF83	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF83	62024	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	53132219	53132465	53132335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF83	59284	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	53145294	53145545	53145446	Y	NA	ZNF83	NA	NA	NA	NA	ZNF83	46204	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr19	53150651	53150972	53150733	Y	NA	ZNF83	ZNF137P	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF83	40777	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	53173643	53173679	53173660	Y	ZNF83	ZNF83	ZNF137P	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF83	18070	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	53426305	53426488	53426354	Y	ZNF765,ZNF468,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	17366	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	53592651	53593387	53593361	Y	NA	ZNF160	NA	NA	NA	NA	ZNF160	11302	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF845	107141	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr19	54373735	54373974	54373935	Y	VSTM1,TFPT,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,CNOT3,ZNF765,ZNF761,ZNF813,NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM	MYADM,AC008753.6,PRKCG	NA	NA	NA	NA	AC008753.6	3374	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	54523388	54523781	54523608	Y	TARM1,VSTM1,RPS9,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LENG8,LAIR2,LAIR1,ZNF331,ZNF331,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM	NA	NA	NA	NA	NA	OSCAR	80219	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	55627475	55627790	55627718	Y	LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C	RDH13,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	548	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	55850120	55850505	55850225	Y	KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564	SUV420H2,TMEM238,RPL28	NA	NA	NA	NA	SUV420H2	899	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr19	55988531	55988605	55988568	Y	NAT14	ISOC2,ZNF628,NAT14	NA	NA	NA	NA	ZNF628	2832	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	56031210	56031577	56031512	Y	TMEM150B,SGK110	ZNF628,NAT14	NA	NA	NA	NA	NAT14	36839	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr19	56623811	56623981	56623918	Y	ZNF865,EPN1	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	6668	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	56698517	56698525	56698522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF444	56549	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	56835887	56836393	56836023	Y	ZSCAN5A	ZSCAN5A	NLRP5,ZNF787	IMR90	Hi-C	24141950	ZSCAN5A	41359	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	57944833	57945004	57944919	Y	NA	ZNF548,ZNF17,ZNF749,ZNF772	NA	NA	NA	NA	ZNF749	136	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	58315114	58315751	58315446	Y	ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	8530	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr19	58413801	58413982	58413868	Y	ZNF154,ZNF418	ZNF814,ZNF417	NA	NA	NA	NA	ZNF417	11996	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr19	58911739	58912056	58911822	Y	NA	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	868	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr2	1608037	1608218	1608215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM18	932598	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	2850815	2851100	2850821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	528553	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	3483837	3484086	3483869	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	37421	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	3583560	3583858	3583796	Y	NA	AC108488.4,RNASEH1-AS1,RNASEH1,RPS7	NA	NA	NA	NA	AC108488.4	1097	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	8767111	8767480	8767322	Y	NA	ID2	LINC00299,LOC339788,LOC100506274	IMR90	Hi-C	24141950	ID2	49495	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	8773908	8774094	8774001	Y	NA	ID2,AC011747.7	LINC00299,LOC339788,LOC100506274,ID2	IMR90	Hi-C	24141950	ID2	42881	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	8872785	8872976	8872902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC011747.7	52792	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	9374844	9375591	9375054	Y	YWHAQ,ASAP2	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	29950	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr2	9427289	9427526	9427454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	82395	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	9427801	9428115	9428020	Y	YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	82907	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr2	9475782	9475835	9475817	Y	KIDINS220,ADAM17	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB1BP1	85841	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	9641378	9641587	9641543	Y	NA	IAH1	NA	NA	NA	NA	IAH1	29591	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	9705660	9705808	9705714	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	11739	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	9795695	9795818	9795794	Y	NA	YWHAQ,RP11-521D12.1	YWHAQ,GRHL1,ADAM17,KLF11	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-521D12.1	18794	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	9815627	9815977	9815711	Y	NA	YWHAQ,RP11-521D12.1	NA	NA	NA	NA	RP11-521D12.1	38726	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	9843184	9843905	9843528	Y	KLF11,KLF11	NA	ADAM17,GRHL1,ASAP2,CPSF3,ITGB1BP1,IAH1,YWHAQ	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-521D12.1	66283	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	9894353	9894610	9894569	Y	ADAM17,KLF11,KLF11,GRHL1	NA	YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1,KLF11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TAF1B	86873	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	GRHL1	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL1	7931	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr2	10258344	10258406	10258377	Y	NA	CYS1,RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	2049	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	CYS1	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr2	10274411	10274722	10274506	Y	TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	13956	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	10330449	10330626	10330557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	69994	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	10341486	10341905	10341708	Y	KLF11	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	81031	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	10423423	10423670	10423576	Y	NA	HPCAL1	RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	17345	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	11970305	11970612	11970555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPIN1	154584	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	12703502	12703613	12703558	Y	NA	NA	TRIB2	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	151402	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	12856062	12856442	12856137	Y	NA	TRIB2	NA	NA	NA	NA	TRIB2	1047	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	15700375	15700622	15700454	Y	DDX1,NBAS	NBAS,DDX1	NA	NA	NA	NA	NBAS	921	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	17005594	17005646	17005620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSNL1	712747	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	17824489	17824666	17824658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSNL1	106096	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	19548078	19548301	19548191	Y	NA	OSR1	NA	NA	NA	NA	OSR1	8113	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	19766934	19767238	19767086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSR1	210520	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	19788015	19788399	19788228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSR1	231601	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	20176136	20176469	20176303	Y	WDR35	WDR35	NA	NA	NA	NA	WDR35	11423	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	20385260	20385778	20385600	Y	TTC32,HS1BP3	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	37416	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	20386283	20386578	20386422	Y	TTC32,HS1BP3	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	36616	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	20534195	20534238	20534216	Y	NA	PUM2	NA	NA	NA	NA	PUM2	15757	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	20779015	20779511	20779185	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	69338	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	20784084	20784557	20784460	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	64292	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr2	24491623	24491942	24491630	Y	ATAD2B,NCOA1,ITSN2	NA	NA	NA	NA	NA	ITSN2	89641	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	24491972	24492409	24492370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITSN2	89174	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	24852047	24852369	24852206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPO	161636	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	26605539	26605826	26605756	Y	RAB10	GPR113	NA	NA	NA	NA	GPR113	37854	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	26919291	26919602	26919376	Y	NA	AC015977.5	NA	NA	NA	NA	AC015977.5	19913	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr2	26946934	26947339	26946998	Y	C2orf28,C2orf28,HADHA,HADHB,C2orf18	AC015977.5,CENPA	NA	NA	NA	NA	CENPA	37818	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	26980806	26981182	26980970	Y	C2orf18	CENPA	OTOF,CENPA,C2orf70,CIB4,KCNK3,DPYSL5,MAPRE3,C2orf18	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CENPA	3975	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	27005355	27005756	27005547	Y	NA	CENPA	NA	NA	NA	NA	CENPA	20198	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	27304052	27304486	27304234	Y	CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1	AGBL5,OST4,KHK,CGREF1	NA	NA	NA	NA	KHK	3129	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr2	27614467	27614499	27614483	Y	EIF2B4,EIF2B4	AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1	NA	NA	NA	NA	FTH1P3	233	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	28183212	28183402	28183309	Y	FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	71247	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	28632075	28632521	28632225	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	16536	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	29009696	29009902	29009742	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB	PPP1CB	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	37190	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	29075660	29075992	29075826	Y	TRMT61B	TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	15175	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	29173330	29173730	29173529	Y	PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	NA	WDR43	57821	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr2	29331222	29331429	29331307	Y	NA	CLIP4	CLIP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	CLIP4	12651	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	29439591	29440302	29440265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIP4	121020	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr2	29650647	29650979	29650813	Y	ALK	NA	NA	NA	NA	NA	CLIP4	332076	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	30631915	30632243	30632028	Y	LBH	LCLAT1	LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	LCLAT1	35849	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	36584242	36585529	36584872	Y	FEZ2,CRIM1	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	3173	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	36665586	36666219	36665918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	84517	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	36712578	36712925	36712822	Y	CRIM1,FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	131509	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	36713753	36714120	36713762	Y	CRIM1,VIT,FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	132684	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	36790527	36791707	36791646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79523	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr2	36791809	36792197	36792002	Y	CRIM1	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79033	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	36795570	36795942	36795825	Y	FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	75288	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr2	36882679	36883018	36882845	Y	NA	FEZ2	LOC100288911,CRIM1,FEZ2,VIT	IMR90	Hi-C	24141950	FEZ2	11449	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	37199283	37199286	37199285	Y	NA	STRN	NA	NA	NA	NA	STRN	7668	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	37432341	37432705	37432523	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	24151	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	37489254	37489354	37489306	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	32398	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	37576725	37576898	37576775	Y	STRN,HEATR5B,PRKD3,QPCT	PRKD3,QPCT	NA	NA	NA	NA	QPCT	7008	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	37603882	37604154	37604086	Y	QPCT	QPCT	NA	NA	NA	NA	QPCT	34165	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr2	37605671	37605839	37605750	Y	CCDC75,QPCT	QPCT	NA	NA	NA	NA	QPCT	35954	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	5.76325311395034
chr2	37617673	37618124	37617783	Y	CDC42EP3,EIF2AK2	QPCT	NA	NA	NA	NA	QPCT	47956	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr2	37760471	37760598	37760536	Y	SULT6B1,FAM82A1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	QPCT	190754	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	37789550	37789826	37789587	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	173785	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	37797953	37798358	37798079	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	165253	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	37858321	37858709	37858681	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	104902	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	37880894	37881162	37881056	Y	EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	82449	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	37885188	37885619	37885408	Y	QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	77992	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	37938546	37938819	37938725	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	24792	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	38003710	38004005	38003838	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3,PRKD3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	40099	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	39338546	39339120	39338978	Y	ARHGEF33	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	10366	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	39665108	39665339	39665266	Y	NA	MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	2655	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	42481657	42481775	42481735	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	EML4	87167	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	42567305	42567366	42567336	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	COX7A2L	82862	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC025750.7	278642	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	43421229	43421631	43421263	Y	HAAO,THADA,THADA	ZFP36L2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	30117	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	43653578	43653957	43653847	Y	NA	NA	LOC100129726,ZFP36L2	MCF7	ChIA-PET	22265404	THADA	167228	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	43818575	43818651	43818610	Y	NA	THADA,PLEKHH2	NA	NA	NA	NA	THADA	2534	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	44007303	44007575	44007439	Y	NA	DYNC2LI1	NA	NA	NA	NA	DYNC2LI1	8125	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	44944979	44944991	44944986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012354.8	276561	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	45065314	45065642	45065473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012354.8	155910	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	45999486	45999797	45999642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCE	123002	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	46294979	46295300	46295093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	223506	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	46456791	46456944	46456828	Y	NA	NA	PRKCE,EPAS1,PIGF	IMR90	Hi-C	24141950	EPAS1	61862	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	46784048	46784469	46784214	Y	NA	RHOQ,ATP6V1E2	NA	NA	NA	NA	ATP6V1E2	16352	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	47136942	47137149	47137052	Y	RHOQ,TTC7A	TTC7A,MCFD2	NA	NA	NA	NA	TTC7A	4147	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	47199058	47199402	47199110	Y	NA	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	32064	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	47213827	47213985	47213928	Y	NA	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	46833	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	47270774	47271231	47270943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	103780	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	4.66549061605504
chr2	47282124	47282371	47282214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	115130	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	47296749	47297008	47296937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	104732	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	47298687	47298930	47298712	Y	TTC7A,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	102810	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	47499706	47499760	47499719	Y	C2orf61	NA	TTC7A,CALM2,SOCS5,MCFD2,C2orf61	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC073283.4	70453	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	48392535	48392754	48392657	Y	FBXO11,FBXO11,FOXN2	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN2	147022	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	54019039	54019374	54019207	Y	ACYP2,ASB3,ASB3,GPR75	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	ERLEC1	6858	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	55248216	55248544	55248355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	89213	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	55249584	55250267	55249993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	87490	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	55379709	55379882	55379800	Y	SMEK2,RTN4	RTN4	NA	NA	NA	NA	RTN4	41952	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	55450545	55450658	55450592	Y	CCDC88A,EML6,RTN4	RPS27A,MTIF2	NA	NA	NA	NA	RPS27A	6381	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	57600725	57600909	57600817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	531877	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	58002154	58002414	58002211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	130372	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	60006780	60007077	60006929	Y	NA	NA	BCL11A	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-32P	602663	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	60962204	60962802	60962781	Y	NA	PAPOLG	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	18563	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr2	61165363	61165465	61165452	Y	NA	RNU4-51P	NA	NA	NA	NA	RNU4-51P	28925	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	61428317	61428371	61428344	Y	USP34,AHSA2	AHSA2	NA	NA	NA	NA	AHSA2	25764	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	61580039	61580318	61580309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	115586	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	61698926	61699282	61699220	Y	PUS10,AHSA2,USP34	USP34	NA	NA	NA	NA	USP34	3022	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	61757728	61758222	61758112	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	5539	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	61766465	61766637	61766569	Y	AHSA2,USP34	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	2704	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	62805190	62805410	62805295	Y	NA	NA	EHBP1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM17	68161	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	62883210	62883234	62883222	Y	OTX1	EHBP1	EHBP1,TMEM17	IMR90	Hi-C	24141950	EHBP1	15752	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	64239166	64239247	64239208	Y	PELI1	VPS54	NA	NA	NA	NA	VPS54	4959	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	64291243	64291430	64291349	Y	NA	VPS54	LINC00309,PELI1	IMR90	Hi-C	24141950	VPS54	47037	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	64367846	64368162	64368149	Y	NA	PELI1	NA	NA	NA	NA	PELI1	1426	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	64994926	64995226	64995021	Y	SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	18787	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr2	65065938	65066285	65066136	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	89799	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	65086968	65087262	65087080	Y	AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	110829	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	65430351	65430659	65430505	Y	NA	ACTR2	ACTR2	IMR90	Hi-C	24141950	ACTR2	22228	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	65656801	65657217	65657146	Y	NA	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	554	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	65804222	65804385	65804306	Y	RAB1A	NA	ACTR2,SPRED2	IMR90	Hi-C	24141950	SPRED2	146451	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	68099152	68099495	68099246	Y	NA	NA	MEIS1,C1D	IMR90	Hi-C	24141950	C1D	236585	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	68472906	68473226	68473141	Y	PPP3R1	PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	8143	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	69241314	69241782	69241454	Y	ANTXR1	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	3004	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	69533941	69534050	69534019	Y	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	78332	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	69578985	69578997	69578991	Y	NA	GFPT1	NA	NA	NA	NA	GFPT1	33385	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	70335985	70336314	70336204	Y	AAK1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	8302	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	72372444	72372716	72372574	Y	CYP26B1	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	678454	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	73233755	73233809	73233782	Y	NA	NA	EMX1	IMR90	Hi-C	24141950	SFXN5	66938	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	74446656	74447054	74446868	Y	NA	MOB1A,MTHFD2	NA	NA	NA	NA	MTHFD2	22967	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	74647656	74647929	74647851	Y	SLC4A5,SLC4A5,DCTN1,C2orf81	DCTN1,C2orf81,WDR54,RTKN,INO80B,WBP1,MOGS	NA	NA	NA	NA	WDR54	851	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	75770641	75770653	75770647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL19	101256	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	75775367	75775568	75775468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL19	96341	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	75779311	75779317	75779314	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL19	92592	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	75833018	75833198	75833114	Y	NA	MRPL19	FAM176A,TACR1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL19	38711	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	75834246	75834589	75834429	Y	NA	MRPL19	FAM176A,TACR1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL19	37320	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	75836166	75836348	75836343	Y	NA	MRPL19	FAM176A,TACR1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL19	35561	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr2	75903279	75903482	75903481	Y	C2orf3,C2orf3	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	31370	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	85147093	85147556	85147171	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	16344	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.74440624473826
chr2	85173188	85173797	85173736	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	KCMF1,TMSB10	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KCMF1	22419	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	85267777	85267839	85267811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM3P3	59978	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	86151754	86152089	86151850	Y	NA	ST3GAL5	POLR1A,ST3GAL5,GNLY,ATOH8,LOC284950,LOC90784	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL5	37617	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	86307060	86307219	86307140	Y	GNLY,KDM3A,KDM3A	POLR1A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	POLR1A	24059	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	86388217	86388607	86388413	Y	NA	IMMT,MRPL35	NA	NA	NA	NA	IMMT	32286	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	91759872	91760090	91759934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2770710	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	91815672	91815808	91815787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2826510	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	91936197	91936406	91936290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2947035	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	96190968	96191044	96191006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAHD2A	124499	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	96348390	96348623	96348461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAHD2A	281921	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	97206009	97206227	97206118	Y	NA	ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	5529	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	98367978	98368166	98368128	Y	TMEM131,ANKRD36B,ZAP70,ZAP70	ZAP70	NA	NA	NA	NA	ZAP70	39955	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZAP70	115188	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	98485830	98486136	98485916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	124252	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr2	99118904	99119212	99119061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4A	59587	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	100496681	100496959	100496872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	392184	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	100630312	100630613	100630507	Y	AFF3	NA	NA	NA	NA	NA	LONRF2	306582	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	100907600	100907945	100907823	Y	NA	LONRF2	NA	NA	NA	NA	LONRF2	29250	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr2	100908504	100908788	100908727	Y	NA	LONRF2	NA	NA	NA	NA	LONRF2	28407	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr2	100937334	100937484	100937407	Y	LONRF2	LONRF2	NA	NA	NA	NA	LONRF2	139	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	101391486	101391807	101391647	Y	NA	NPAS2	NPAS2,RPL31	IMR90	Hi-C	24141950	NPAS2	42807	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	101435496	101435968	101435616	Y	NPAS2	NPAS2	NA	NA	NA	NA	NPAS2	882	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	101680419	101680493	101680454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	64242	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	101712877	101712902	101712892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	96700	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	105973379	105973614	105973553	Y	NA	TGFBRAP1,C2orf49	NA	NA	NA	NA	C2orf49	21563	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	106008939	106009297	106009286	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	43673	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	106020017	106020290	106020154	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	32680	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	106020631	106021071	106020783	Y	FHL2,FHL2	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	31899	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	109209973	109210484	109210252	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	61116	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	109210699	109211038	109210811	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	61842	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	109211421	109211903	109211563	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	62564	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	110271705	110271931	110271836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT10	97852	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	110871797	110872011	110872000	Y	MALL	MALL	NA	NA	NA	NA	MALL	132	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	4.39104999158121
chr2	111941595	111941939	111941767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	66640	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	112251481	112251757	112251540	Y	BCL2L11	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	376526	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	113581693	113582026	113582010	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKAP2L	61439	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	113638257	113639193	113638961	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	NA	CKAP2L,IL1A	IMR90	Hi-C	24141950	CKAP2L	118003	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	114014908	114015299	114015271	Y	NA	PAX8-AS1	NA	NA	NA	NA	PAX8-AS1	47809	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	114082449	114082815	114082523	Y	NA	NA	PAX8,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	PAX8-AS1	115350	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	SLC35F5	NA	NA	NA	NA	SLC35F5	42570	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	118847045	118847263	118847087	Y	INSIG2	INSIG2	NA	NA	NA	NA	INSIG2	3017	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	119067655	119067950	119067737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC093901.1	125693	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	121650745	121651146	121650942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	159546	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	127778942	127778947	127778945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BIN1	83984	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	128090505	128090721	128090714	Y	NA	ERCC3	NA	NA	NA	NA	ERCC3	40753	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	128173465	128174362	128173731	Y	SFT2D3,AMMECR1L,MAP3K2,PROC	MAP3K2	NA	NA	NA	NA	MAP3K2	29424	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	128258405	128258697	128258648	Y	NA	RNU4-48P,IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	23765	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	128562322	128562673	128562571	Y	NA	WDR33	LIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR33	4088	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	131149333	131149678	131149410	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37753	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	133011418	133011623	133011538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR39	160524	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	133204437	133204733	133204517	Y	LYPD1	GPR39	NA	NA	NA	NA	GPR39	32290	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	133433715	133433886	133433800	Y	NA	LYPD1	NA	NA	NA	NA	LYPD1	6563	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	134878523	134878632	134878609	Y	MGAT5	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	2969	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	136268329	136268541	136268430	Y	NA	ZRANB3,R3HDM1	NA	NA	NA	NA	ZRANB3	18265	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr2	136504457	136504522	136504461	Y	NA	UBXN4	NA	NA	NA	NA	UBXN4	7268	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	143630131	143630342	143630268	Y	KYNU	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	1457793	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	144499811	144499873	144499842	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	588262	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	145795788	145796304	145796070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	707653	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	147189297	147189317	147189307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PABPC1P2	153695	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	148671388	148671433	148671412	Y	ORC4,ORC4,ORC4,ORC4,ORC4	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR2A	71302	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	149925246	149925613	149925433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD6	258886	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	150222263	150222576	150222421	Y	NA	LYPD6	NA	NA	NA	NA	LYPD6	37764	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	151330104	151330756	151330441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RND3	62769	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	153356449	153356753	153356698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	166698	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	153568262	153568351	153568307	Y	NA	ARL6IP6,PRPF40A	NA	NA	NA	NA	ARL6IP6	4056	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	160350650	160351006	160350912	Y	MARCH7,CD302,BAZ2B	AC009506.2	NA	NA	NA	NA	AC009506.2	32883	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr2	164204698	164204962	164204800	Y	NA	NA	FIGN	IMR90	Hi-C	24141950	GCA	1031348	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	164205577	164205788	164205730	Y	NA	NA	FIGN	IMR90	Hi-C	24141950	GCA	1032227	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	164501816	164502222	164502220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCA	1328466	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	165430240	165430431	165430256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC21B	1377922	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	166161416	166161745	166161474	Y	SCN2A,SCN2A	NA	NA	NA	NA	NA	TTC21B	646608	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	168263159	168263570	168263327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074363.1	115478	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	168715539	168715784	168715662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	386867	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	169058014	169058040	169058027	Y	B3GALT1	STK39	NA	NA	NA	NA	STK39	44611	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	171623254	171623407	171623331	Y	NA	AC007405.6,GAD1	NA	NA	NA	NA	AC007405.6	2216	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	172961367	172961608	172961457	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	4020	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	175069870	175070170	175070019	Y	WIPF1,SP3,SP3	OLA1	NA	NA	NA	NA	OLA1	41256	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	175248509	175248787	175248661	Y	SP3,SP3	CIR1,SCRN3	NA	NA	NA	NA	CIR1	9656	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	175643140	175643660	175643376	Y	CIR1	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	60635	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	175837054	175837318	175837218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF2	193792	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	177047108	177047317	177047213	Y	NA	HOXD3,HOXD-AS2,AC016739.2	NA	NA	NA	NA	AC016739.2	16663	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	177423330	177423334	177423332	Y	NA	NA	HOXD1,HOXD-AS1,HOXD-AS2,HOXD8	IMR90	Hi-C	24141950	MTX2	291207	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	177486085	177486490	177486293	Y	HOXD3	NA	NA	NA	NA	NA	MTX2	353962	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	178030872	178031290	178031011	Y	NFE2L2,NFE2L2	HNRNPA3,AC079305.8	HOXD-AS2,LOC100130691,AGPS,PDE11A,NFE2L2,HNRNPA3,TTC30A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HNRNPA3	44001	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	178116726	178117036	178116927	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	1702	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	179866335	179866441	179866388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESTD1	261076	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	187263813	187264095	187263899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	84788	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	187601377	187601405	187601389	Y	ZSWIM2,FAM171B	FAM171B	NA	NA	NA	NA	FAM171B	44679	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	188436185	188436320	188436253	Y	NA	TFPI	TFPI,GULP1	IMR90	Hi-C	24141950	TFPI	7698	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	191660541	191660565	191660553	Y	NA	NA	STAT1,MFSD6,GLS,NAB1	IMR90	Hi-C	24141950	GLS	82988	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	191706618	191706816	191706674	Y	GLS	GLS,AC005540.3	GLS,STAT1,NAB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLS	36737	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	191706974	191707041	191707034	Y	GLS	GLS,AC005540.3	GLS,STAT1,NAB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLS	36512	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr2	191708638	191708846	191708778	Y	STAT4,NAB1,STAT1,GLS	GLS,AC005540.3	GLS,STAT1,NAB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLS	34707	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr2	191709136	191709198	191709167	Y	STAT4,NAB1,STAT1,GLS	GLS,AC005540.3	GLS,STAT1,NAB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLS	34355	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr2	191711355	191711777	191711579	Y	GLS	GLS,AC005540.3	GLS,STAT1,NAB1	IMR90	Hi-C	24141950	GLS	31776	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	191810388	191810629	191810413	Y	GLS	AC067945.3	STAT1	IMR90	Hi-C	24141950	AC067945.3	45664	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	191815156	191815612	191815322	Y	GLS	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	40681	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	192500525	192500897	192500643	Y	NA	NA	OBFC2A	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MYO1B	392614	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	192503383	192503649	192503532	Y	OBFC2A	NA	OBFC2A	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MYO1B	395472	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	192544982	192545232	192545125	Y	OBFC2A	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1B	437071	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr2	192562556	192562918	192562693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1B	454645	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	197686451	197686687	197686569	Y	PGAP1,C2orf66	GTF3C3	NA	NA	NA	NA	GTF3C3	24002	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	197934286	197934620	197934500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP1	143766	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	200168536	200168843	200168690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SATB2	165146	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	200270966	200271332	200271300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SATB2	62657	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	200328214	200328741	200328463	Y	SATB2,SATB2,SATB2	SATB2	NA	NA	NA	NA	SATB2	5248	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	201270357	201270484	201270442	Y	CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1	NA	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	101753	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	201273148	201273356	201273255	Y	CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1	NA	NA	NA	NA	NA	SGOL2	99375	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	201289842	201289940	201289893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGOL2	82791	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	201403171	201403461	201403317	Y	NA	SGOL2,KCTD18	NA	NA	NA	NA	KCTD18	20664	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	201411222	201411458	201411252	Y	PPIL3,NIF3L1,NIF3L1,SGOL2	SGOL2,KCTD18	NA	NA	NA	NA	KCTD18	28715	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	201777095	201777270	201777183	Y	FAM126B,CFLAR,CFLAR	CLK1,PPIL3,NIF3L1,ORC2	NA	NA	NA	NA	NIF3L1	25045	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	201829288	201829721	201829590	Y	KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2	ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	2885	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	201989489	201990098	201989672	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	10662	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	201991403	201992374	201991715	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	12576	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	202079360	202079680	202079556	Y	CLK1,CLK1,CFLAR,CASP10	NA	NA	NA	NA	NA	CFLAR	100533	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	202100663	202100910	202100770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFLAR	121836	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	202560879	202561324	202561082	Y	NA	MPP4	NA	NA	NA	NA	MPP4	93	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	202752724	202752776	202752749	Y	ALS2	NA	NA	NA	NA	NA	CDK15	99540	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA2P3	143335	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr2	203026340	203026455	203026401	Y	ALS2	PSMA2P3,DAZAP2P1	CDK15,ALS2,MPP4,FZD7,SUMO1,NOP58	IMR90	Hi-C	24141950	PSMA2P3	15565	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	203726604	203726681	203726643	Y	FAM117B,CYP20A1,ABI2,ICA1L,ICA1L,ALS2CR8,ALS2CR8	ICA1L	NA	NA	NA	NA	ICA1L	8027	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	205036975	205037335	205037108	Y	NA	NA	PARD3B	IMR90	Hi-C	24141950	PARD3B	371181	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	206439575	206439768	206439663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	104946	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	206948392	206948813	206948647	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	INO80D	214	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	207981292	207981447	207981370	Y	NA	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	48544	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	208007936	208008436	208008192	Y	METTL21A,METTL21A,KLF7,CREB1	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	21555	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	208027980	208028625	208028335	Y	CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	1366	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1	NA	NA	NA	NA	CREB1	2961	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr2	211404935	211405006	211404955	Y	CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL1	64559	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	213770329	213770669	213770422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAG16	376444	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	214053041	214053239	214053088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAG16	93874	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	217035180	217035407	217035275	Y	NA	NA	PKI55	IMR90	Hi-C	24141950	XRCC5	64993	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	217180784	217180970	217180877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARCH4	53780	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr2	217214941	217215065	217215003	Y	NA	MARCH4	NA	NA	NA	NA	MARCH4	19685	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	217557565	217558269	217557956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP2	62014	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	219271996	219272374	219272308	Y	USP37	CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	11017	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	219648056	219648806	219648528	Y	TMBIM1,PNKD,SLC11A1,TTLL4,CYP27A1	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL4	74488	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	219773515	219774011	219773826	Y	USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A	CDK5R2	NA	NA	NA	NA	CDK5R2	48366	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	220385870	220386219	220385945	Y	ACCN4	GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1	NA	NA	NA	NA	TMEM198	20166	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	220553753	220554082	220553876	Y	NA	AC009502.1	DES,SLC4A3	K562	5C	22955621	AC009502.1	6236	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	221093432	221093609	221093525	Y	NA	NA	EPHA4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC009502.1	545915	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	222242662	222242904	222242783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	194018	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	222305020	222305156	222305087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	131766	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	222312152	222312375	222312261	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	124547	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	222382501	222382744	222382664	Y	EPHA4	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	54178	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	222383007	222383509	222383204	Y	EPHA4	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	53413	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA4	389768	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr2	223439256	223439394	223439332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	79662	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	224413942	224414282	224414142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCG2	50939	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	224428219	224428432	224428353	Y	NA	SCG2	SCG2	IMR90	Hi-C	24141950	SCG2	36789	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	225621293	225621621	225621457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	173183	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	226979861	226980232	226980018	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRS1	682243	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	227514922	227515156	227515015	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	147319	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr2	227517160	227517436	227517301	Y	IRS1	NA	IRS1,LOC646736	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	145039	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.19552499579061
chr2	227656309	227656561	227656437	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	5914	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	227666599	227666819	227666709	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	4124	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	228437239	228437625	228437329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGFG1	102371	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	230160111	230160461	230160261	Y	PID1	NA	SPHKAP,DNER,PID1	IMR90	Hi-C	24141950	DNER	416813	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	230736228	230736612	230736477	Y	SP110	FBXO36,TRIP12	NA	NA	NA	NA	FBXO36	48406	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	231658746	231658958	231658902	Y	SP140L,SP100,SP100	NA	NA	NA	NA	NA	ITM2C	68396	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	232277113	232277443	232277206	Y	C2orf72	SNORD82	NA	NA	NA	NA	SNORD82	45708	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00471	91838	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr2	232507409	232507767	232507481	Y	NA	NA	PDE6D	IMR90	Hi-C	24141950	PTMA	61838	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr2	232531704	232531853	232531745	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	37752	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr2	233766797	233767190	233766879	Y	NA	C2orf82	NA	NA	NA	NA	C2orf82	46817	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr2	235872484	235872869	235872649	Y	NA	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	13867	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	237088797	237088932	237088867	Y	NA	AC079135.1	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	14707	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	237341356	237341565	237341461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	267266	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	237482983	237483115	237483021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	408893	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	238383141	238383356	238383272	Y	NA	MLPH	LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MLPH	8715	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	238396973	238397455	238397139	Y	NA	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	4902	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	238421741	238422134	238421894	Y	MLPH	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	29670	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	238694351	238694559	238694455	Y	NA	RBM44	NA	NA	NA	NA	RBM44	10473	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	239034841	239035063	239035020	Y	LRRFIP1,KLHL30	FAM132B	NA	NA	NA	NA	FAM132B	30560	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	239347857	239348510	239348285	Y	ASB1	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	14474	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.19552499579061
chr2	239870450	239870747	239870599	Y	NA	NA	LOC151171,TRAF3IP1,FLJ43879,MIR4786,TWIST2,HDAC4	IMR90	Hi-C	24141950	TWIST2	115777	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	240168373	240168774	240168689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	152356	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr2	240186875	240187303	240186998	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	133827	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	240196255	240196671	240196554	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	124459	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.84216874263356
chr2	240196933	240197336	240197049	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	123794	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr2	240201720	240202445	240202126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	118685	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	240248408	240248826	240248656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	72304	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	241190569	241190767	241190645	Y	NA	AC124861.1	GPC1,ANKMY1,PP14571	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC124861.1	2685	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	241309624	241309945	241309791	Y	GPC1	NA	PP14571,GPC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPC1	63143	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr2	242267084	242267405	242267274	Y	MTERFD2	SEPT2,HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	HDLBP	12608	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	242304310	242304654	242304483	Y	FARP2	HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	FARP2	10652	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr2	243028160	243028467	243028224	Y	ATG4B	AC093642.5	NA	NA	NA	NA	AC093642.5	317	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	483361	483443	483402	Y	NA	TBC1D20,CSNK2A1	NA	NA	NA	NA	CSNK2A1	39022	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr20	823028	823308	823133	Y	FAM110A	FAM110A	NA	NA	NA	NA	FAM110A	10670	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	1258531	1258969	1258603	Y	NA	SNPH	FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495	IMR90	Hi-C	24141950	SNPH	13571	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	1332285	1332772	1332374	Y	C20orf46,SDCBP2	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	39034	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr20	1372355	1372517	1372472	Y	NA	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	549	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	1415597	1415981	1415837	Y	NA	FKBP1A,NSFL1C	FKBP1A-SDCBP2	IMR90	Hi-C	24141950	NSFL1C	36506	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	1803835	1803933	1803903	Y	SDCBP2,SIRPB2,SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	SIRPA,STK35	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	69221	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	2090589	2090758	2090698	Y	NA	STK35	NA	NA	NA	NA	STK35	10332	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	2671963	2672026	2672004	Y	NA	NOP56,SNORD110,SNORD86,IDH3B,EBF4	NA	NA	NA	NA	EBF4	439	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	2964753	2965068	2964761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS26	59523	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	3155446	3155862	3155811	Y	EBF4,PTPRA,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	16604	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	3156363	3156554	3156472	Y	EBF4,PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	17521	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	3170247	3170648	3170474	Y	NA	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	DDRGK1	12683	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	4493607	4493844	4493709	Y	NA	NA	ADRA1D	IMR90	Hi-C	24141950	RPS4XP2	115021	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr20	5046140	5046913	5046758	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2	NA	SLC23A2,C20orf30,RASSF2,PCNA,PCNA-AS1,PRND,PRNT,CDS2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC23A2	57201	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	5553446	5553705	5553635	Y	NA	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	35967	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr20	9439217	9439498	9439406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	391807	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	10652083	10652420	10652292	Y	JAG1	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	27069	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	19796265	19796476	19796342	Y	RIN2,RIN2	NA	RIN2,SLC24A3,NAA20	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-122P22.2	59913	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	19797665	19798070	19797910	Y	RIN2,RIN2	NA	RIN2,SLC24A3,NAA20	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-122P22.2	61313	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr20	20188538	20188860	20188552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRNKL1	153848	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	20652620	20652826	20652771	Y	NA	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	38305	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	21058164	21058497	21058329	Y	NA	PLK1S1	NA	NA	NA	NA	PLK1S1	46127	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	21170951	21171134	21171012	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK1S1	66327	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	25291624	25291957	25291812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYGB	64919	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	25299092	25299564	25299289	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD12	70055	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	25372319	25372345	25372332	Y	NA	ABHD12,GINS1	NA	NA	NA	NA	ABHD12	2700	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	25671297	25671837	25671511	Y	NA	ZNF337	NA	NA	NA	NA	ZNF337	3640	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr20	29647996	29648434	29648295	Y	DEFB121,DEFB116	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	38139	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	30148718	30149081	30148825	Y	HCK,HM13	HM13,ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	42005	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	30249247	30249862	30249570	Y	TTLL9	NA	NA	NA	NA	NA	ID1	58161	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	30255856	30255976	30255884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	53816	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	30292336	30292785	30292516	Y	NA	BCL2L1,TPX2	COX4I2	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L1	17007	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	30300504	30300973	30300648	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8819	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr20	30301047	30301377	30301326	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8415	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr20	30305141	30305549	30305422	Y	PLAGL2,HCK	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	4243	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	30307720	30308274	30308104	Y	POFUT1	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	1518	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf112	107251	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr20	31373290	31373636	31373312	Y	C20orf185,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B,MAPRE1	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	25099	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	32400902	32401106	32400958	Y	CHMP4B	CHMP4B	NA	NA	NA	NA	CHMP4B	3792	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	32694090	32694253	32694172	Y	NA	EIF2S2,RPS2P1	NA	NA	NA	NA	EIF2S2	3885	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr20	32803456	32803920	32803688	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	93688	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr20	33150860	33150919	33150894	Y	NA	DYNLRB1,MAP1LC3A	NA	NA	NA	NA	MAP1LC3A	18202	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr20	33861234	33861630	33861491	Y	NA	MMP24,EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EDEM2	2298	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	34217204	34217560	34217502	Y	NA	SPAG4,CPNE1,RBM12	NA	NA	NA	NA	SPAG4	15390	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	35490387	35490628	35490526	Y	MANBAL,KIAA0889	NA	KIAA0889	MCF7	ChIA-PET	22265404	SAMHD1	87618	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	35583660	35583902	35583783	Y	TGIF2,TGIF2,TGIF2	SAMHD1	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	5414	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	35984908	35985120	35985046	Y	SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC	SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	13820	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	36034782	36035452	36035129	Y	C20orf132,VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	36484	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	36772576	36772945	36772677	Y	RPRD1B,BPI	TGM2	NA	NA	NA	NA	TGM2	20035	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr20	38910785	38911109	38910947	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFB	404771	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	39958158	39958419	39958360	Y	NA	ZHX3,LPIN3	PLCG1,ZHX3,LPIN3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LPIN3	9141	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	40193452	40193754	40193691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD6	51379	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	7334	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr20	42833040	42833424	42833233	Y	C20orf111	JPH2	NA	NA	NA	NA	JPH2	18822	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	42847207	42847559	42847248	Y	NA	JPH2	NA	NA	NA	NA	JPH2	32989	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	43123975	43124199	43124088	Y	C20orf111,STK4,ADA,SERINC3	RPL37AP1,TTPAL,SERINC3,PKIG	NA	NA	NA	NA	TTPAL	21449	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	43540233	43540373	43540312	Y	DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L	YWHAB,PABPC1L,TOMM34	NA	NA	NA	NA	PABPC1L	3530	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	43965327	43965544	43965453	Y	SDC4	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	9520	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	45870109	45870518	45870490	Y	ZMYND8,NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	108787	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr20	45946049	45946481	45946179	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	32824	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	45962816	45963214	45963054	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	16091	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr20	45989347	45989834	45989660	Y	SULF2	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5780	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	48212349	48213057	48212923	Y	PTGIS	NA	ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	KCNB1	115165	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	48285223	48285402	48285313	Y	SPATA2,SLC9A8	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	43013	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	48293445	48293839	48293746	Y	NA	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	34576	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	48311078	48311758	48311363	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	16657	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	48391675	48392320	48391995	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC9A8	34930	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr20	48496798	48497000	48496896	Y	NA	SPATA2	NA	NA	NA	NA	SPATA2	33080	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	48753681	48754062	48753956	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,PTPN1,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	14112	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	49055532	49055924	49055757	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	68967	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr20	49157621	49157908	49157761	Y	NA	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	32730	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr20	49350102	49350473	49350150	Y	NA	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	4021	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	49378305	49378754	49378413	Y	DPM1,PARD6B,BCAS4	PARD6B,BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	30677	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr20	49516325	49516426	49516399	Y	ADNP	ADNP	NA	NA	NA	NA	ADNP	29532	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	49524499	49524706	49524614	Y	ADNP	ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	ADNP	21252	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	49976918	49977375	49977162	Y	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NA	KCNG1	339252	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr20	49982226	49982434	49982404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNG1	344560	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr20	49982609	49983533	49983215	Y	KCNG1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNG1	344943	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.29328749368591
chr20	50033542	50033860	50033623	Y	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	315212	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	50040722	50041122	50041004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	307950	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	50063853	50064072	50063963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	285000	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr20	50178083	50178314	50178273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	170758	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	50180369	50180507	50180463	Y	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	168565	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr20	50247670	50248383	50248096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	100689	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr20	50366772	50367203	50366881	Y	ZFP64,ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	15970	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	50383575	50384083	50383723	Y	ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	402	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	52195343	52195714	52195527	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	28732	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr20	52238141	52238435	52238216	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	13695	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	52294676	52294905	52294769	Y	NA	NA	BMP7,SUMO1P1,BCAS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF217	70230	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	52390351	52390640	52390407	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	165905	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	52391089	52391563	52391364	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	166643	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr20	52445816	52446339	52446069	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	221370	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.29328749368591
chr20	52446362	52446831	52446771	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	221916	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	52514730	52515023	52514955	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	290284	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr20	52532315	52532889	52532591	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	289497	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr20	52542599	52542948	52542719	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	279438	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	52543055	52543571	52543250	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	278815	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr20	52740107	52740637	52740253	Y	NA	NA	DOK5,SULF2,ZMYND8,BMP7,PTPRT	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	81749	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr20	52749873	52750284	52750109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	72102	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	52753645	52754029	52753762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	68357	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr20	52784442	52785020	52784595	Y	PFDN4	PFDN4	NA	NA	NA	NA	PFDN4	37366	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	54997703	54998108	54997901	Y	NA	AURKA,CSTF1,CASS4	NA	NA	NA	NA	CASS4	12535	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr20	55362710	55362938	55362792	Y	AURKA,TFAP2C	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTMAP6	88140	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr20	55363467	55363682	55363577	Y	NA	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTMAP6	88897	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr20	56194057	56194266	56194203	Y	ZBP1	NA	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	90326	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	56247287	56247513	56247399	Y	PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	37079	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	56257855	56258136	56257956	Y	ZBP1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	26456	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	56270075	56270492	56270216	Y	PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	14100	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr20	56273255	56273697	56273462	Y	PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	10895	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr20	56293544	56293843	56293665	Y	NA	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	8952	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	56592321	56592469	56592395	Y	PMEPA1,PMEPA1	NA	ZBP1	IMR90	Hi-C	24141950	PPP4R1L	290026	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr20	56592800	56593208	56592856	Y	NA	NA	ZBP1,PMEPA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP4R1L	289287	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr20	57198784	57199334	57199089	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16	24994	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr20	57579440	57580501	57580194	Y	NA	ATP5E,SLMO2	NA	NA	NA	NA	CTSZ	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr20	60956743	60957219	60956871	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	RPS21	2953	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	60972798	60973035	60972874	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	CABLES2	7306	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr20	61371030	61371150	61371083	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	NTSR1	NA	NA	NA	NA	NTSR1	32841	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	61371540	61371927	61371747	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	NTSR1	NA	NA	NA	NA	NTSR1	33351	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr20	61554875	61554902	61554887	Y	DIDO1	DIDO1	NA	NA	NA	NA	DIDO1	12402	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	61555881	61556606	61556058	Y	DIDO1	DIDO1	NA	NA	NA	NA	DIDO1	10698	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr20	62313782	62314225	62314041	Y	NA	STMN3,RTEL1,TNFRSF6B,ZGPAT,ARFRP1	NA	NA	NA	NA	TNFRSF6B	11796	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.29328749368591
chr20	62609214	62609358	62609321	Y	SAMD10	UCKL1,SAMD10,PRPF6	NA	NA	NA	NA	SAMD10	3	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr21	9881917	9882087	9882000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3648	58085	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	17054611	17055027	17054700	Y	USP25	USP25	USP25	IMR90	Hi-C	24141950	USP25	45317	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	26952057	26952278	26952105	Y	JAM2	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	25551	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr21	27353741	27354048	27353953	Y	APP	NA	NA	NA	NA	NA	APP	187398	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	27370700	27370785	27370725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	170661	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	30684361	30684712	30684409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	119969	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	30751100	30751464	30751308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	186708	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	30758449	30758782	30758692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	194057	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	30927917	30928144	30928028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	363525	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	32553780	32554124	32553993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	375434	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	33853478	33853730	33853567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf119	90039	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr21	33893754	33894020	33893930	Y	C21orf63	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf59	89156	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr21	34075111	34075304	34075194	Y	NA	SYNJ1	NA	NA	NA	NA	SYNJ1	23055	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	34671462	34671931	34671597	Y	OLIG2,OLIG1,IFNAR2,SON,IFNGR2,GART,GART,IL10RB,IFNAR1	IL10RB,IFNAR1	NA	NA	NA	NA	IFNAR1	22803	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	35500965	35500968	35500967	Y	RCAN1,MRPS6,SLC5A3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	57095	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	35976444	35976765	35976605	Y	NA	RCAN1	NA	NA	NA	NA	RCAN1	8676	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	36208387	36209191	36208566	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	222946	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	36216696	36217156	36217046	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	231255	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	36254204	36254725	36254297	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	268763	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	36257911	36258724	36258067	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	272470	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	36864275	36864649	36864330	Y	RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RUNX1	510316	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	37486095	37486219	37486157	Y	NA	CBR1,SETD4,CBR3,DOPEY2	NA	NA	NA	NA	CBR3	18991	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	37529889	37530052	37529971	Y	DOPEY2	CBR3,DOPEY2	NA	NA	NA	NA	DOPEY2	2809	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	37712607	37712952	37712729	Y	NA	MORC3,CHAF1B	NA	NA	NA	NA	MORC3	22120	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	38434187	38434580	38434547	Y	NA	PIGP,TTC3	NA	NA	NA	NA	PIGP	8890	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr21	38623241	38623485	38623453	Y	NA	AP001432.14,DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	14777	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	39619401	39619932	39619765	Y	KCNJ15,KCNJ15,KCNJ15	NA	KCNJ6,KCNJ15,DSCR10	IMR90	Hi-C	24141950	ETS2	555299	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	39661705	39662059	39661845	Y	KCNJ15	NA	NA	NA	NA	NA	ETS2	513172	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	40753076	40753485	40753292	Y	WRB	HMGN1,WRB	NA	NA	NA	NA	WRB	2906	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	41003318	41003469	41003395	Y	NA	C21orf88	NA	NA	NA	NA	C21orf88	20570	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.19552499579061
chr21	41005118	41005297	41005205	Y	NA	C21orf88	SH3BGR	IMR90	Hi-C	24141950	C21orf88	22370	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr21	41146916	41147071	41146994	Y	LCA5L	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf88	164168	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	41975298	41975641	41975591	Y	DSCAM	NA	NA	NA	NA	NA	BACE2	562087	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	43460613	43461088	43460825	Y	C2CD2,SLC37A1	NA	NA	NA	NA	NA	C2CD2	88614	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	44918002	44918401	44918083	Y	NA	NA	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	72994	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr21	45154719	45155048	45154820	Y	NA	PDXK,CSTB	NA	NA	NA	NA	PDXK	17744	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr21	46097395	46097576	46097539	Y	KRTAP10-7,KRTAP10-12	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	122358	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr21	46127419	46127576	46127516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	92358	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	46349799	46350126	46349963	Y	KRTAP10-12	FAM207A	NA	NA	NA	NA	FAM207A	7799	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	46749567	46749782	46749739	Y	NA	POFUT2	COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2,COL18A1-AS1,LOC100129027,PCBP3,ADARB1,SLC19A1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	POFUT2	43754	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	46783934	46784395	46784118	Y	NA	COL18A1	ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COL18A1	38657	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr21	46786853	46787266	46786994	Y	COL18A1,POFUT2	COL18A1	ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL18A1	35786	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	46836537	46836812	46836569	Y	NA	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	13485	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	46894520	46894647	46894596	Y	COL18A1	NA	SLC19A1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC19A1	67678	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr21	47651317	47651563	47651562	Y	NA	LSS,MCM3AP-AS1	NA	NA	NA	NA	MCM3AP-AS1	4186	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	18539229	18539381	18539279	Y	NA	MICAL3,PEX26	NA	NA	NA	NA	PEX26	19308	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr22	19703205	19703405	19703340	Y	NA	SEPT5	NA	NA	NA	NA	SEPT5	3218	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	21131289	21131349	21131319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM191A	78069	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr22	22170870	22171333	22171102	Y	HIC2,PPM1F,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	48637	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	22187099	22187411	22187395	Y	PPM1F,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	32559	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	24796747	24798216	24797446	Y	GGT1	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1L-ADORA2A	131881	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	27488405	27488660	27488521	Y	NA	NA	PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-40G4P.1	206894	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	27508990	27509624	27509325	Y	NA	NA	PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-40G4P.1	227479	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	27872779	27873029	27872871	Y	NA	NA	PITPNB,TTC28,TTC28-AS1,MN1,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	MN1	322457	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr22	29365910	29365950	29365937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF3	88330	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	30601535	30602099	30601994	Y	MTMR3,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF	LIF	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	38741	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr22	30604572	30605275	30604996	Y	NA	LIF	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIF	35565	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr22	30630812	30631583	30630975	Y	NA	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	9257	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	30643780	30644513	30644215	Y	GAL3ST1,LIF	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	2940	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	30644816	30645407	30645321	Y	NA	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	3976	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr22	30646485	30646883	30646861	Y	SEC14L2,RNF215,LIF	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	5645	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	30647782	30648063	30647863	Y	SEC14L2,RNF215,GAL3ST1,LIF	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	6942	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr22	30651841	30652045	30651989	Y	RNF215	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	11001	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr22	30653574	30654311	30654075	Y	RNF215,GAL3ST1	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	12734	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	31639719	31639839	31639804	Y	LIMK2	LIMK2,PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	LIMK2	33494	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr22	31689398	31689773	31689585	Y	SMTN,DEPDC5	PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	2878	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	33238776	33239102	33239072	Y	SYN3,SYN3	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	370113	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	34055725	34056096	34055879	Y	NA	SNORA76	NA	NA	NA	NA	SNORA76	42810	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	36172767	36172943	36172931	Y	MB,MB,RBFOX2,RBFOX2	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	APOL6	130325	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr22	36385915	36386246	36386112	Y	NA	RBFOX2	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	36227	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	36727482	36728450	36727733	Y	APOL3	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	53613	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr22	36728624	36729163	36728912	Y	IFT27	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	52900	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	36746983	36747265	36747123	Y	NA	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	34798	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	36762359	36762844	36762518	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	19219	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	36766615	36766810	36766723	Y	NCF4,MYH9	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	15253	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr22	38614588	38614867	38614785	Y	MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	14891	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr22	39541576	39542088	39541730	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7	CBX7	NA	NA	NA	NA	CBX7	4591	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	39570711	39571096	39570941	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,PDGFB,APOBEC3G,APOBEC3H	CBX7	PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CBX7	24032	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	39610460	39610820	39610697	Y	NA	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	27936	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr22	39649567	39649736	39649595	Y	SUN2,APOBEC3A,PDGFB	PDGFB	CBX7,RNU86,RPL3,SNORD83A,PDGFB	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDGFB	10811	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	39704707	39705214	39704970	Y	ATF4,APOBEC3A	RPL3,SYNGR1	NA	NA	NA	NA	RPL3	9180	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	39923809	39924011	39923907	Y	NA	ATF4,RPS19BP1	NA	NA	NA	NA	RPS19BP1	2849	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	41460471	41460696	41460583	Y	NA	RP11-12M9.3,EP300	RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-12M9.3	2415	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr22	41776948	41777130	41776981	Y	NA	TEF	NA	NA	NA	NA	TEF	15611	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr22	42062739	42062953	42062873	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19990	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	43550927	43551235	43551079	Y	ARFGAP3	BIK,MCAT,TSPO,TTLL12	NA	NA	NA	NA	TSPO	5407	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	45642150	45642482	45642292	Y	NA	KIAA0930	LOC100506714,NUP50,KIAA0930,UPK3A,FBLN1,SMC1B	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0930	7500	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	45664918	45665214	45665118	Y	NA	KIAA0930,FAM118A	LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0930	30268	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr22	46374858	46375446	46375153	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	3849	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr22	46464940	46465203	46464976	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	1169	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	46467914	46468476	46468052	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	4143	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	46472616	46472825	46472697	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	8845	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	46480881	46481264	46481017	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	17110	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr22	49768624	49768992	49768711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	450168	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,XX-C283C717.1,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	3177157	3177268	3177188	Y	CRBN	TRNT1,CRBN	NA	NA	NA	NA	TRNT1	10557	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	3639816	3640081	3639965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRBN	420422	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	4392615	4392774	4392664	Y	ITPR1	SETMAR	NA	NA	NA	NA	SETMAR	49627	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	4909917	4910799	4910503	Y	ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	108002	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	5027453	5027635	5027574	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	7807	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	8888	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	5065036	5065378	5065161	Y	BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	45390	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	5067974	5068590	5068209	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	48328	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	5145575	5145674	5145603	Y	NA	ARL8B	ITPR1,EGOT	IMR90	Hi-C	24141950	ARL8B	16231	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	8978841	8979048	8978945	Y	NA	RAD18	NA	NA	NA	NA	RAD18	24409	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	9143032	9143317	9143164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	139575	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	10233695	10234220	10233931	Y	VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	29146	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	10238203	10238635	10238546	Y	ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2,TATDN2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	33654	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	10395342	10395455	10395399	Y	NA	SEC13	NA	NA	NA	NA	SEC13	34480	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	11261398	11261658	11261529	Y	HRH1	NA	NA	NA	NA	NA	ATG7	50337	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr3	11279893	11280094	11280011	Y	NA	ATG7	NA	NA	NA	NA	ATG7	31901	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	11632872	11633201	11633091	Y	SYN2,VGLL4	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	127019	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	12350153	12350305	12350183	Y	NA	PPARG	NA	NA	NA	NA	PPARG	23286	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.19552499579061
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	NUP210,HDAC11	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.19552499579061
chr3	15337572	15337812	15337795	Y	NA	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	43063	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	15344031	15344281	15344245	Y	NR2C2,ZFYVE20,CAPN7,EAF1,SH3BP5	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	36594	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	15712856	15713111	15712984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	71518	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	15835826	15836097	15835987	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD28	63181	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr3	16101834	16102183	16102049	Y	NA	NA	GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	202296	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	16171559	16171808	16171705	Y	GALNTL2	NA	GALNTL2,ANKRD28,BTD,DPH3,OXNAD1	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	132671	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	16429150	16429271	16429247	Y	RFTN1	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	124262	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	17404652	17404912	17404782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	851119	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	17506581	17506846	17506713	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	953048	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	17913596	17913897	17913750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	570412	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr3	19993428	19993925	19993635	Y	KAT2B,RAB5A	EFHB,RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	6857	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	20012721	20012798	20012760	Y	NA	EFHB,RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	26150	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	22039046	22039346	22039196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB1P5	381964	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	23946487	23946815	23946592	Y	NA	RPL15,NR1D2,NKIRAS1	NA	NA	NA	NA	RPL15	9221	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	25623618	25623990	25623898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOP2B	80408	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr3	25796078	25796406	25796226	Y	NGLY1	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	26002	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	27524458	27524952	27524717	Y	NA	SLC4A7	NA	NA	NA	NA	SLC4A7	547	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	4.39104999158121
chr3	31958870	31959021	31958942	Y	ZNF860,OSBPL10	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF860	62242	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	32434248	32434406	32434345	Y	NA	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	3085	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	32461951	32462075	32462013	Y	CMTM7	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	30788	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	33190938	33191178	33190994	Y	NA	CRTAP	NA	NA	NA	NA	CRTAP	37467	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	37949474	37949626	37949550	Y	SLC22A14	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	48023	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	38675761	38675887	38675842	Y	NA	SCN5A	NA	NA	NA	NA	SCN5A	13277	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	42220925	42221235	42221114	Y	TRAK1	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	167631	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	43437259	43437582	43437422	Y	ZNF662,ZNF662,FAM198A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-353H3.1	87790	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	45147419	45147607	45147508	Y	TMEM158,CDCP1	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	38307	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	45164613	45164770	45164669	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	21144	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	45165992	45166137	45166089	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	19777	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	45209101	45209416	45209191	Y	LIMD1	CDCP1,RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	9434	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	46600040	46600219	46600077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	418954	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	46971519	46971826	46971651	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	47347	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	47704557	47705253	47705047	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	CSPG5	84275	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	48332679	48332937	48332732	Y	SPINK8	NME6	NA	NA	NA	NA	NME6	8238	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	49425171	49425361	49425266	Y	ARIH2,QRICH1,USP4,UBA7	USP4,GPX1,TCTA,RHOA,NICN1	NA	NA	NA	NA	TCTA	22278	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	50370591	50370860	50370724	Y	RBM6,SEMA3B,RASSF1	IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL2,TUSC2,RASSF1,ZMYND10,CYB561D2,NPRL2,TMEM115	NA	NA	NA	NA	RASSF1	5551	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	51573530	51573858	51573781	Y	VPRBP,RAD54L2	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	41520	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	52532822	52533186	52532863	Y	TWF2,PPM1M,PPM1M,WDR82,GLYCTK,PBRM1,PBRM1,STAB1	NISCH,NT5DC2	NA	NA	NA	NA	NT5DC2	33884	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	52704686	52705129	52704984	Y	WDR82,GLYCTK,TMEM110,PRKCD,PBRM1	GNL3,PBRM1,SPCS1,GLT8D1	NA	NA	NA	NA	GNL3	8043	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	53270281	53270430	53270371	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	17638	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	53304049	53304491	53304265	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	15981	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	53342432	53342824	53342628	Y	NA	DCP1A	NA	NA	NA	NA	DCP1A	36830	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	53360286	53360418	53360351	Y	NA	DCP1A	NA	NA	NA	NA	DCP1A	19236	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	54990078	54990247	54990161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15P5	331836	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	55103844	55104087	55103966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNT5A	417886	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr3	55194265	55194440	55194343	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	327533	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	55194450	55194988	55194909	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	326985	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr3	55223485	55223775	55223588	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2,C3orf51	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	298198	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr3	55224453	55224624	55224517	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2,C3orf51	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	297349	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr3	55511418	55511654	55511489	Y	WNT5A	WNT5A	NA	NA	NA	NA	WNT5A	10319	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	55517501	55517653	55517577	Y	NA	WNT5A	NA	NA	NA	NA	WNT5A	4320	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	55518078	55518594	55518516	Y	WNT5A	WNT5A	NA	NA	NA	NA	WNT5A	3379	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr3	55654086	55654842	55654426	Y	NA	NA	WNT5A	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	132113	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	56864313	56864691	56864516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM208A	149048	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	56925207	56925322	56925265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA12	167147	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	57779621	57779638	57779630	Y	FAM116A,SLMAP	SLMAP	NA	NA	NA	NA	SLMAP	40444	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	57874517	57874643	57874579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLNB	117484	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	58218436	58218533	58218485	Y	ABHD6	ABHD6	FLNB,DNASE1L3,ABHD6	IMR90	Hi-C	24141950	ABHD6	2700	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	58412465	58412623	58412544	Y	NA	PDHB	NA	NA	NA	NA	PDHB	4961	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	59320352	59320846	59320638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	286542	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	59803830	59804011	59803964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	770020	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr3	62422700	62423042	62422978	Y	C3orf14,FEZF2,CADPS	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	69695	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr3	62780450	62780695	62780574	Y	CADPS	NA	NA	NA	NA	NA	CADPS	78359	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr3	64147375	64147623	64147507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD6	139717	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	65831008	65831290	65831149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	191219	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	66491612	66491762	66491706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG1	57925	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	69790676	69790712	69790690	Y	MITF	MITF	NA	NA	NA	NA	MITF	4090	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	71439009	71439199	71439166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	191941	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	71465988	71466289	71466193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	164851	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	72977666	72978074	72977791	Y	RYBP	GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	FTH1P23	1471	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	73049169	73049333	73049244	Y	PPP4R2,EBLN2	PPP4R2	NA	NA	NA	NA	PPP4R2	5233	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	73697614	73697785	73697708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC75P1	467172	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	75472638	75472968	75472803	Y	NA	FAM86DP	NA	NA	NA	NA	FAM86DP	9293	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	78934560	78934824	78934693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	880141	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	86999128	86999300	86999212	Y	CHMP2B	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP2B	275121	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	89163442	89163800	89163560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P5	515231	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	95797016	95797346	95797181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPKP4	269052	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPKP4	269654	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	98505158	98505735	98505540	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	112798	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	98681428	98681771	98681644	Y	DCBLD2	LINC00973	MIR548G,COL8A1,DCBLD2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00973	16131	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	98685741	98686133	98685825	Y	NA	LINC00973	DCBLD2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00973	11769	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	4.93993124052886
chr3	98689970	98690253	98690112	Y	DCBLD2	LINC00973	DCBLD2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00973	7649	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	98691142	98691300	98691170	Y	DCBLD2	LINC00973	DCBLD2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00973	6602	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	100244695	100244934	100244873	Y	NA	TMEM45A	NA	NA	NA	NA	TMEM45A	35232	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	101444542	101444901	101444615	Y	FAM55C,FAM55C,CEP97	RPL24,CEP97	NA	NA	NA	NA	CEP97	3773	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	111329542	111329937	111329641	Y	NA	ZBED2	NA	NA	NA	NA	ZBED2	17252	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	111454124	111454225	111454190	Y	C3orf52,PHLDB2	PHLDB2	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	4780	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr3	111480028	111480653	111480348	Y	NA	PHLDB2	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	30684	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	111481970	111482358	111482172	Y	PHLDB2	PHLDB2	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	32626	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	111484180	111484533	111484208	Y	NA	PHLDB2	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	34836	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	111623667	111623869	111623803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	71988	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr3	111655124	111655265	111655201	Y	NA	ABHD10	NA	NA	NA	NA	ABHD10	40592	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	112372486	112372667	112372577	Y	NA	CCDC80	CCDC80,CD200R1L	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC80	6109	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	112395778	112395997	112395824	Y	CCDC80	CCDC80	CCDC80	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC80	29401	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	114349924	114350199	114350024	Y	ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	513919	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	114563365	114563725	114563545	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	300393	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	114813239	114813371	114813303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	50747	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	119146429	119146829	119146680	Y	ARHGAP31,CD80,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	38848	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	119809073	119809433	119809278	Y	NA	GSK3B	NA	NA	NA	NA	GSK3B	1831	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	120277715	120278240	120277932	Y	NA	NDUFB4	FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB4	34916	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr3	120279186	120279582	120279384	Y	NA	NDUFB4	FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB4	33574	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	120857899	120858271	120857953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5L	232980	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	121539764	121539854	121539811	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	12072	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	122201925	122202222	122202174	Y	NA	KPNA1	NA	NA	NA	NA	KPNA1	29570	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	123324068	123324437	123324253	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	21679	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	123407272	123407514	123407399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	104883	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	124531464	124532111	124531823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UMPS	84251	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	124553626	124554125	124554004	Y	KALRN	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	64140	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr3	124604448	124604779	124604703	Y	NA	ITGB5	NA	NA	NA	NA	ITGB5	13486	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	124605050	124605342	124605178	Y	ITGB5	ITGB5	NA	NA	NA	NA	ITGB5	12923	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr3	126292509	126292856	126292714	Y	NA	TXNRD3NB	NA	NA	NA	NA	TXNRD3NB	32542	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	126359707	126359720	126359714	Y	NA	TXNRD3NB,TXNRD3	NA	NA	NA	NA	TXNRD3	12278	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	126391611	126391660	126391640	Y	NA	TXNRD3,CHCHD6	NA	NA	NA	NA	TXNRD3	19613	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	126630341	126630598	126630469	Y	ZXDC	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	209278	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	280334	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	126945882	126946306	126946211	Y	MCM2	NA	NUP210P1	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	368760	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	128135736	128135843	128135790	Y	GATA2,GATA2,GATA2,C3orf27,DNAJB8	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475N22.4	70212	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	128475272	128475670	128475352	Y	RAB7A,ISY1,CNBP	RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	6191	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	128745839	128746109	128746044	Y	NA	KIAA1257	NA	NA	NA	NA	KIAA1257	26306	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	130558055	130558328	130558247	Y	NA	ATP2C1	NA	NA	NA	NA	ATP2C1	9111	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	131854898	131855187	131855050	Y	NA	NA	CPNE4	IMR90	Hi-C	24141950	RPL7P16	105922	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	134357896	134357929	134357912	Y	NA	EPHB1	NA	NA	NA	NA	EPHB1	43253	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	136533824	136534225	136534025	Y	NA	RP11-85F14.5,NCK1	NA	NA	NA	NA	RP11-85F14.5	44671	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	137990064	137990319	137990141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMC8	85955	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr3	139018358	139018692	139018412	Y	FOXL2,C3orf72	NA	BPESC1	IMR90	Hi-C	24141950	COPB2	87882	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr3	139028849	139029030	139028940	Y	NA	NA	BPESC1,FOXL2,C3orf72,MRPS22,COPB2	IMR90	Hi-C	24141950	COPB2	77544	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr3	139491345	139491740	139491614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMNAT3	96486	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	141118771	141119120	141118811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	77716	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr3	141126018	141126305	141126087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	77584	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	141129371	141129776	141129494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	74113	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	141319185	141319480	141319327	Y	RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	115296	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	143828914	143829061	143828972	Y	C3orf58,C3orf58	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf58	140274	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	146031799	146032049	146031857	Y	PLSCR4	NA	PLOD2	IMR90	Hi-C	24141950	PLSCR4	64833	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	147142201	147142415	147142327	Y	ZIC4,ZIC4,ZIC4,ZIC1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P20	740670	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	148704982	148705163	148705084	Y	NA	GYG1	HLTF,GYG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GYG1	1965	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	149104739	149105065	149104981	Y	COMMD2,TM4SF1	TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF1	11087	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr3	149657313	149657850	149657694	Y	TSC22D2,RNF13	NA	NA	NA	NA	NA	PFN2	108725	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	149665014	149665210	149665089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFN2	101365	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	150089534	150090066	150089791	Y	NA	TSC22D2	TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D2	34056	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr3	150417166	150417289	150417212	Y	NA	RP11-103G8.2	NA	NA	NA	NA	RP11-103G8.2	2062	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	152371360	152371697	152371555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1	411743	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	152856443	152856813	152856615	Y	RAP2B	RAP2B	RAP2B	MCF7	ChIA-PET	22265404	RAP2B	21216	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	156202207	156202259	156202239	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1	NA	NA	NA	NA	NA	SSR3	68714	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	156527707	156527883	156527795	Y	NA	PA2G4P4,LEKR1	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	1186	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	156558833	156558838	156558836	Y	NA	PA2G4P4,LEKR1	NA	NA	NA	NA	LEKR1	17563	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	156846039	156846735	156846192	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1,CCNL1	CCNL1	NA	NA	NA	NA	CCNL1	29814	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	156847368	156847750	156847738	Y	NA	CCNL1	NA	NA	NA	NA	CCNL1	28799	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	159538960	159539273	159539207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC4	575789	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	159572503	159572920	159572729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC4	542142	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	159597816	159598076	159597925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC4	516986	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	165170950	165171293	165171108	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCHE	381967	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	165215447	165215733	165215492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCHE	337527	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.84216874263356
chr3	165215973	165216343	165216172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCHE	336917	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	165217698	165218028	165217864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCHE	335232	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	169482089	169482431	169482154	Y	NA	TERC,MYNN,LRRC34	NA	NA	NA	NA	TERC	1241	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	171870963	171871593	171871291	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	115545	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	172344996	172345137	172345044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCEH1	81871	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	172467147	172467552	172467259	Y	NA	NCEH1,ECT2,RNU4-4P	NCEH1,ECT2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ECT2	675	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr3	172510084	172510259	172510171	Y	NA	ECT2,RNU4-4P	NA	NA	NA	NA	RNU4-4P	2089	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	177075253	177075542	177075439	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	161992	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	178671519	178671916	178671775	Y	NA	NA	KCNMB2	IMR90	Hi-C	24141950	ZMAT3	116151	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	LRRFIP1P1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1P1	1287	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	179309053	179309431	179309273	Y	NA	ACTL6A,MRPL47,NDUFB5	NA	NA	NA	NA	MRPL47	11011	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	179471930	179472312	179472121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP13	103387	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	182645862	182646115	182645990	Y	MCF2L2,MCCC1	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	55626	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr3	182887417	182887606	182887510	Y	KLHL6,LAMP3,B3GNT5	NA	NA	NA	NA	NA	MCCC1	55554	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	182930309	182930644	182930583	Y	ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	38388	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	183003579	183004143	183003750	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	34547	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	183088664	183088916	183088772	Y	B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L2	55650	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	185339016	185339200	185339107	Y	NA	SENP2	NA	NA	NA	NA	SENP2	40732	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	185374091	185374577	185374335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP2	75807	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	187459288	187459644	187459469	Y	RTP4,BCL6,BCL6,BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	1871	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	187988232	187988684	187988401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	118387	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	188065570	188065751	188065619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	195725	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	188618525	188618672	188618589	Y	NA	TPRG1-AS1	NA	NA	NA	NA	TPRG1-AS1	44756	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	189794828	189795104	189794939	Y	NA	LEPREL1	NA	NA	NA	NA	LEPREL1	43122	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	190104242	190104447	190104367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLDN1	65978	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	192605604	192605670	192605648	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	28280	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr3	192648009	192648157	192648101	Y	MB21D2	MB21D2	MB21D2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MB21D2	14059	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRASLS	83126	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	193851636	193853009	193852912	Y	ATP13A3,HES1	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr3	193858651	193858843	193858731	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	6717	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	193859199	193859624	193859359	Y	TMEM44	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	7265	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr3	194247870	194248550	194248205	Y	HES1,ATP13A3	ATP13A3	ATP13A3,GP5,TMEM44,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	ATP13A3	30777	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	194871039	194871493	194871089	Y	FAM43A,C3orf21	XXYLT1-AS2	NA	NA	NA	NA	XXYLT1-AS2	4439	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr3	194898663	194899282	194898930	Y	NA	XXYLT1-AS2	NA	NA	NA	NA	XXYLT1-AS2	32063	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	194981425	194981579	194981527	Y	ACAP2	XXYLT1	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	8317	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	195891844	195892227	195892035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFRC	84784	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	196635737	196635948	196635847	Y	UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5	SENP5,NCBP2	NA	NA	NA	NA	NCBP2	31520	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	196696811	196697020	196696957	Y	LRRC33,PIGZ	NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1	NA	NA	NA	NA	PIGZ	2880	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr3	196761683	196762044	196761813	Y	NA	AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2	MFI2-AS1,MFI2	IMR90	Hi-C	24141950	MFI2	6996	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr3	197439165	197439566	197439302	Y	IQCG,LRCH3,KIAA0226	MIR922,FYTTD1,KIAA0226	NA	NA	NA	NA	FYTTD1	22484	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr3	197478210	197478491	197478305	Y	IQCG,KIAA0226,FYTTD1,FYTTD1,LRCH3	FYTTD1,KIAA0226,LRCH3	NA	NA	NA	NA	KIAA0226	3612	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	1875191	1875366	1875328	Y	NA	LETM1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	WHSC1	4040	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	1966776	1967112	1967086	Y	WHSC1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf48	74577	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr4	2173906	2174201	2174078	Y	NA	NA	NAT8L,C4orf48	IMR90	Hi-C	24141950	POLN	67647	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	2414575	2415364	2414914	Y	HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160	ZFYVE28,RNF4	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	3026	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	2415721	2415975	2415729	Y	HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160	ZFYVE28,RNF4	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	2415	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr4	2538945	2539718	2539367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	76998	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	3228357	3228568	3228469	Y	SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,RGS12	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	64187	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	3293872	3294174	3294028	Y	NA	RGS12	RGS12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS12	1117	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr4	3438789	3438989	3438900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	93297	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	7846072	7846237	7846145	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1-AS1	92255	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr4	8254530	8254695	8254600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3TC1	72731	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	9154755	9155069	9154900	Y	NA	FAM86KP	NA	NA	NA	NA	FAM86KP	1733	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr4	12642016	12642195	12642111	Y	NA	RP11-352E6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	1755	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	13483063	13483398	13483224	Y	NA	RAB28	NA	NA	NA	NA	RAB28	591	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	15655935	15656313	15656300	Y	FBXL5,BST1	FAM200B,FBXL5	NA	NA	NA	NA	FAM200B	24972	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	15757957	15758240	15758119	Y	FBXL5,TAPT1,CD38	RP11-115L11.1	C1QTNF7,CD38,FGFBP2,PROM1,CC2D2A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115L11.1	26707	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	24471602	24472014	24471897	Y	NA	NA	PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	112159	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	24660007	24660225	24660117	Y	NA	ATP5LP3	CCDC149,MIR573	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5LP3	2009	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	25175369	25175577	25175408	Y	NA	SEPSECS,PI4K2B	NA	NA	NA	NA	PI4K2B	15106	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	33937784	33937916	33937850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	2306215	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	37581972	37582372	37582240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELL1	103626	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	37668347	37668621	37668474	Y	NA	RELL1	NA	NA	NA	NA	RELL1	17377	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	38162520	38162833	38162765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	202464	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr4	38665008	38665204	38665059	Y	TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	504	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	38859134	38859762	38859410	Y	KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6	FAM114A1	NA	NA	NA	NA	FAM114A1	7536	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr4	40992630	40993044	40992776	Y	APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	223687	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	40997224	40997582	40997567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	219149	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	41162074	41162440	41162321	Y	APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	54291	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr4	48532180	48532355	48532269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLAIN2	190841	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	53725752	53726074	53725904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP46-AS1	202179	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	54794044	54794386	54794192	Y	NA	NA	SCFD2,PDGFRA,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	134471	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr4	56323586	56323848	56323646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM165	63462	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	56453376	56453745	56453528	Y	NA	CLOCK,NMU	NA	NA	NA	NA	CLOCK	42071	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	57152895	57152955	57152925	Y	KIAA1211,ARL9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP31	67346	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	57937505	57937813	57937783	Y	NA	IGFBP7	NA	NA	NA	NA	IGFBP7	36738	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	66960590	66960760	66960693	Y	NA	RP11-396M11.1	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	2746	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	67430351	67431255	67431078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	472507	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	76750745	76750859	76750802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USO1	102968	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	77133814	77134170	77133987	Y	NAAA,CXCL10,CXCL11	SCARB2,FAM47E	NA	NA	NA	NA	FAM47E	621	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	77500789	77501039	77500904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM47E	367596	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	78823537	78823752	78823560	Y	NA	MRPL1	NA	NA	NA	NA	MRPL1	41863	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	79628455	79628752	79628612	Y	NA	NA	LOC100505702,BMP2K	IMR90	Hi-C	24141950	BMP2K	66744	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	81048415	81048773	81048660	Y	ANTXR2,PRDM8	ANTXR2	PAQR3,ANTXR2,PRDM8,FGF5	IMR90	Hi-C	24141950	ANTXR2	3807	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	83912303	83912539	83912423	Y	NA	LIN54,COPS4	NA	NA	NA	NA	LIN54	19540	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	87835479	87835856	87835675	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	AFF1	18298	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr4	87960081	87960248	87960138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TECRP1	90805	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	88074850	88075090	88074969	Y	DSPP	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL8	84376	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	88943044	88943294	88943160	Y	NA	RNU1-36P,PKD2	NA	NA	NA	NA	PKD2	16224	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	99496519	99496626	99496526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN5	81154	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	106064596	106064807	106064750	Y	NA	TET2	TET2	K562	ChIA-PET	22265404	TET2	225	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	107911210	107911467	107911339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBCK	670558	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	108631161	108631506	108631267	Y	SGMS2,SGMS2	PAPSS1	NA	NA	NA	NA	PAPSS1	8102	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	110449545	110449722	110449703	Y	SEC24B	CCDC109B	CCDC109B	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC109B	29639	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	114355245	114355627	114355568	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	15766	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	114389425	114389805	114389547	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	49946	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	2178	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	4.11660936710739
chr4	122606332	122606884	122606598	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	9384	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	122703678	122703696	122703687	Y	NA	EXOSC9,CCNA2	NA	NA	NA	NA	EXOSC9	16776	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	123074024	123074337	123074286	Y	KIAA1109,IL21,IL2	KIAA1109	KIAA1109	K562	ChIA-PET	22265404	KIAA1109	2536	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	125634465	125634726	125634691	Y	NA	ANKRD50	NA	NA	NA	NA	ANKRD50	2578	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	126016723	126016735	126016730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD50	384836	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	127487763	127488061	127487932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTU	1054365	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	127699482	127699754	127699681	Y	NA	NA	FAT4	IMR90	Hi-C	24141950	INTU	842672	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	10.4287437300054
chr4	128752654	128753022	128752839	Y	HSPA4L	PLK4	NA	NA	NA	NA	PLK4	46994	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	129088221	129088417	129088319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARP1B	107798	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	129254148	129254471	129254310	Y	NA	PGRMC2	PHF17,LARP1B	IMR90	Hi-C	24141950	PGRMC2	46164	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	129494967	129495325	129495148	Y	NA	NA	LARP1B,PHF17,PGRMC2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PGRMC2	286983	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	130012970	130013118	130013063	Y	PHF17,SCLT1,C4orf33	C4orf33,SCLT1	NA	NA	NA	NA	SCLT1	206	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	140235316	140235657	140235500	Y	ELF2,RAB33B	NAA15,NDUFC1	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	13611	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	144271294	144271615	144271412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA5	161001	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	145975837	145976119	145976108	Y	NA	ABCE1,ANAPC10	NA	NA	NA	NA	ABCE1	40965	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	146101946	146102251	146102199	Y	NA	OTUD4	ABCE1	K562	ChIA-PET	22265404	OTUD4	2633	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	146229939	146230027	146229996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN3P1	64668	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	146656396	146656737	146656614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAA	118981	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	148768906	148769305	148769088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	117692	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	150977820	150977939	150977880	Y	NA	DCLK2	DCLK2	IMR90	Hi-C	24141950	DCLK2	19487	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	151155902	151156274	151156088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLK2	158476	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	153717992	153718074	153718038	Y	NA	TIGD4,ARFIP1	NA	NA	NA	NA	ARFIP1	18903	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	157811355	157811573	157811537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFC	78973	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	157868046	157868334	157868214	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	22212	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	157870715	157871133	157870964	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	19413	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr4	159592059	159592445	159592194	Y	NA	ETFDH,C4orf46	NA	NA	NA	NA	C4orf46	652	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	164414222	164414415	164414319	Y	TKTL2,C4orf43	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	328149	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	165331650	165331803	165331757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACA3P	530639	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	170132939	170133158	170133049	Y	SH3RF1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	57098	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	177016328	177016622	177016475	Y	NA	WDR17	NA	NA	NA	NA	WDR17	31343	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	185077365	185077675	185077519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	316059	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	185186820	185187542	185187472	Y	IRF2,CASP3	NA	IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2	206192	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	185609676	185609967	185609740	Y	NA	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	41013	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	186227102	186227608	186227442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD37	87567	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr4	186495067	186495245	186495187	Y	NA	PDLIM3	NA	NA	NA	NA	PDLIM3	40301	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	187543398	187543695	187543547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAT1	102181	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	187614690	187615080	187614853	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	30796	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	14.5453530971128
chr4	187621819	187622251	187622136	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	23625	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr4	187762182	187762435	187762391	Y	NA	RP11-11N5.1	FAT1,LOC339975	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-11N5.1	47688	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr4	187766570	187766763	187766651	Y	NA	RP11-11N5.1	FAT1,LOC339975	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-11N5.1	43360	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr4	187834148	187834163	187834155	Y	NA	RP11-11N5.1	FAT1,LOC339975	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-11N5.1	24025	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr4	190197516	190197817	190197669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	431051	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	373695	374160	373984	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67098	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	379590	379862	379712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	61396	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr5	399875	400445	400189	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40813	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr5	413817	414070	413960	Y	NA	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	27188	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	672237	672545	672500	Y	EXOC3,CEP72	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18965	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18174	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	4.11660936710739
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	93141	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	4.39104999158121
chr5	1536479	1536809	1536604	Y	SLC12A7,LPCAT1	LPCAT1	SLC6A3	IMR90	Hi-C	24141950	LPCAT1	14387	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	5026027	5026363	5026168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS16	112080	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	5311411	5311643	5311527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	107134	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	81417	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	7.13545623631947
chr5	6775804	6775859	6775832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	144348	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	9263136	9263299	9263224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA5A	280888	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	10229611	10229778	10229690	Y	NA	FAM173B,CCT5	NA	NA	NA	NA	FAM173B	18231	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	10422961	10423316	10423021	Y	NA	ROPN1L	NA	NA	NA	NA	ROPN1L	16320	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	10631579	10631933	10631756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD33B	69137	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	10733059	10733302	10733226	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	26082	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	10743646	10743952	10743932	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	15432	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	14011107	14011342	14011264	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	68455	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	14035955	14036534	14036234	Y	TRIO	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	93303	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	14142332	14142650	14142445	Y	NA	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	521	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	14142803	14143164	14142969	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	992	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	14154284	14154671	14154327	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	12473	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.74440624473826
chr5	14185691	14186191	14185984	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	43880	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	14186205	14186627	14186374	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	44394	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	14264855	14265210	14264930	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	123044	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr5	14268390	14268821	14268476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	126579	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.01884686921208
chr5	14404233	14404452	14404428	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105A	175432	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	14408020	14408375	14408038	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105A	171509	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	14758065	14758328	14758197	Y	NA	RBBP4P1	NA	NA	NA	NA	RBBP4P1	38181	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	14809867	14810211	14810035	Y	FAM105A,FAM105B	RBBP4P1	NA	NA	NA	NA	RBBP4P1	13358	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	16577761	16577949	16577853	Y	NA	FAM134B	NA	NA	NA	NA	FAM134B	37218	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	100032	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	16855522	16855861	16855692	Y	NA	CTB-55B8.1	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	44889	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	16894604	16895174	16894829	Y	NA	CTB-55B8.1,MYO10	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	5576	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	18391290	18391435	18391363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP21	343631	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	1100991	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.74440624473826
chr5	29758752	29759069	29758903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL19P11	1292603	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	31459519	31459540	31459530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DROSHA	70763	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	31511930	31511946	31511938	Y	NA	DROSHA,C5orf22	NA	NA	NA	NA	DROSHA	18357	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	31894536	31894834	31894609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD2	257019	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	33442170	33442454	33442303	Y	NA	CTD-2203K17.1,TARS	NA	NA	NA	NA	TARS	3368	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	33789074	33789288	33789217	Y	ADAMTS12	NA	NA	NA	NA	NA	AMACR	216932	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	34658306	34658537	34658364	Y	RAI14,RAI14	RAI14	TTC23L	IMR90	Hi-C	24141950	RAI14	3964	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	34710052	34710312	34710173	Y	RAI14,RAI14	NA	NA	NA	NA	NA	RAI14	55710	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr5	34717862	34718081	34717968	Y	RAI14,RAI14	NA	NA	NA	NA	NA	RAI14	63520	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr5	36151218	36151404	36151252	Y	C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	1127	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr5	37615302	37615631	37615482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR70	237988	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	37771819	37772240	37771999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR70	394505	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	38467529	38467846	38467689	Y	NA	CTD-2263F21.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2263F21.1	1088	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	38968924	38969094	38969009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	103416	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	39207884	39208027	39207956	Y	RICTOR,FYB	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	135374	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	39716547	39716931	39716737	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	256145	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	41845041	41845055	41845050	Y	OXCT1,FBXO4	OXCT1	NA	NA	NA	NA	OXCT1	23566	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	41856929	41857024	41856977	Y	NA	OXCT1,C5orf51	NA	NA	NA	NA	OXCT1	11597	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	42994649	42995346	42995172	Y	NA	CTD-2035E11.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	21185	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	42999523	42999876	42999700	Y	NA	CTD-2035E11.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	16655	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr5	43034859	43034967	43034962	Y	NA	CTD-2035E11.3,ZNF131,CTD-2201E18.3	LOC648987	MCF7	ChIA-PET	22265404	CTD-2035E11.3	18328	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	43061828	43062062	43061945	Y	NA	CTD-2035E11.3,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	ZNF131	1216	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	49719324	49719499	49719409	Y	PARP8	EMB	NA	NA	NA	NA	EMB	17583	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	52023689	52023809	52023721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA1	57921	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	52155124	52155267	52155195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PELO	73350	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	54120977	54121197	54121092	Y	NA	NA	SNX18	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	309388	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	55654713	55655022	55654890	Y	NA	NA	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	143877	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	55655118	55655221	55655151	Y	NA	NA	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	143678	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	56784239	56784594	56784302	Y	GPBP1,ACTBL2	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	GPBP1	316464	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr5	57120821	57121296	57121146	Y	NA	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	PLK2	632791	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	58332286	58332474	58332297	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	578199	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	58421119	58421626	58421279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	667032	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	58426345	58426806	58426483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	672258	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	59917855	59917860	59917858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEPDC1B	76157	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	60526663	60526879	60526778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	99221	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	60597691	60598057	60597813	Y	NA	ZSWIM6	ZSWIM6,C5orf43	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZSWIM6	28043	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	60602715	60602916	60602849	Y	NA	ZSWIM6	ZSWIM6,C5orf43,NDUFAF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZSWIM6	23184	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	60629701	60630027	60629731	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	3601	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	60736184	60736544	60736365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	50486	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	60751661	60751965	60751750	Y	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	65963	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	64710773	64711167	64710966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPK	145831	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	65447669	65447962	65447814	Y	SREK1,SREK1	SREK1	NA	NA	NA	NA	SREK1	13870	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	67103829	67104163	67104152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	405385	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	71258617	71258625	71258621	Y	NA	NA	MAP1B	IMR90	Hi-C	24141950	MAP1B	142436	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	71462643	71462861	71462688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	61582	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	71659094	71659472	71659166	Y	NA	PTCD2,MRPS27	NA	NA	NA	NA	MRPS27	44621	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	72512311	72512636	72512493	Y	FOXD1	NA	FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM171	98192	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr5	72670335	72670728	72670600	Y	NA	NA	FOXD1,BTF3,FCHO2,TMEM171,TMEM174	IMR90	Hi-C	24141950	FOXD1	71624	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	72792808	72793048	72792966	Y	NA	BTF3	NA	NA	NA	NA	BTF3	575	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	73611863	73612159	73611974	Y	NA	NA	RGNEF,ENC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEXB	321689	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr5	73612322	73612454	73612340	Y	NA	NA	RGNEF,ENC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEXB	321394	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	74163639	74163858	74163748	Y	NA	FAM169A	GFM2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM169A	2863	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	74616844	74617109	74616992	Y	COL4A3BP,COL4A3BP	HMGCR	NA	NA	NA	NA	HMGCR	13045	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	74800476	74800595	74800536	Y	NA	POLK,COL4A3BP	NA	NA	NA	NA	POLK	4986	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	74861939	74862072	74862007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	55976	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	74862624	74863010	74862882	Y	ANKRD31,COL4A3BP,POLK,COL4A3BP,POC5	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	56661	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	75789158	75789213	75789186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQGAP2	92084	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	75875096	75875329	75875221	Y	IQGAP2,S100Z	NA	NA	NA	NA	NA	F2R	134539	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	76034658	76035100	76034908	Y	IQGAP2	F2R	NA	NA	NA	NA	F2R	24790	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr5	76086514	76086772	76086643	Y	F2R	F2RL1	NCRUPAR,F2R,IQGAP2	IMR90	Hi-C	24141950	F2RL1	25986	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	76086859	76087104	76086921	Y	F2R,F2RL1	F2RL1	NCRUPAR,F2R,IQGAP2	IMR90	Hi-C	24141950	F2RL1	25654	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	76102045	76102389	76102284	Y	F2RL1	F2RL1	F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R	IMR90	Hi-C	24141950	F2RL1	10369	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr5	76103019	76103387	76103332	Y	F2RL1	F2RL1	F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R	IMR90	Hi-C	24141950	F2RL1	9371	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr5	76110007	76110333	76110205	Y	NA	F2RL1	NA	NA	NA	NA	F2RL1	2425	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	77140620	77140840	77140736	Y	NA	TBCA	NA	NA	NA	NA	TBCA	21764	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	77779546	77779957	77779719	Y	AP3B1	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	125207	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	78095218	78095295	78095257	Y	NA	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	31374	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	78585055	78585206	78585119	Y	NA	CTC-451P13.1	NA	NA	NA	NA	CTC-451P13.1	6314	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	79428091	79428419	79428255	Y	SERINC5	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	121479	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	79543086	79543324	79543242	Y	ZFYVE16,SERINC5	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	6574	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr5	80263371	80263585	80263478	Y	NA	CTC-459I6.1	NA	NA	NA	NA	CTC-459I6.1	8645	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	80372631	80372748	80372736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-459I6.1	117905	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	2217	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	81319192	81319550	81319375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG10	53348	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	81653126	81653457	81653257	Y	RPS23	NA	ATP6AP1L,XRCC4,VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	80730	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.29328749368591
chr5	81655341	81655441	81655346	Y	NA	NA	VCAN,ATP6AP1L,XRCC4	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	82945	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	81692717	81693105	81692928	Y	NA	NA	VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	120321	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	81934356	81934439	81934367	Y	NA	NA	VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	361960	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	82005927	82005935	82005931	Y	ATP6AP1L	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC4	365382	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	82768927	82769141	82769084	Y	VCAN	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	397245	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	82770174	82770695	82770300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	398492	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	85654132	85654483	85654435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX7C	257238	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	86653612	86653965	86653789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNH	52871	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	86667091	86667409	86667357	Y	NA	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	39427	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	87959441	87959829	87959592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM161B	396148	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	90485915	90486074	90486029	Y	ARRDC3	NA	GPR98,ARRDC3,LOC100129716	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-90P	78470	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	90679835	90680013	90679955	Y	ARRDC3	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	2659	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	94843632	94843977	94843805	Y	NA	TTC37,ARSK	NA	NA	NA	NA	TTC37	44734	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	95048086	95048445	95048385	Y	NA	RHOBTB3,CTD-2154I11.2	RHOBTB3,ARSK,SPATA9,RFESD	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RHOBTB3	860	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	95094861	95094991	95094889	Y	NA	RHOBTB3,CTD-2154I11.2	GLRX	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2154I11.2	28862	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr5	95113820	95114121	95113969	Y	NA	CTD-2154I11.2,GLRX	NA	NA	NA	NA	GLRX	42588	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr5	95633075	95633361	95633245	Y	GLRX	NA	ELL2,RHOBTB3,MIR583,GLRX,C5orf27,CAST	IMR90	Hi-C	24141950	CAST	225610	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM174A	480164	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr5	102091646	102092087	102091846	Y	NA	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	3961	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	106078046	106078054	106078050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	926542	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	106724874	106725113	106725059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	279483	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	106855785	106855959	106855826	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	148637	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	108992541	108993001	108992730	Y	MAN2A1	MAN2A1	NA	NA	NA	NA	MAN2A1	30066	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	112825129	112825430	112825300	Y	NA	MCC,YTHDC2	NA	NA	NA	NA	MCC	2602	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	114797286	114797501	114797397	Y	PGGT1B,TICAM2,FEM1C	NA	NA	NA	NA	NA	FEM1C	81090	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	114847596	114847935	114847760	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	30656	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr5	114848957	114849251	114849109	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	29340	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	115420076	115420175	115420113	Y	LOC644100	CTD-2287O16.1,COMMD10	NA	NA	NA	NA	COMMD10	1388	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	118610393	118610883	118610628	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	8006	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	124748569	124748778	124748675	Y	NA	NA	ZNF608	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-436H11.1	605643	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	126847905	126848122	126848004	Y	NA	PRRC1	PRRC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PRRC1	3179	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr5	131074214	131074509	131074363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP1	56201	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	131833441	131833717	131833513	Y	IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8951	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AFF4	26161	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr5	132792857	132792990	132792924	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA4	407203	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	133453722	133453957	133453840	Y	PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7	NA	NA	NA	NA	TCF7	5320	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	NA	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIPNL	55877	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	133847692	133847829	133847767	Y	NA	NA	PHF15,CDKN2AIPNL,CDKL3,UBE2B,SKP1,PPP2CA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIPNL	102103	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	133863130	133863560	133863438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2AIPNL	117541	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	133864116	133864195	133864168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24A	118284	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	133891612	133892163	133891823	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24A	90316	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	135352622	135352730	135352676	Y	NA	TGFBI	VTRNA2-1,TGFBI	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBI	9854	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	135353008	135353244	135353057	Y	NA	TGFBI	VTRNA2-1,TGFBI	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBI	9340	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	136374592	136374995	136374792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	183275	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	136482104	136482426	136482383	Y	SPOCK1	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	290787	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.29328749368591
chr5	136770007	136770201	136770104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOCK1	161867	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	136795919	136796307	136796181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOCK1	135761	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	136833088	136833480	136833319	Y	KLHL3,SPOCK1	NA	NA	NA	NA	NA	SPOCK1	98588	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	4.11660936710739
chr5	137810438	137810840	137810496	Y	NA	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	11259	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	137822279	137822351	137822306	Y	NA	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	23100	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	137868208	137868538	137868536	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	8451	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	137881069	137881276	137881109	Y	WNT8A,FAM53C,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	4080	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	138127302	138127500	138127374	Y	NA	AC034243.1	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	40304	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	138248139	138248403	138248239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	161141	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	138277949	138278244	138278038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	190951	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	138620359	138620541	138620439	Y	UBE2D2,MATR3	MATR3,SIL1	NA	NA	NA	NA	SIL1	6705	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	138897527	138897822	138897662	Y	MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2	UBE2D2	DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2D2	6194	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	59087	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	139629538	139629745	139629587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN1	50961	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	139631101	139631601	139631302	Y	SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	49105	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr5	139782360	139782578	139782471	Y	NA	ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3	NA	NA	NA	NA	ANKHD1-EIF4EBP3	2867	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	140420005	140420137	140420073	Y	NA	NA	PCDHA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PCDHB9	144756	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	140983787	140984197	140984031	Y	PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1	DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1	NA	NA	NA	NA	DIAPH1	12425	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	141056831	141057056	141056944	Y	NA	HDAC3,RELL2,FCHSD1,ARAP3	NA	NA	NA	NA	ARAP3	2732	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	141375136	141375383	141375261	Y	NA	RNF14,GNPDA1	NA	NA	NA	NA	GNPDA1	15223	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	141684732	141684818	141684775	Y	PCDH1,SPRY4	AC005592.2,SPRY4	NA	NA	NA	NA	AC005592.2	18040	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	141706626	141706892	141706857	Y	NA	AC005592.2,SPRY4	NA	NA	NA	NA	SPRY4	2606	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	141736379	141736797	141736670	Y	ARHGAP26	AC005592.2,SPRY4	NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPRY4	32359	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr5	141825669	141826086	141825870	Y	SPRY4	NA	NDFIP1,SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	121649	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	141917041	141917377	141917209	Y	NA	NA	NDFIP1,SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	213021	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	142105384	142105400	142105392	Y	FGF1	ARHGAP26	ARHGAP26,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP26	42549	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	142690864	142691375	142691192	Y	NR3C1,NR3C1	RPL7P21	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	18795	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	143361363	143361664	143361514	Y	NA	NA	ARHGAP26,YIPF5	IMR90	Hi-C	24141950	YIPF5	186614	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	145326011	145326414	145326305	Y	NA	SH3RF2	NA	NA	NA	NA	SH3RF2	11869	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	145356389	145356594	145356491	Y	NA	SH3RF2	NA	NA	NA	NA	SH3RF2	42247	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	145455339	145455700	145455520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	104523	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr5	148172345	148172765	148172447	Y	FBXO38,ADRB2	ADRB2	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	31391	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	148293572	148293925	148293745	Y	NA	NA	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	89416	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	148835583	148835880	148835720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1	93127	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	149111581	149111664	149111645	Y	NA	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	3720	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	149111957	149112473	149112231	Y	AFAP1L1,IL17B,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	4096	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	149422019	149422297	149422100	Y	NA	HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	TIGD6	43289	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	149853688	149853975	149853788	Y	NA	RPS14,NDST1,CTC-367J11.1	SYNPO,MYOZ3,C5orf62,RPS14,NDST1,DCTN4,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	NDST1	9406	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	150086779	150087134	150086956	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4	RBM22,DCTN4	MYOZ3,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	RBM22	8110	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	150142965	150143377	150143063	Y	CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62	DCTN4	DCTN4,C5orf62	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	DCTN4	6294	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	150159490	150160262	150159991	Y	CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62	DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	22819	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.46996562026443
chr5	150161319	150161633	150161505	Y	ANXA6,C5orf62	DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	24648	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr5	150163031	150163501	150163387	Y	TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,C5orf62	DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	26360	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	150169826	150170319	150169982	Y	CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62	DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	33155	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr5	150261861	150262245	150261884	Y	IRGM	ZNF300	NA	NA	NA	NA	ZNF300	20300	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	150873344	150873758	150873456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A1	58737	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	151129219	151129502	151129338	Y	SLC36A1	RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1	NA	NA	NA	NA	RP11-54C4.1	14437	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	151213355	151213633	151213423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	63262	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	154205315	154205569	154205444	Y	KIF4B,GEMIN5	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	29544	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.19552499579061
chr5	156224453	156224847	156224837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAVCR2	343033	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	156814689	156815040	156814693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	123600	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	156883361	156883688	156883515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM19	117095	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	156891501	156891799	156891609	Y	HAVCR2,ADAM19,NIPAL4	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM19	108984	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	156913799	156914134	156913967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM19	86649	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	156939273	156939536	156939403	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM19	61247	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	156968105	156968405	156968157	Y	NA	ADAM19	NA	NA	NA	NA	ADAM19	32378	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	157001390	157002014	157001697	Y	HAVCR2,NIPAL4,ADAM19	ADAM19	NA	NA	NA	NA	ADAM19	607	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	158380752	158381154	158381061	Y	RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B,EBF1	NA	NA	NA	NA	NA	EBF1	143615	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	158876999	158877252	158877089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBLCP1	188910	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	159592617	159593055	159592885	Y	NA	PWWP2A	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PWWP2A	48187	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	165368771	165369154	165368963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P20	85162	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	167126470	167126930	167126675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	589726	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	167343894	167343960	167343927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	372696	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	167909535	167909826	167909541	Y	NA	RARS	RARS	IMR90	Hi-C	24141950	RARS	1624	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	168588352	168588495	168588423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-575D19.1	547035	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	169398141	169398453	169398335	Y	NA	FAM196B	NA	NA	NA	NA	FAM196B	7291	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	169398752	169398877	169398815	Y	NA	FAM196B	NA	NA	NA	NA	FAM196B	6867	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	169404223	169404546	169404350	Y	FAM196B	FAM196B	NA	NA	NA	NA	FAM196B	1198	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	169998509	169998839	169998651	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNIP1	220018	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.46996562026443
chr5	171326428	171326478	171326475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW11	105399	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	171602273	171602685	171602548	Y	STK10	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	10705	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	171681735	171682053	171681977	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	27022	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr5	172160417	172160946	172160788	Y	ATP6V0E1	DUSP1	ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	35252	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.19552499579061
chr5	172167900	172168183	172168030	Y	UBTD2,DUSP1	DUSP1	ERGIC1,DUSP1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	28015	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr5	172192263	172193766	172192583	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2432	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	172193800	172194232	172193914	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	1966	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	172208951	172208972	172208964	Y	UBTD2	DUSP1	ERGIC1,DUSP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	12753	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	172380663	172381064	172380838	Y	ERGIC1,ATP6V0E1	RPL26L1,ATP6V0E1	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	2668	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	172882283	172882785	172882503	Y	NA	NA	LOC285593,STC2,BOD1,NKX2-5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STC2	127777	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	173031200	173031306	173031275	Y	NA	BOD1	NA	NA	NA	NA	BOD1	10357	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	173191567	173191754	173191643	Y	CPEB4	NA	CPEB4,C5orf47	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	121529	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	173193377	173193650	173193560	Y	NA	NA	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	119633	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr5	173205115	173205307	173205218	Y	CPEB4	NA	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	107976	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	173391031	173391183	173391109	Y	HMP19	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB4	77748	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	173572937	173573111	173573024	Y	HMP19	NA	HMP19	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-267A15.1	188187	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	173815215	173815442	173815329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-267A15.1	53917	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	175930554	175930566	175930560	Y	RNF44	RNF44	NA	NA	NA	NA	RNF44	32460	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	177645267	177645446	177645363	Y	N4BP3,CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15759	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	178034122	178034420	178034258	Y	ZNF354B,AGXT2L2,CLK4	CLK4	NA	NA	NA	NA	CLK4	21196	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr5	179496400	179496705	179496553	Y	NA	RNF130	NA	NA	NA	NA	RNF130	413	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	179496781	179497164	179497079	Y	HNRNPH1,MAML1,SQSTM1,RNF130	NA	NA	NA	NA	NA	RNF130	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	179718006	179718384	179718320	Y	NA	MAPK9	NA	NA	NA	NA	CTB-129O4.1	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr5	179894931	179895217	179894999	Y	NA	CNOT6	GFPT2,MAPK9,CNOT6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNOT6	24195	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	180072728	180073107	180073038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT6	153316	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	180616521	180617006	180616799	Y	ZFP62,TRIM52,TRIM41	TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr5	180634441	180634803	180634658	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	4148	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	2877769	2878087	2877933	Y	SERPINB9,NQO2,SERPINB1	SERPINB1	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	37529	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	3166310	3166878	3166542	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	10550	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr6	3230738	3231042	3230747	Y	NA	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	774	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	3254273	3254642	3254472	Y	SLC22A23	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	24309	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	3259939	3260435	3260206	Y	NA	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	29975	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	3308463	3308483	3308477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	78499	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	3317564	3317616	3317590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	87600	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	4358823	4359231	4358978	Y	CDYL	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	ECI2	224992	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	5179288	5179492	5179391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	79680	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	6503494	6503758	6503589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	602072	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	6713207	6713532	6713382	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	392298	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	7731119	7731407	7731310	Y	TXNDC5,TXNDC5,BMP6	BMP6	NA	NA	NA	NA	BMP6	6089	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	8083649	8083837	8083720	Y	NA	EEF1E1	NA	NA	NA	NA	EEF1E1	16974	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	10403752	10404250	10404030	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	13642	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	10825104	10825395	10825250	Y	ELOVL2	NA	NA	NA	NA	NA	SYCP2L	79077	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	10970926	10971179	10971053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYCP2L	224899	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	13391107	13391478	13391293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	64292	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	14211061	14211714	14211398	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD83	95189	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	15526544	15526623	15526553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	134666	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	6.03769373842417
chr6	16420932	16421664	16421198	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	184121	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	16588159	16588355	16588257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	171014	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	16607418	16607798	16607611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	151571	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	16690265	16690543	16690477	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	68826	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	16694939	16695287	16695185	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	64082	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	16729304	16729629	16729584	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	29740	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	16766520	16766751	16766672	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	ATXN1	K562	ChIA-PET	22265404	ATXN1	6798	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	16771345	16771373	16771363	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	ATXN1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ATXN1	11623	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	17614611	17614952	17614695	Y	KIF13A,NUP153,FAM8A1	FAM8A1	NA	NA	NA	NA	FAM8A1	16025	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	17715315	17715544	17715493	Y	NUP153	NUP153	NUP153,KIF13A	IMR90	Hi-C	24141950	NUP153	10659	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	18342517	18342875	18342695	Y	NA	NA	RNF144B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DEK	79463	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	20575670	20575691	20575681	Y	NA	CDKAL1	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	42982	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	21022706	21023638	21022736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	490018	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST1H3A	25645	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	26029019	26029363	26029242	Y	NA	HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H3B	925	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr6	26322637	26323123	26322876	Y	NA	HIST1H4H,BTN3A2	HIST1H1D,HIST1H4F,ABT1,HIST1H4G,HMGN4,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2BI,HIST1H3G,HCG11,HIST1H4I,HIST1H2BK	IMR90	Hi-C	24141950	HIST1H4H	38875	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	26437952	26438171	26438062	Y	HIST1H4G,BTN1A1	BTN3A1,BTN2A3P,BTN3A3,BTN2A1	NA	NA	NA	NA	BTN3A3	529	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	26521444	26521777	26521577	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	1368	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	27145729	27146130	27146023	Y	ZNF184	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	30893	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	27655687	27656083	27655918	Y	NA	NA	LOC100507173	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HIST1H2BL	117626	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	27807310	27807672	27807617	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BN	2987	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	28102608	28102781	28102677	Y	ZSCAN16	ZSCAN16	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	12270	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr6	30649746	30650798	30650074	Y	TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949	C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB	NA	NA	NA	NA	PPP1R18	2874	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	30720004	30720713	30720325	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	9673	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	30796195	30796565	30796398	Y	HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3	DDR1	IER3,FLOT1,DDR1,VARS2,GTF2H4,C6orf136,DHX16,C6orf15,PSORS1C1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DDR1	45633	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	31702368	31703528	31702658	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5	NA	NA	NA	NA	CLIC1	2012	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,SNORD52,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	32081652	32082042	32081917	Y	NA	ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8	NA	NA	NA	NA	ATF6B	11988	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	32982632	32982839	32982737	Y	HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,HLA-DOB,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,HLA-DOA	BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1,HLA-DOA	NA	NA	NA	NA	HLA-DOA	7243	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	33538378	33538887	33538702	Y	LEMD2,LEMD2,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	7132	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	34358644	34359014	34358829	Y	NA	NUDT3,RPS10	NA	NA	NA	NA	NUDT3	193	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	35035271	35035638	35035433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKS1A	180229	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	35268720	35268850	35268792	Y	TAF11,ZNF76,DEF6,PPARD	ZNF76,DEF6,PPARD	NA	NA	NA	NA	DEF6	5125	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	35311267	35311540	35311417	Y	ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD	DEF6,PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	2932	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr6	35336371	35336758	35336422	Y	NA	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	28036	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	35337950	35338511	35338285	Y	ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	29615	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.19552499579061
chr6	35445364	35445634	35445501	Y	RPL10A	FANCE,RPL10A,TEAD3	NA	NA	NA	NA	RPL10A	11179	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	36547678	36548077	36547769	Y	PI16,MTCH1	STK38,SRSF3	STK38,SRSF3,KCTD20,PXT1,MIR3925	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SRSF3	12068	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	37102324	37102775	37102642	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	33204	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr6	37104908	37105418	37105405	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	30561	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.29328749368591
chr6	37210643	37210874	37210721	Y	TMEM217,TMEM217	TBC1D22B	NA	NA	NA	NA	TBC1D22B	12674	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	38122967	38123257	38123161	Y	ZFAND3,BTBD9	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	337692	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	38185251	38185625	38185371	Y	BTBD9	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	399976	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	40965087	40965613	40965406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFYA	73071	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	41889955	41890338	41890119	Y	FRS3	USP49,MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	3029	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	42228452	42228568	42228527	Y	NA	MRPS10	NA	NA	NA	NA	MRPS10	44849	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	42306418	42306926	42306742	Y	UBR2,TRERF1	NA	NA	NA	NA	NA	TRERF1	110863	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr6	42515407	42515543	42515467	Y	NA	UBR2	TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBR2	14257	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	42898508	42898648	42898552	Y	NA	C6orf226,CNPY3,RPL24P4,PEX6	NA	NA	NA	NA	CNPY3	3570	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	42944777	42944970	42944923	Y	NA	CNPY3,RPL24P4,PPP2R5D,MEA1,KLHDC3,RRP36	NA	NA	NA	NA	PEX6	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	43001164	43001472	43001318	Y	NA	MEA1,KLHDC3,RRP36,KLC4,CUL7,MRPL2	NA	NA	NA	NA	KLC4	5043	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	43878497	43878687	43878563	Y	GTPBP2,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	142576	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	43974450	43974566	43974521	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM63B	118085	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	44070488	44070804	44070651	Y	NA	TMEM63B,MRPL14	NA	NA	NA	NA	TMEM63B	21847	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr6	44205272	44205504	44205346	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	7320	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	44953084	44953474	44953278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RUNX2	340420	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	45298832	45299186	45298935	Y	NA	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	RUNX2	4938	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	45302184	45302302	45302245	Y	NA	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	RUNX2	8290	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	45322073	45322342	45322124	Y	NA	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	21348	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	45391331	45391628	45391429	Y	RUNX2	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	47641	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	45391820	45391891	45391857	Y	RUNX2	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	48130	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	45392235	45392572	45392528	Y	RUNX2	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	48545	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	45404651	45404813	45404715	Y	RUNX2	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	60961	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr6	45409618	45409900	45409810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	65928	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	45413515	45413853	45413708	Y	RUNX2	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	69825	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	45428920	45429031	45428964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	85230	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	45503403	45503548	45503462	Y	RUNX2	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	159713	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr6	45503698	45503963	45503769	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	160008	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	45575518	45575910	45575680	Y	NA	NA	RUNX2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SUPT3H	231828	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	45618234	45618676	45618425	Y	RUNX2	NA	RUNX2,SUPT3H,CLIC5	IMR90	Hi-C	24141950	SUPT3H	274544	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr6	45623562	45623937	45623654	Y	NA	NA	RUNX2,SUPT3H,CLIC5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUPT3H	279872	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	45649659	45650055	45649841	Y	NA	NA	RUNX2,CDC5L	IMR90	Hi-C	24141950	SUPT3H	305969	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr6	46021255	46021630	46021408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-8B1.4	73813	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	52217307	52217701	52217502	Y	NA	PAQR8	PAQR8,MCM3,EFHC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAQR8	6518	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	52261634	52261809	52261784	Y	EFHC1	PAQR8,EFHC1	NA	NA	NA	NA	EFHC1	21297	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	55493056	55493068	55493062	Y	GFRAL	NA	BMP5	IMR90	Hi-C	24141950	BMP5	245294	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	56315031	56315399	56315215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BEND6	502374	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	56543882	56543906	56543894	Y	NA	NA	DST	IMR90	Hi-C	24141950	BEND6	273867	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	56578288	56578394	56578341	Y	NA	NA	DST	IMR90	Hi-C	24141950	BEND6	239379	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	57395913	57396073	57396021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	218310	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	58776280	58777091	58777029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	521711	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	58778631	58779245	58778717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	524062	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	71817586	71817689	71817638	Y	B3GAT2	NA	NA	NA	NA	NA	OGFRL1	178817	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	72010402	72010735	72010435	Y	NA	OGFRL1	NA	NA	NA	NA	OGFRL1	13896	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	72051718	72051897	72051837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OGFRL1	55212	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	72092992	72093394	72093291	Y	NA	LINC00472	NA	NA	NA	NA	LINC00472	35078	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	72103028	72103231	72103130	Y	NA	LINC00472	NA	NA	NA	NA	LINC00472	25241	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	72114373	72114910	72114587	Y	NA	LINC00472	NA	NA	NA	NA	LINC00472	13562	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr6	72178822	72179167	72178995	Y	NA	NA	OGFRL1,MIR30C2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00472	50350	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	72179171	72179414	72179328	Y	NA	NA	OGFRL1,MIR30C2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00472	50699	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	72188537	72188902	72188719	Y	NA	NA	OGFRL1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00472	60065	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr6	72294841	72295504	72295148	Y	NA	NA	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00472	166369	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	73786085	73786476	73786271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	184462	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.74440624473826
chr6	73833038	73833304	73833144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	137634	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	73867627	73867898	73867877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	103040	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	74289769	74290568	74290415	Y	MB21D1,SLC17A5,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	58249	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	74290752	74291151	74290952	Y	CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	59232	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	74295249	74295764	74295450	Y	MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	63729	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	74295823	74296227	74295840	Y	MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	64303	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	79043157	79043230	79043194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRAK1BP1	531959	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	79748011	79748153	79748082	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	37800	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	79773928	79774085	79774072	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	11868	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	81048044	81048318	81048128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	233680	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	84931248	84931348	84931298	Y	NA	KIAA1009	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	4005	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	86174491	86174911	86174693	Y	NA	NT5E	NA	NA	NA	NA	NT5E	16682	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	88213981	88214157	88214070	Y	GJB7	SLC35A1	NA	NA	NA	NA	SLC35A1	35640	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	90008898	90009057	90008978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2J1	51510	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	90994076	90994276	90994132	Y	MDN1,BACH2,BACH2	BACH2	NA	NA	NA	NA	BACH2	10351	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	90994449	90994671	90994572	Y	MDN1,BACH2,BACH2	BACH2	NA	NA	NA	NA	BACH2	9956	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	93802046	93802077	93802062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	2221342	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	94014369	94014515	94014442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	2008904	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	101204667	101204976	101204826	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCC3	122272	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	102948586	102948935	102948701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCC3	1621338	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	106057484	106057635	106057546	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	208525	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	106532439	106532606	106532449	Y	PRDM1	PRDM1	NA	NA	NA	NA	PRDM1	244	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	106611101	106611647	106611464	Y	PRDM1	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM1	78906	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	108455044	108455377	108455332	Y	NA	OSTM1	LACE1,ARMC2,NR2E1	IMR90	Hi-C	24141950	OSTM1	29681	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr6	108879521	108879931	108879808	Y	SESN1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	483	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr6	108895400	108895781	108895496	Y	NA	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	16362	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	109011028	109011405	109011217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO3	131990	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	110456590	110456951	110456841	Y	WASF1,CDC40,C6orf186	WASF1,CDC40	NA	NA	NA	NA	WASF1	42256	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	111049772	111049981	111049963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK19	85180	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	111265873	111266130	111266017	Y	SLC16A10,AMD1,AMD1	GTF3C6,RPF2	CDK19,AMD1,SLC22A16	IMR90	Hi-C	24141950	GTF3C6	11633	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	111776910	111777281	111777179	Y	NA	REV3L	NA	NA	NA	NA	REV3L	25637	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	112134730	112134859	112134835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	57796	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	112170510	112170904	112170903	Y	NA	FYN	NA	NA	NA	NA	FYN	21751	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	112173257	112173622	112173448	Y	NA	FYN	NA	NA	NA	NA	FYN	19033	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	113673815	113673995	113673934	Y	NA	NA	LAMA4,FLJ34503,MARCKS	IMR90	Hi-C	24141950	MARCKS	502546	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	113966975	113967088	113966980	Y	MARCKS	NA	MARCKS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MARCKS	209453	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	115163170	115163515	115163320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC2	832698	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	117819510	117819668	117819589	Y	NA	DCBLD1	NA	NA	NA	NA	DCBLD1	46530	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	119151345	119151482	119151449	Y	MCM9	NA	NA	NA	NA	NA	ASF1A	61902	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr6	126621398	126621727	126621563	Y	NA	CENPW	NA	NA	NA	NA	CENPW	37593	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	127892310	127892704	127892511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOGA3	54164	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	127980874	127981174	127981075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOGA3	142728	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr6	128293064	128293422	128293333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOGA3	454918	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	128607751	128608140	128608092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	231730	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	129822485	129822770	129822701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	206600	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	129855341	129855708	129855581	Y	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	173662	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	130005105	130005433	130005370	Y	L3MBTL3,ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	23937	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	132972348	132972541	132972445	Y	NA	NA	STX7,TAAR6,TAAR3,VNN1,VNN3,C6orf192,TAAR9	IMR90	Hi-C	24141950	STX7	140011	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	133020075	133020153	133020114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS12	113427	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	135636764	135637196	135637190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYB	136311	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	137231671	137231914	137231792	Y	NA	NA	SLC35D3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-55K22.5	80457	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	137310723	137310892	137310775	Y	IL20RA,SLC35D3	RP11-55K22.5	NA	NA	NA	NA	RP11-55K22.5	1479	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	138131793	138132158	138131947	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	54193	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	138786189	138786282	138786236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	63521	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	138876782	138877039	138876959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	154114	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	138914342	138914559	138914540	Y	NA	NA	HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC28A	178098	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	139209045	139209410	139209228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REPS1	97988	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	141765105	141765268	141765171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	701099	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	141804737	141805118	141804969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	661249	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	142290502	142290595	142290549	Y	VTA1	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	175772	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	142335769	142335959	142335859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	130408	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	142698366	142698689	142698587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR126	77375	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.19552499579061
chr6	143130260	143130659	143130530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	133679	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	143223836	143224147	143224035	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	40191	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr6	143503002	143503176	143503018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	123369	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	143919610	143919807	143919683	Y	NA	NA	PHACTR2,ZC2HC1B,PLAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	PHACTR2	63628	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	144053697	144053884	144053799	Y	STX11,PLAGL1	NA	NA	NA	NA	NA	LTV1	108597	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	144302032	144302409	144302359	Y	PLAGL1	NA	NA	NA	NA	NA	PLAGL1	81326	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	144587251	144587368	144587331	Y	NA	NA	UTRN,STX11	IMR90	Hi-C	24141950	TPT1P4	67149	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	147124877	147125201	147125102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB32	262048	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	147235645	147236230	147236149	Y	RAB32,STXBP5	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	287331	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	151365804	151366060	151365928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	52605	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	151366985	151367228	151367157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	51437	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	151381285	151381592	151381452	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	37073	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.56772811815974
chr6	151392463	151392726	151392659	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	25939	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	151730569	151730753	151730690	Y	NA	ZBTB2,RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	ZBTB2	19886	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	151815811	151815987	151815867	Y	ESR1,ESR1,ESR1,ESR1,C6orf97	RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	C6orf211	44389	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr6	155253920	155254165	155254066	Y	NA	NA	TIAM2,TFB1M,CLDN20	IMR90	Hi-C	24141950	TIAM2	102089	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	155590165	155590417	155590245	Y	NA	RP11-477D19.2,TFB1M	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	14307	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	157041058	157041538	157041248	Y	ARID1B	NA	ARID1B,MIR4466	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	55525	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	157096939	157097165	157097038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	157542479	157542718	157542566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	199915	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	158184460	158184689	158184561	Y	SNX9	NA	SNX9,TMEM242,ZDHHC14,SYNJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	57607	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	158185393	158186221	158185862	Y	SNX9	NA	SNX9,TMEM242,SYNJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	56075	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	158314373	158314686	158314419	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SNX9	72077	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	158452388	158452885	158452569	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	51500	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	158463343	158463878	158463391	Y	SNX9,SYNJ2	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	62455	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	158464788	158465005	158464892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	63900	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	158468247	158468495	158468433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	67359	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	158478416	158478907	158478642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	77528	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.19552499579061
chr6	158481547	158481708	158481650	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	80659	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	81905	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	159141436	159141829	159141621	Y	TAGAP,DYNLT1,SYTL3,C6orf99,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	SYTL3	72390	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	159234698	159235091	159235070	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	3353	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	159270971	159271326	159271104	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	17645	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	159271429	159272000	159271674	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	16971	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr6	159273925	159274893	159274526	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	14078	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr6	160135538	160135989	160135680	Y	IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	8628	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	160141572	160141909	160141740	Y	MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	2708	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr6	161536644	161536718	161536688	Y	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K4	125885	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	167115544	167115618	167115576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-514O12.4	251994	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	168408262	168408655	168408498	Y	NA	NA	SMOC2,KIF25	IMR90	Hi-C	24141950	MLLT4	182660	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	168558082	168558596	168558447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT4	332480	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	169308928	169309266	169309084	Y	THBS2	NA	WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	342873	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	169986941	169987258	169987132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR27	112901	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	170054470	170055295	170054892	Y	TCTE3	WDR27,C6orf120	NA	NA	NA	NA	WDR27	44864	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.29328749368591
chr6	170361995	170362544	170362249	Y	NA	NA	LOC154449,DLL1	IMR90	Hi-C	24141950	TCTE3	212340	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr6	170600439	170600921	170600644	Y	NA	DLL1,FAM120B	NA	NA	NA	NA	FAM120B	2648	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	8.78209998316243
chr7	577876	578141	578015	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,HEATR2,GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	19943	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	579426	579712	579625	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	21493	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	875702	875833	875757	Y	SUN1,SUN1	SUN1,GET4	NA	NA	NA	NA	SUN1	22174	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	968255	968622	968448	Y	ZFAND2A,COX19,ADAP1	ADAP1,COX19	NA	NA	NA	NA	ADAP1	24421	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	1416814	1417157	1416984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICALL2	79981	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	1546091	1546367	1546260	Y	NA	MICALL2,INTS1,MAFK	NA	NA	NA	NA	INTS1	2602	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	2101889	2102279	2102085	Y	ELFN1	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	168599	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	2903227	2903785	2903462	Y	LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12	AC006028.11,GNA12	GNA12	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNA12	21269	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	3283908	3284312	3284215	Y	SDK1	NA	SDK1	IMR90	Hi-C	24141950	SDK1	54768	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr7	3699539	3699733	3699636	Y	SDK1	NA	NA	NA	NA	NA	SDK1	360459	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	4764796	4765177	4765030	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	83408	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	4784652	4785031	4784763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	103264	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	4913549	4913687	4913618	Y	NA	AC092610.12	NA	NA	NA	NA	AC092610.12	10114	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	7216835	7216977	7216903	Y	NA	C1GALT1	C1GALT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	C1GALT1	22270	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	7604061	7604281	7604173	Y	MIOS	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	222	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	8173918	8174349	8174085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	125514	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	8300852	8301132	8300960	Y	ICA1,ICA1,ICA1	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	ICA1	535	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	8550473	8550803	8550530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICA1	250156	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	13057101	13057487	13057331	Y	NA	NA	ARL4A	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4A	332620	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr7	18442328	18442677	18442600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX13	464204	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	23084280	23084501	23084407	Y	NA	FAM126A	SNORD93,LOC100506178,TOMM7	IMR90	Hi-C	24141950	FAM126A	32531	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	23348040	23348443	23348292	Y	KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	NUPL2	128594	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	23510676	23511223	23510889	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2590	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr7	23513815	23514383	23514045	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	MALSU1	K562	ChIA-PET	22265404	IGF2BP3	5729	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr7	24626460	24626850	24626473	Y	NA	MPP6	NA	NA	NA	NA	MPP6	15573	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	24813861	24813988	24813926	Y	OSBPL3	DFNA5	DFNA5,OSBPL3	IMR90	Hi-C	24141950	DFNA5	6617	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	24861129	24861331	24861204	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	53885	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	25009429	25009748	25009721	Y	NA	OSBPL3	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	9505	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	25894654	25894946	25894846	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	294914	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	25896245	25896461	25896419	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	293399	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr7	26193570	26193972	26193862	Y	SNX10,SNX10,HNRNPA2B1	NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	3710	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr7	27152655	27152825	27152741	Y	NA	HOTAIRM1,HOXA1,HOXA-AS2,HOXA4,HOXA5,HOXA6,HOXA3,HOXA7	NA	NA	NA	NA	HOXA-AS2	7259	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	27176174	27176251	27176224	Y	HOXA3,HOXA3,HOXA4,HOXA5	HOTAIRM1,HOXA1,HOXA-AS2,HOXA4,HOXA5,HOXA6,HOXA3,HOXA7,HOXA10-AS,HOXA9,RP1-170O19.20,HOXA10,HOXA11	NA	NA	NA	NA	HOXA5	5036	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	27206716	27206932	27206874	Y	HOXA7,HOXA9,HOXA13,HOXA11,HOXA10	HOXA4,HOXA5,HOXA6,HOXA3,HOXA7,HOXA10-AS,HOXA9,RP1-170O19.20,HOXA10,HOXA11,HOXA13	NA	NA	NA	NA	HOXA10-AS	478	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	27531639	27532015	27531830	Y	NA	EIF4HP1	NA	NA	NA	NA	EIF4HP1	35171	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	28076890	28077172	28076964	Y	CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	JAZF1	141190	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	28194446	28194874	28194789	Y	NA	JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1	23488	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	29288404	29288769	29288539	Y	CHN2	NA	NA	NA	NA	NA	AC007285.6	737447	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	30005426	30005693	30005606	Y	NA	AC007285.6,SCRN1	NA	NA	NA	NA	AC007285.6	20523	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	30500037	30500161	30500099	Y	NA	NOD1	NA	NA	NA	NA	NOD1	16239	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	30658764	30658962	30658863	Y	NA	GARS	NA	NA	NA	NA	GARS	26467	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	33079333	33079582	33079400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP9	67431	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	36480174	36480717	36480189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	52440	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	36555269	36555573	36555424	Y	ELMO1,AOAH,EEPD1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	127535	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	36766830	36767015	36766909	Y	ELMO1,AOAH	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P18	89549	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	37221797	37222057	37221923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P18	365233	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	38320391	38320829	38320534	Y	TARP	NA	NA	NA	NA	NA	STARD3NL	104567	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	38717686	38717891	38717791	Y	STARD3NL,TARP	NA	NA	NA	NA	NA	VPS41	252103	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	40580986	40581112	40581049	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	593350	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	43654812	43655175	43654945	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	34455	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	43670120	43670185	43670135	Y	POLM,DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	49763	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr7	43676905	43677264	43677045	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	NA	NA	NA	NA	NA	STK17A	56548	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	43732901	43733056	43732913	Y	DBNL,STK17A	NA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	63223	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr7	44616133	44616490	44616314	Y	NA	DDX56,TMED4,OGDH	NA	NA	NA	NA	TMED4	3396	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	47496897	47497228	47497063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	122928	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	47823605	47823820	47823740	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	HUS1	193358	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	47826128	47826596	47826342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HUS1	190582	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr7	50859334	50859716	50859525	Y	NA	GRB10	NA	NA	NA	NA	GRB10	175	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	55132578	55133258	55132929	Y	SEC61G,EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	47864	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	55155188	55155533	55155358	Y	EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	70474	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	55198488	55198937	55198616	Y	SEC61G	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	113774	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	55200352	55201043	55200686	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	115638	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	55201472	55201858	55201601	Y	SEC61G	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	116758	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.29328749368591
chr7	55529793	55530311	55530129	Y	ZNF713,VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	98652	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	55543241	55543436	55543358	Y	VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	VOPP1	95245	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	55608174	55608360	55608336	Y	NA	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	30321	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	56013517	56013601	56013542	Y	ZNF713	GBAS,MRPS17	NA	NA	NA	NA	GBAS	3885	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	63767130	63767234	63767166	Y	NA	ZNF736	NA	NA	NA	NA	ZNF736	1293	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	65360437	65360759	65360712	Y	NA	VKORC1L1	NA	NA	NA	NA	VKORC1L1	24183	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	66152523	66152575	66152558	Y	RABGEF1,KCTD7	RP4-756H11.3,RABGEF1	KCTD7,LOC493754,RABGEF1	IMR90	Hi-C	24141950	RABGEF1	7372	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	73062013	73062614	73062579	Y	BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A	WBSCR22,DNAJC30	MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A	IMR90	Hi-C	24141950	WBSCR22	32741	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	73132412	73132545	73132481	Y	LAT2,BCL7B	WBSCR22,DNAJC30,STX1A,ABHD11	NA	NA	NA	NA	STX1A	410	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr7	73156679	73157033	73156789	Y	NA	STX1A,ABHD11	NA	NA	NA	NA	ABHD11	5482	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	73236868	73237278	73236968	Y	CLDN3,CLDN4	WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	17587	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	73265870	73266203	73266092	Y	BCL7B	WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	11005	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	73694024	73694283	73694118	Y	LAT2	RFC2,CLIP2	CLIP2	IMR90	Hi-C	24141950	CLIP2	7522	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr7	73897037	73897256	73897156	Y	NA	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	30917	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	75465283	75465439	75465360	Y	MDH2	CCL26,RHBDD2	STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	4481	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	NA	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	MDH2	120464	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	76907614	76907779	76907731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC146	157863	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	77049958	77050038	77049998	Y	PTPN12,PTPN12,PION	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN12	114554	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	80512986	80513276	80513113	Y	NA	SEMA3C	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	36399	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	80571600	80571811	80571745	Y	NA	SEMA3C	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	21925	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr7	84613691	84613734	84613712	Y	NA	AC074183.4	NA	NA	NA	NA	AC074183.4	46130	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	85403399	85403494	85403443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074183.4	835838	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	88029071	88029091	88029081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRI	174763	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	90637974	90638276	90638003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FZD1	253507	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	90861359	90861732	90861539	Y	NA	FZD1	NA	NA	NA	NA	FZD1	30051	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	91456025	91456190	91456079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTERF	51844	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	92156983	92157235	92157087	Y	CDK6,CDK6,PEX1,FAM133B,C7orf64	PEX1,RBM48	NA	NA	NA	NA	RBM48	896	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	92261439	92261837	92261823	Y	NA	FAM133B	FAM133B	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM133B	43731	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	92262528	92262734	92262631	Y	NA	FAM133B	FAM133B	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM133B	44820	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	92271044	92271426	92271360	Y	SAMD9	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	53336	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	92274593	92274946	92274914	Y	CDK6	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	56885	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	92324544	92325563	92325510	Y	NA	NA	FAM133B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM133B	106836	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	93812688	93813130	93812921	Y	NA	NA	TFPI2,BET1,GNGT1	IMR90	Hi-C	24141950	BET1	180994	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	94021237	94021945	94021560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASD1	114586	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	95129824	95130260	95130025	Y	ASB4	ASB4	NA	NA	NA	NA	ASB4	24068	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr7	95137857	95138175	95137904	Y	ASB4	ASB4	NA	NA	NA	NA	ASB4	32101	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	95645399	95645785	95645516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I1	245533	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	95807779	95807791	95807785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	141668	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	95877265	95877280	95877275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	72179	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	99684818	99685168	99684993	Y	TSC22D4,PILRB,PILRA	ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,MBLAC1	NA	NA	NA	NA	COPS6	241	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	99962576	99962959	99962740	Y	MCM7,C7orf43,ZCWPW1,TSC22D4,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,GIGYF1,PILRB,PILRA	PILRB,PMS2P1	PILRA	IMR90	Hi-C	24141950	PMS2P1	25045	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	100042030	100042585	100042239	Y	COPS6,EPHB4	MEPCE,ZCWPW1,PPP1R35,TSC22D4,NYAP1	NA	NA	NA	NA	PPP1R35	9842	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	100144113	100144628	100144364	Y	NA	AGFG2,LRCH4	NA	NA	NA	NA	AGFG2	9279	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	100144720	100144853	100144769	Y	NA	AGFG2,LRCH4	NA	NA	NA	NA	AGFG2	9886	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	100743461	100743946	100743576	Y	GNB2,TRIM56	TRIM56,SERPINE1	SERPINE1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM56	16741	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr7	100757831	100758077	100757885	Y	NA	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	10293	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	100761754	100762006	100761835	Y	NA	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	AP1S1,VGF	MCF7	ChIA-PET	22265404	SERPINE1	6364	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	100772573	100772742	100772614	Y	SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	4203	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	101045498	101045795	101045583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABL5	82394	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr7	101372678	101373024	101372861	Y	NA	NA	CUX1,EMID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CUX1	83935	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	101499743	101500539	101499888	Y	SH2B2,CUX1,CUX1,CUX1	CUX1	NA	NA	NA	NA	CUX1	42784	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr7	101525517	101525682	101525579	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	68558	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr7	101526005	101526525	101526438	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	69046	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr7	101672273	101672589	101672281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	215314	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr7	101931211	101931437	101931291	Y	CUX1,CUX1,CUX1,ORAI2,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	70882	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	102464517	102464880	102464701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM185A	77099	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	102919685	102919710	102919698	Y	NAPEPLD	DPY19L2P2,PMPCB	NA	NA	NA	NA	DPY19L2P2	828	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	104626890	104627731	104627241	Y	MLL5	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	23760	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	104771248	104771300	104771252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	119757	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	104907808	104907896	104907852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	129859	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	104960256	104960357	104960307	Y	MLL5,SRPK2	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	77398	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	105123568	105123582	105123575	Y	NA	PUS7,RINT1	NA	NA	NA	NA	PUS7	37132	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	105416484	105416867	105416678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L1	98183	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr7	105602769	105602970	105602871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDHR3	87527	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	105856842	105857229	105857099	Y	NA	NA	NAMPT,CCDC71L	IMR90	Hi-C	24141950	NAMPT	67543	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	106089773	106090176	106089868	Y	NAMPT,PIK3CG	NA	NAMPT	IMR90	Hi-C	24141950	NAMPT	165001	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	106413227	106413352	106413289	Y	FLJ36031	RP5-884M6.1	CCDC71L,HBP1,NAMPT,CBLL1,PIK3CG,PRKAR2B	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-884M6.1	105	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	107026511	107026865	107026723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	175064	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	107205466	107205592	107205534	Y	COG5	DUS4L,COG5,BCAP29	NA	NA	NA	NA	COG5	2507	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	107939769	107940082	107939931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P32	208595	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	111832262	111832632	111832471	Y	NA	DOCK4,ZNF277	NA	NA	NA	NA	DOCK4	11834	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	114677768	114677789	114677777	Y	MDFIC	NA	NA	NA	NA	NA	TES	1170758	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	115995232	115995555	115995330	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	NA	CAV2,CAV1,TES,MET	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAV2	69798	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr7	116328034	116328226	116328184	Y	ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET	MET	NA	NA	NA	NA	MET	17590	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	117368970	117368995	117368982	Y	CTTNBP2	NA	NA	NA	NA	NA	NAA38	453091	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	118520575	118520914	118520745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA38	698489	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	120938122	120938485	120938307	Y	FAM3C	NA	NA	NA	NA	NA	FAM3C	95933	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr7	120942380	120942663	120942460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM3C	91755	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	121008996	121009049	121009023	Y	NA	FAM3C	NA	NA	NA	NA	FAM3C	25369	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	122466235	122466438	122466337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADPS2	58375	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.46996562026443
chr7	129014301	129014725	129014533	Y	AHCYL2,FAM40B,AHCYL2	RP11-305M3.2	FAM40B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-305M3.2	33486	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	130530611	130530821	130530670	Y	NA	NA	MEST,KLHDC10,MIR29A,MIR29B1,ZC3HC1,C7orf45,CPA5,LOC646329	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	65248	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	130552122	130552429	130552276	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	43640	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	130571851	130572495	130572306	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	23574	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	130575591	130576512	130576394	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	19557	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	130581597	130582393	130581985	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	13676	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	130583676	130584341	130584164	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	11728	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	130586004	130586434	130586371	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	9635	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr7	130588239	130588699	130588531	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	7370	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	130589567	130590049	130589961	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6020	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	130593505	130595916	130594870	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	153	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	130601178	130601963	130601463	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	5109	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	130602337	130602820	130602733	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6268	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	130606000	130606565	130606293	Y	NA	MIR29A	LOC646329	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR29A	9931	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	130633473	130633870	130633858	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	37404	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	130641725	130642119	130642041	Y	MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	45656	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	130645057	130645459	130645325	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	48988	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr7	130920397	130920794	130920689	Y	MKLN1,MKLN1	AC009362.2	NA	NA	NA	NA	AC009362.2	4555	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	131919616	131920007	131919874	Y	PLXNA4	NA	NA	NA	NA	NA	PODXL	678640	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	132607236	132607300	132607268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	157548	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	133706471	133706698	133706584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35B4	293105	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	138081171	138081424	138081337	Y	TRIM24	AC008155.1	NA	NA	NA	NA	AC008155.1	5844	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	139358057	139358402	139358214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	117175	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	139365521	139365926	139365718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	109651	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	139498127	139498170	139498155	Y	TBXAS1	HIPK2	NA	NA	NA	NA	HIPK2	22550	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	140262789	140263047	140262916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRN1	85420	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	141285767	141286195	141285861	Y	TAS2R38,AGK	AGK	NA	NA	NA	NA	AGK	36778	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	143083267	143084129	143083354	Y	TAS2R40,FAM131B,FAM131B	AC093673.5,ZYX	NA	NA	NA	NA	ZYX	7094	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr7	144539832	144539937	144539881	Y	TPK1	TPK1	TPK1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TPK1	8344	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	NA	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EZH2	58860	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr7	148680544	148680840	148680694	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	42893	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	148685182	148685277	148685231	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	38456	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	172	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	149471511	149471709	149471700	Y	ATP6V0E2,SSPO	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	2943	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	150944094	150944397	150944255	Y	NA	ABCF2,CHPF2,SMARCD3	NA	NA	NA	NA	CHPF2	16519	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	151384772	151384923	151384848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHEB	169566	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	152105895	152106094	152106005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	265156	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210057	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	209236	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	154743291	154743691	154743552	Y	NA	PAXIP1	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	49103	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	154958521	154958650	154958585	Y	NA	NA	PAXIP1,HTR5A,LOC100128264,CNPY1	IMR90	Hi-C	24141950	INSIG1	128836	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	155137693	155138087	155137815	Y	NA	NA	INSIG1,PAXIP1,LOC100132707,LOC100128264,HTR5A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INSIG1	50207	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	155744220	155744341	155744281	Y	NA	AC021218.2	LOC285889,SHH,LMBR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC021218.2	8985	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr7	155744375	155744769	155744531	Y	NA	AC021218.2	LOC285889,SHH,LMBR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC021218.2	8557	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	155754558	155754796	155754722	Y	NA	AC021218.2	LOC285889	IMR90	Hi-C	24141950	AC021218.2	1232	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr7	156444597	156444947	156444772	Y	NA	RNF32,C7orf13	NA	NA	NA	NA	C7orf13	13249	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr7	157338058	157338440	157338352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	211983	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr7	157673991	157674159	157674024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	547916	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr7	158595763	158596162	158596010	Y	ESYT2	ESYT2	NA	NA	NA	NA	ESYT2	24782	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	638062	638589	638348	Y	ZNF596,ZNF596,ERICH1	ERICH1	NA	NA	NA	NA	ERICH1	47517	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	1780723	1781665	1781560	Y	NA	ARHGEF10	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	10581	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	6323096	6323426	6323195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPH1	60983	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	8932382	8932915	8932599	Y	CLDN23,PPP1R3B	NA	PPP1R3B,ERI1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PPP1R3B	74169	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	11312887	11313950	11313920	Y	NA	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	16274	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr8	11314255	11315026	11314813	Y	XKR6,MTMR9,FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	15198	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	11315246	11315781	11315560	Y	XKR6,MTMR9	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	14443	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr8	11322358	11322501	11322433	Y	NEIL2,XKR6,MTMR9,FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	7723	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	13224231	13224684	13224410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	146483	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr8	13230060	13230464	13230283	Y	DLC1	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	140703	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	16965727	16966045	16965748	Y	NA	ZDHHC2	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	45493	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	18854306	18854486	18854451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	85754	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	20126353	20126692	20126612	Y	NA	LZTS1	DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	LZTS1	32782	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	21867707	21867918	21867811	Y	PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM160B2	76752	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	21999982	22000221	22000101	Y	POLR3D	NUDT18,REEP4,BMP1	NA	NA	NA	NA	REEP4	2518	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	22439546	22439823	22439672	Y	NA	SORBS3,PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	PDLIM2	5754	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	22469003	22469432	22469219	Y	NA	PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	C8orf58	13889	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	22551843	22553123	22552848	Y	PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,EGR3	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	EGR3	3028	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	22710401	22710511	22710455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	132419	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	23014689	23015093	23014900	Y	NA	TNFRSF10D	NA	NA	NA	NA	TNFRSF10D	4450	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	23138717	23138953	23138815	Y	LOXL2	CHMP7,R3HCC1	NA	NA	NA	NA	R3HCC1	13084	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	23203813	23204244	23204131	Y	LOXL2	NA	NA	NA	NA	NA	LOXL2	76597	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	23710742	23711028	23710888	Y	STC1	STC1	NA	NA	NA	NA	STC1	422	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	25242857	25243137	25242939	Y	NA	NA	KCTD9	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD9	70855	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	26306627	26307336	26307213	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PNMA2	62272	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	26466894	26467238	26467101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	97103	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	28923074	28923318	28923180	Y	NA	CTD-2647L4.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2647L4.4	11622	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	30769723	30770025	30769859	Y	NA	NA	TEX15,WRN,PPP2CB,PURG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2CB	99893	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	33245630	33245874	33245728	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	83066	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	35119361	35119644	35119503	Y	UNC5D	NA	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	261637	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.01884686921208
chr8	38816649	38817007	38816807	Y	NA	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	TM2D2	35336	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	38856419	38857534	38856583	Y	NA	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	4031	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr8	41649689	41649828	41649744	Y	NKX6-3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-360L9.4	215802	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	41886687	41887061	41886965	Y	NA	KAT6A	NA	NA	NA	NA	KAT6A	20447	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	41997279	41998522	41997937	Y	NA	AP3M2	KAT6A,ANK1,POLB,AP3M2,VDAC3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP3M2	9942	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	42053833	42054135	42053951	Y	NA	AP3M2	NA	NA	NA	NA	AP3M2	45369	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	42748560	42748749	42748647	Y	THAP1,HOOK3	MIR4469,HOOK3,RNF170	NA	NA	NA	NA	MIR4469	669	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	42749479	42749732	42749583	Y	NA	MIR4469,HOOK3,RNF170	NA	NA	NA	NA	MIR4469	61	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr8	43092918	43093442	43093017	Y	HOOK3	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	99362	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	48242793	48242802	48242797	Y	NA	NA	PRKDC	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFA5P12	168300	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	48580617	48580970	48580793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	68678	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	49320367	49320668	49320511	Y	NA	RPL29P19	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	25217	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	49321087	49321473	49321210	Y	NA	RPL29P19	SNAI2,MCM4,EFCAB1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	25937	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	49344700	49344905	49344800	Y	NA	RPL29P19	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	49550	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	49494192	49494425	49494282	Y	NA	RP11-567J20.1	SNAI2,EFCAB1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-567J20.1	37153	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	49815340	49815765	49815552	Y	SNAI2	SNAI2	NA	NA	NA	NA	SNAI2	16534	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	50653553	50653944	50653741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNAI2	821254	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	53188453	53188874	53188470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-110G21.1	378568	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	53625473	53626379	53625848	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	30024	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr8	54659884	54660111	54659998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP6V1H	94007	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	54798731	54798762	54798749	Y	NA	ATP6V1H,RGS20	NA	NA	NA	NA	RGS20	36363	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	54884977	54885679	54885327	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	47410	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	57389900	57390701	57390447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17A4.1	108243	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	61511489	61511770	61511631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	77567	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	61626654	61626933	61626781	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37317	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	61627150	61627529	61627187	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37813	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	61657043	61657068	61657053	Y	CHD7	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	67706	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	61664874	61665035	61664955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	75537	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	61850490	61850754	61850677	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261153	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr8	62600598	62600698	62600684	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	24457	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	62606389	62606706	62606619	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	18449	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	62624516	62625412	62625017	Y	ASPH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH,MIR4470	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	63934936	63935021	63934979	Y	NA	GGH	NA	NA	NA	NA	GGH	14709	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	64133013	64133210	64133061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTHDF3	53901	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr8	66641187	66641625	66641410	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	86218	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	66652181	66652518	66652302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	97212	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	67032578	67032774	67032676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7A	280021	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	67035997	67036639	67036283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7A	283440	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	67131951	67132306	67132129	Y	NA	NA	DNAJC5B,CRH	IMR90	Hi-C	24141950	RRS1	206957	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	67425057	67425564	67425100	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADHFE1	84637	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	67433991	67434613	67434592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	89869	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	67434763	67435122	67434951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	89360	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	67445791	67446197	67446047	Y	ADHFE1,VCPIP1,MYBL1	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	78285	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr8	67447907	67448273	67448065	Y	MYBL1,C8orf45	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	76209	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr8	71124105	71124438	71124275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	109691	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	71149519	71149670	71149631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	135105	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	71569342	71569635	71569535	Y	NA	LACTB2	NA	NA	NA	NA	LACTB2	9774	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	77585675	77585844	77585753	Y	ZFHX4	NA	NA	NA	NA	NA	PEX2	325436	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	79674578	79674862	79674701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKIA	248204	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	81400222	81400395	81400296	Y	ZBTB10	ZBTB10	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	4368	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	81587419	81587669	81587654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	191565	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	81695028	81695405	81695288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	299174	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	81749885	81750162	81750025	Y	ZNF704	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	354031	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	82167350	82167604	82167486	Y	NA	FABP5	ZNF704,PAG1,FABP12	IMR90	Hi-C	24141950	FABP5	22994	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	87065314	87065412	87065360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWP1	287555	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	90213226	90213534	90213296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-37B2.1	554421	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	94850724	94850939	94850832	Y	GEM	PDP1	NA	NA	NA	NA	PDP1	17096	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	94892570	94892797	94892694	Y	NA	PDP1	TMEM67,PDP1,MIR378D2	IMR90	Hi-C	24141950	PDP1	24535	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	94928107	94928427	94928252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDP1	60072	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr8	95943173	95943450	95943312	Y	NA	CCNE2,TP53INP1,RP11-347C18.3	NA	NA	NA	NA	TP53INP1	16189	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	96197025	96197314	96197170	Y	NA	NA	PLEKHF2,C8orf69	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHF2	52993	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	99658802	99659210	99659171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	293845	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	100808377	100808591	100808586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX6C	95699	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	101801288	101801504	101801352	Y	NA	NA	PABPC1,SNX31	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PABPC1	68251	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.46996562026443
chr8	102171133	102171473	102171263	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	ZNF706	ZNF706,YWHAZ,FLJ42969	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	44948	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr8	102185716	102186115	102186035	Y	NA	ZNF706	YWHAZ,FLJ42969,ZNF706	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	30306	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	103801151	103801773	103801337	Y	NA	NA	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1507C5.2	72755	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	103918538	103918841	103918687	Y	NA	KB-1507C5.2,AZIN1	ATP6V1C1,AZIN1	IMR90	Hi-C	24141950	AZIN1	14446	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	103922083	103922307	103922186	Y	NA	KB-1507C5.2,AZIN1	AZIN1	IMR90	Hi-C	24141950	AZIN1	17991	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	104360613	104360956	104360808	Y	AZIN1,ATP6V1C1,SLC25A32,DCAF13	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-318M2.2	51613	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	104406173	104406574	104406390	Y	NA	DCAF13,SLC25A32	NA	NA	NA	NA	DCAF13	18368	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	106764019	106764032	106764026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152P17.2	306720	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	110602225	110602239	110602235	Y	SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,KCNV1	NA	NA	NA	NA	NA	EBAG9	52285	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	117664503	117664654	117664532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	112088	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	119443463	119443781	119443622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	188453	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	121822442	121823157	121823030	Y	NA	SNTB1	NA	NA	NA	NA	SNTB1	356	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	122361097	122361402	122361250	Y	NA	NA	HAS2	IMR90	Hi-C	24141950	HAS2	290228	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr8	123050237	123050548	123050394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS2	398607	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr8	123193210	123193342	123193276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS2	541580	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	123317783	123317849	123317816	Y	NA	NA	HAS2	IMR90	Hi-C	24141950	ZHX2	473784	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr8	123398501	123398841	123398672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	392792	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr8	123443932	123444239	123444086	Y	NA	NA	HAS2	IMR90	Hi-C	24141950	ZHX2	347394	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	123795111	123795992	123795667	Y	C8orf76,ZHX2	ZHX2	NA	NA	NA	NA	ZHX2	3478	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	124301303	124301534	124301414	Y	NA	C8orf76,ZHX1	ATAD2,ZHX1-C8ORF76	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZHX1	15522	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	124462485	124463022	124462596	Y	NA	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	WDYHV1	35520	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	124529265	124529734	124529486	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	21712	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	125367728	125368050	125367886	Y	TRMT12,TATDN1,NDUFB9	TMEM65	NA	NA	NA	NA	TMEM65	14883	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	126037665	126038021	126037843	Y	NA	SQLE	NA	NA	NA	NA	SQLE	28926	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	126195292	126195668	126195512	Y	TRIB1,KIAA0196,NSMCE2	NA	TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0196	93210	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	126231490	126231859	126231657	Y	MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	129408	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr8	126286229	126286368	126286299	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	154195	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	126290719	126290948	126290836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	149615	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	126441416	126441734	126441625	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	853	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	126614927	126615093	126614982	Y	TRIB1	NA	NSMCE2,KIAA0196,TRIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	174364	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYC	646138	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	128134721	128135121	128135085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYC	610559	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	128171088	128171312	128171255	Y	NA	NA	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	574368	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	128811691	128811973	128811933	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	6912	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	128822019	128822203	128822035	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	17240	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	128825013	128825274	128825028	Y	MYC	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	20234	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	128843918	128844302	128844002	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	39139	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	128888391	128888698	128888485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	83612	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	128919831	128920544	128920233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	100313	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr8	128944008	128944415	128944139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	76442	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr8	128948050	128948240	128948055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	72617	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	128973364	128973763	128973565	Y	MYC	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	47094	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	129002909	129003328	129003001	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	17529	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	129053712	129054462	129054053	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	32855	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	129121216	129121486	129121350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	100359	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	129139934	129140421	129140284	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	119077	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr8	129163348	129163834	129163669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	142491	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	129180047	129180432	129180183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	159190	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr8	129188825	129189407	129189075	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	167968	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr8	129195465	129196052	129195562	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	174608	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.46996562026443
chr8	130461810	130462206	130462131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	565169	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	130548053	130548359	130548185	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	FAM49B	479016	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	130639363	130639590	130639478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	387785	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	130697904	130698138	130698105	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM49B	329237	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	130720341	130720558	130720412	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM49B	306817	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.92108437131678
chr8	131089372	131089764	131089568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	61997	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	131259857	131260132	131260043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	193774	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	131456841	131457348	131457080	Y	NA	ASAP1	NA	NA	NA	NA	ASAP1	2935	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	131540584	131540868	131540737	Y	NA	NA	ASAP1	IMR90	Hi-C	24141950	ASAP1	86678	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	134143122	134143607	134143263	Y	ST3GAL1,NDRG1,PHF20L1	NA	NA	NA	NA	NA	WISP1	57675	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	134162340	134163262	134162815	Y	ST3GAL1,TMEM71,PHF20L1	WISP1	NA	NA	NA	NA	WISP1	38020	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	134206657	134207025	134206839	Y	NA	WISP1	NA	NA	NA	NA	WISP1	5375	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	134230111	134230161	134230154	Y	ST3GAL1	WISP1	NA	NA	NA	NA	WISP1	28829	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	134233745	134234256	134234169	Y	NA	WISP1	NA	NA	NA	NA	WISP1	32463	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	4.11660936710739
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	MIR30D	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR30D	28397	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	135984758	135985124	135984941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR30D	169570	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	137225928	137226328	137226138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-35P	473190	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	141598802	141599709	141599120	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	79405	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	141604721	141605198	141605144	Y	EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	85324	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	141707505	141707982	141707957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	188108	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	141886994	141887102	141887066	Y	PTK2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	123213	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	142215999	142216277	142216212	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A4	100127	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	142591617	142591932	142591762	Y	NA	NA	TSNARE1	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA1P38	124442	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr8	143533998	143534621	143534303	Y	LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1	NA	BAI1,TSNARE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TSNARE1	51397	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	144301806	144302247	144302025	Y	MAFA	ZFP41,GLI4	NA	NA	NA	NA	ZFP41	25033	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	144843026	144843252	144843141	Y	NA	FAM83H	SCRIB,PUF60	IMR90	Hi-C	24141950	FAM83H	29055	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	145015768	145015971	145015849	Y	FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	32931	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	146010487	146010786	146010731	Y	NA	ZNF251,RPL8,ZNF7	NA	NA	NA	NA	ZNF34	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr8	146085419	146085616	146085518	Y	NA	ZNF7,COMMD5,ZNF250	NA	NA	NA	NA	COMMD5	8298	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr8	146125688	146125902	146125777	Y	ZNF250	COMMD5,ZNF250,ZNF16	NA	NA	NA	NA	ZNF250	135	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr9	545729	545758	545741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	77438	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	2241944	2242239	2242031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	228602	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	2655543	2655805	2655674	Y	NA	VLDLR	NA	NA	NA	NA	VLDLR	35709	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	2657497	2657645	2657571	Y	NA	VLDLR	NA	NA	NA	NA	VLDLR	37663	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr9	3877182	3877575	3877493	Y	GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-509J21.1	352459	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	4042913	4043209	4043135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	303183	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	4137159	4137519	4137339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	208873	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr9	4241498	4241696	4241599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	104696	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	4283058	4283285	4283172	Y	GLIS3,GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	63107	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr9	4293316	4293716	4293485	Y	GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	52676	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr9	4296901	4297617	4297146	Y	GLIS3	GLIS3	NA	NA	NA	NA	GLIS3	48775	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	5509549	5510003	5509837	Y	C9orf46,CD274,PDCD1LG2	PDCD1LG2	NA	NA	NA	NA	PDCD1LG2	1004	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	5965964	5966267	5966115	Y	NA	KIAA2026,RANBP6	NA	NA	NA	NA	KIAA2026	39634	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	6004392	6004777	6004642	Y	NA	KIAA2026,RANBP6	NA	NA	NA	NA	KIAA2026	1124	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	6488249	6488567	6488283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UHRF2	77098	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,RP11-390F4.6,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr9	6958089	6958102	6958095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4C	239226	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	10322828	10323093	10322961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P3	1233952	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	14251419	14251628	14251514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	145354	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	14301558	14301649	14301604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	95333	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	74072	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr9	15300887	15301166	15301002	Y	TTC39B	TTC39B	NA	NA	NA	NA	TTC39B	4192	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	16508530	16508711	16508621	Y	BNC2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	216101	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	18099109	18099372	18099241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-296P7.4	925518	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	18490587	18490949	18490797	Y	ADAMTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-296P7.4	533941	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr9	18718417	18718817	18718751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-296P7.4	306073	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr9	19161675	19162031	19161810	Y	PLIN2,ACER2	PLIN2	DENND4C,PLIN2,HAUS6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLIN2	14387	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	21576231	21576644	21576439	Y	NA	MIR31HG	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	18563	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	21695810	21696232	21696052	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	138142	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr9	21696521	21696698	21696606	Y	IFNA6,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	138853	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	23639161	23639473	23639317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	1629007	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	26946072	26946289	26946254	Y	PLAA,IFT74,IFT74	IFT74,PLAA	NA	NA	NA	NA	PLAA	611	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	32004800	32005157	32005020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACO1	377461	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	32535541	32535857	32535751	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	11219	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	34016159	34016420	34016379	Y	NA	UBAP2	NA	NA	NA	NA	UBAP2	30527	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	34681857	34682174	34682025	Y	ARID3C,IL11RA,IL11RA	SIGMAR1,GALT,IL11RA,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5	NA	NA	NA	NA	RP11-195F19.5	17748	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	35516545	35516820	35516591	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	86547	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr9	35518041	35518590	35518314	Y	CREB3,VCP,STOML2,RUSC2	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	84777	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr9	35769980	35770349	35770169	Y	NA	CREB3,TLN1,RGP1,GBA2,TMEM8B,HINT2	NA	NA	NA	NA	GBA2	21997	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	35971862	35972364	35972237	Y	NA	YBX1P10	C9orf128,HRCT1,LOC158376,FP588,RECK	IMR90	Hi-C	24141950	YBX1P10	1547	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	36471008	36471193	36471156	Y	NA	RNF38	RNF38,MELK	IMR90	Hi-C	24141950	RNF38	14352	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	36795051	36795090	36795071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELK	224192	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	36924974	36925090	36925030	Y	MELK	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	193446	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.74440624473826
chr9	37197498	37198123	37197885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	78962	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	37198449	37198887	37198604	Y	ZBTB5,ZCCHC7	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	79913	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	37835930	37836292	37836154	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	36496	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	37954084	37954355	37954258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	112329	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	38008217	38008489	38008387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	58195	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	68417391	68418146	68417579	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	35229	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chr9	71413577	71413589	71413582	Y	NA	FAM122A	NA	NA	NA	NA	FAM122A	20613	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	71567236	71567601	71567286	Y	TJP2	NA	NA	NA	NA	NA	FXN	80574	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	71634884	71635015	71634950	Y	PIP5K1B	FXN	NA	NA	NA	NA	FXN	13160	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	71728196	71728449	71728285	Y	NA	TJP2	NA	NA	NA	NA	TJP2	5760	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr9	72717148	72717358	72717253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMDC2	60651	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	72923580	72923722	72923651	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	51643	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	7.13545623631947
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.01884686921208
chr9	73196795	73197009	73196903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	169255	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	73437817	73438081	73438034	Y	TRPM3	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	410277	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	75747117	75747734	75747349	Y	ANXA1	ANXA1	ANXA1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA1	16939	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chr9	82495908	82496274	82496091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLE4	311220	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	86051693	86051979	86051837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD3	99482	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	88184194	88184649	88184621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	170295	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	88346951	88347024	88346988	Y	NA	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	7920	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	89626902	89626982	89626949	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	2335	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr9	90216174	90216503	90216403	Y	DAPK1,CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	77957	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	91653504	91653820	91653662	Y	C9orf47,SHC3	NA	NA	NA	NA	NA	CKS2	270293	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	NA	NA	NA	NA	NA	CKS2	128444	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	5.21437186500269
chr9	94614253	94614381	94614318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROR2	96063	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	95055002	95055331	95055316	Y	IPPK	IARS,CENPP,NOL8	NA	NA	NA	NA	IARS	964	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	95860928	95861146	95861059	Y	IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1	C9orf89,NINJ1	NA	NA	NA	NA	C9orf89	4428	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	96335202	96335517	96335360	Y	NA	PHF2	NA	NA	NA	NA	PHF2	1172	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	96434811	96435085	96434948	Y	PHF2	NA	NA	NA	NA	NA	PHF2	98122	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	9706	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr9	97684288	97685133	97684708	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	197305	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	97906311	97906710	97906505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	171281	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	98768233	98768612	98768423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00476	131974	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	99171138	99171308	99171256	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	RP11-172F4.2	3572	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	99182775	99182932	99182834	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	4164	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	99213129	99213681	99213680	Y	ZNF510,CDC14B,HABP4	RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	HABP4	2646	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	100880203	100880431	100880317	Y	C9orf156,HEMGN,TRIM14,TRIM14	TRIM14	NA	NA	NA	NA	TRIM14	709	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	100985595	100985973	100985751	Y	TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	29942	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	100994380	100994637	100994474	Y	TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	21278	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	101002580	101002910	101002849	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	13005	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	101011075	101011589	101011252	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	4326	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	102422408	102422889	102422616	Y	ERP44,NR4A3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-554F20.1	157282	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	102580616	102580992	102580865	Y	NA	RP11-554F20.1,NR4A3	NA	NA	NA	NA	RP11-554F20.1	445	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	102908427	102908826	102908633	Y	NA	ERP44,INVS	NA	NA	NA	NA	INVS	48889	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	103192373	103192745	103192675	Y	C9orf30	TMEFF1	C9orf30-TMEFF1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEFF1	9815	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	109159029	109159177	109159103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-308N19.1	120356	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	109655091	109655246	109655169	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	31713	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	109933165	109933377	109933258	Y	KLF4	NA	ZNF462,MIR548Q,RAD23B	IMR90	Hi-C	24141950	RAD23B	110041	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	109975791	109976065	109975989	Y	KLF4	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23B	67353	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	110109718	110109795	110109757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23B	66300	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	111482488	111482546	111482517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-220D10.1	95375	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	111774521	111775173	111774726	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	712	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr9	112578765	112579213	112578950	Y	PALM2	PALM2-AKAP2,AKAP2	NA	NA	NA	NA	AKAP2	37996	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	112813346	112813601	112813470	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	203319	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	112919210	112919591	112919336	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	97329	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	112937115	112937268	112937191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	79652	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	113412585	113412772	113412669	Y	NA	NA	LPAR1,KIAA0368,SVEP1,MUSK,OR2K2,DNAJC25-GNG10	IMR90	Hi-C	24141950	LPAR1	386209	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	113507067	113507395	113507232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAR1	291586	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	114585349	114585680	114585428	Y	NA	NA	MIR3134,C9orf84,SUSD1,UGCG	IMR90	Hi-C	24141950	UGCG	71366	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	114790932	114791388	114791198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	133886	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	115606684	115606763	115606738	Y	ZFP37	NA	NA	NA	NA	NA	SNX30	95566	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	115657106	115657497	115657253	Y	SNX30,SLC31A2,FKBP15,SLC46A2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF883	115010	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	116281787	116282895	116282664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	76776	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr9	116341254	116341479	116341362	Y	RGS3	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	136243	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr9	116385277	116385518	116385372	Y	RGS3	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	180266	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr9	116728685	116728905	116728795	Y	AMBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF618	92123	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	117135053	117135760	117135486	Y	DFNB31,DFNB31,AKNA	NA	NA	NA	NA	NA	DFNB31	129970	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	117147567	117148178	117147802	Y	DFNB31,DFNB31,ATP6V1G1,ORM2,AKNA	NA	NA	NA	NA	NA	DFNB31	117552	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	117660866	117661644	117661253	Y	DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	216892	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	117730994	117731461	117731152	Y	DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8	NA	LOC100505478,TNFSF15,DFNB31,TNFSF8,AKNA,C9orf91	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	147075	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	117774488	117774830	117774662	Y	ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	103706	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	117785314	117785612	117785505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	92924	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	118350454	118350525	118350489	Y	DEC1	NA	ASTN2,PAPPA,TNC,DEC1,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	471918	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	118434933	118435213	118435118	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	556397	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr9	118435271	118435690	118435488	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	556735	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	118436011	118436199	118436119	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	557475	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	118919313	118920155	118919798	Y	PAPPA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA-AS2	128893	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	118953256	118953446	118953306	Y	PAPPA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA-AS2	95602	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	119018286	119018486	119018325	Y	PAPPA	PAPPA-AS2	NA	NA	NA	NA	PAPPA-AS2	30562	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	119025545	119025710	119025628	Y	PAPPA	PAPPA-AS2	NA	NA	NA	NA	PAPPA-AS2	23338	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr9	119034263	119034570	119034504	Y	NA	PAPPA-AS2	NA	NA	NA	NA	PAPPA-AS2	14478	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr9	123208545	123208837	123208691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	131611	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	123546044	123546305	123546215	Y	TRAF1,TRAF1,MEGF9,FBXW2	FBXW2,PSMD5-AS1	NA	NA	NA	NA	FBXW2	7385	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	123640419	123640826	123640772	Y	NA	PSMD5,PHF19	NA	NA	NA	NA	PHF19	2813	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	124361597	124361984	124361689	Y	NA	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	34261	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.37220312236913
chr9	124704763	124705076	124704868	Y	TTLL11,MRRF,DAB2IP	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL11	148809	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	125109314	125109437	125109338	Y	NA	NA	TTLL11,MIR4478,MORN5,NDUFA8,LHX6,RBM18,MRRF,PTGS1,OR1K1,PDCL	IMR90	Hi-C	24141950	RBM18	84196	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	125654025	125654372	125654281	Y	NA	RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,RABGAP1	NA	NA	NA	NA	RC3H2	11248	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	126029655	126030141	126030108	Y	NA	STRBP	NA	NA	NA	NA	STRBP	800	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	126632279	126632299	126632291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	58132	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	127044216	127044998	127044297	Y	DENND1A	NEK6	NA	NA	NA	NA	NEK6	26331	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	127944437	127944756	127944696	Y	NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	5462	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	128530354	128530667	128530385	Y	NA	PBX3	NA	NA	NA	NA	PBX3	22730	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	130281582	130281994	130281773	Y	TOR2A,SH2D3C,FAM129B,CDK9	NA	NA	NA	NA	NA	FAM129B	57274	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	130329548	130329691	130329605	Y	PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9577	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	130675929	130676130	130676030	Y	NA	AK1,ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,DPM2	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC4	1187	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	130834459	130834744	130834726	Y	NA	SLC25A25,NAIF1	NA	NA	NA	NA	NAIF1	5974	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	131929415	131929566	131929473	Y	METTL11A,C9orf106	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8974	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	4.66549061605504
chr9	132223086	132223659	132223410	Y	C9orf106,TOR1B	LINC00963	PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106,C9orf50,METTL11A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	20071	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	132249735	132250094	132249903	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	6005	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	132319720	132320056	132319894	Y	DOLPP1	NA	FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	75990	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	132705367	132705623	132705495	Y	C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1	97850	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	132785309	132785843	132785545	Y	USP20,USP20,FNBP1	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	FNBP1	17630	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	132949592	132949704	132949653	Y	C9orf78	NCS1	NA	NA	NA	NA	NCS1	16735	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	132963704	132964128	132963904	Y	NCS1	NCS1	NA	NA	NA	NA	NCS1	30847	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	133736245	133736518	133736410	Y	ABL1	NA	NA	NA	NA	NA	FIBCD1	76155	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chr9	134908976	134909021	134908999	Y	NA	MED27	NA	NA	NA	NA	MED27	44274	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	134913456	134913470	134913463	Y	NA	MED27	NA	NA	NA	NA	MED27	39825	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	135279793	135280144	135280078	Y	TTF1	TTF1,C9orf171,RNU5D-2P	NA	NA	NA	NA	TTF1	65	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27843	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.74440624473826
chr9	136284309	136284583	136284382	Y	C9orf96	SURF4,C9orf96,REXO4	NA	NA	NA	NA	REXO4	3145	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	136576519	136576779	136576603	Y	SURF4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A6	234260	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	136856624	136856782	136856656	Y	VAV2	VAV2,LINC00094	NA	NA	NA	NA	VAV2	898	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	137536549	137536868	137536739	Y	COL5A1	COL5A1	NA	NA	NA	NA	COL5A1	4929	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	138977760	138977846	138977803	Y	NA	NACC2,C9orf69	NA	NA	NA	NA	NACC2	7285	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	139120043	139120348	139120196	Y	NOTCH1	QSOX2	NA	NA	NA	NA	QSOX2	15339	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	139237317	139237472	139237398	Y	GPSM1	GPSM1,DNLZ	NA	NA	NA	NA	GPSM1	17385	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	139462526	139462651	139462613	Y	C9orf69	NOTCH1	MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NOTCH1	24212	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	139540778	139541198	139541031	Y	NOTCH1,NPDC1,FAM69B,EGFL7,EGFL7	AGPAT2	SEC16A,C9orf163	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AGPAT2	38677	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	140023271	140023604	140023504	Y	EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621	NA	NA	NA	NA	DPP7	15642	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7,MIR3621	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	13.7220312236913
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	15308	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	140301516	140301688	140301630	Y	CACNA1B,NRARP	EXD3,NOXA1,ENTPD8	NA	NA	NA	NA	EXD3	14026	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	140306093	140306345	140306289	Y	NRARP	EXD3,NOXA1,ENTPD8	NA	NA	NA	NA	EXD3	9369	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	140341522	140341675	140341601	Y	EHMT1,ANAPC2,NELF	EXD3,NOXA1,ENTPD8	NA	NA	NA	NA	ENTPD8	7254	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chr9	140463644	140464019	140463889	Y	FAM166A,C9orf173	MRPL41,ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	ZMYND19	18923	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chr9	140565381	140565755	140565635	Y	NRARP	NA	NA	NA	NA	NA	EHMT1	53937	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	1358576	1358902	1358788	Y	P2RY8,IL3RA,ASMTL,ASMT,AKAP17A,SLC25A6,ASMTL,CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	150715	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	1524384	1524716	1524554	Y	CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA,P2RY8,ASMTL,ASMT,AKAP17A,IL3RA,SLC25A6,ASMTL	SLC25A6,ASMTL	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	14767	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chrX	3870962	3871082	3871022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	241313	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	4628683	4629054	4628903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	999034	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	8698180	8698491	8698336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAL1	0	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	9786668	9786951	9786810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC3	194651	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chrX	10586151	10586408	10586285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1	263365	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chrX	12154939	12155307	12155123	Y	FRMPD4	NA	NA	NA	NA	NA	MSL3	380661	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	12228582	12228906	12228588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSL3	454304	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chrX	13002969	13003378	13003273	Y	TLR7,TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	11742	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	14262210	14262757	14262259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8	216198	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	16805192	16805460	16805250	Y	TXLNG	TXLNG	NA	NA	NA	NA	TXLNG	2642	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	18693104	18693424	18693141	Y	PHKA2,CDKL5	NA	NA	NA	NA	NA	CDKL5	251401	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	19407416	19407434	19407425	Y	NA	PDHA1	NA	NA	NA	NA	PDHA1	47405	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	19701008	19701387	19701257	Y	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K15	169629	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	20628422	20628647	20628433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA3	344899	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	21945015	21945333	21945248	Y	NA	SMS	SMS,MBTPS2	IMR90	Hi-C	24141950	SMS	11358	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	21950501	21951081	21950869	Y	NA	SMS	SMS	K562	ChIA-PET	22265404	SMS	5610	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	22013670	22013825	22013692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMS	56979	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	23916832	23916979	23916884	Y	ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,ACOT9,SAT1	APOO	NA	NA	NA	NA	APOO	7078	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	28999435	28999810	28999466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RAPL1	395919	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chrX	29320225	29320230	29320228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RAPL1	716709	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	29496854	29497166	29496936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RAPL1	893338	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	29678122	29678339	29678241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTLP2	968076	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.19552499579061
chrX	29681325	29681360	29681343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTLP2	965055	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	38338792	38338989	38338897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGR	153975	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chrX	39719139	39719410	39719301	Y	BCOR	NA	BCOR	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP1	73749	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	39767458	39767957	39767519	Y	NA	NA	BCOR	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP1	122068	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	39871700	39871985	39871950	Y	BCOR,BCOR	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	162597	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	39965558	39965902	39965820	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	68680	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	39968308	39968728	39968376	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65854	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	41182589	41182765	41182693	Y	NA	DDX3X	DDX3X	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDX3X	7886	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	41547328	41547693	41547479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASK	233023	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	41759638	41759871	41759773	Y	NA	CASK	NA	NA	NA	NA	CASK	20845	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAOA	375123	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	44168721	44168911	44168853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUNDC1	231336	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chrX	45374628	45375077	45374937	Y	NA	NA	MIR221,MIR222	IMR90	Hi-C	24141950	MIR221	228617	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	45569317	45570037	45569421	Y	NA	MIR221,MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR221	33657	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	45626471	45627108	45626806	Y	NA	MIR221,MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR222	21941	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chrX	45631125	45631239	45631172	Y	NA	MIR221,MIR222	NA	NA	NA	NA	MIR222	26595	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	45665386	45665505	45665456	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	43415	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	45943096	45943186	45943141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	234176	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	46120012	46120235	46120091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-30G7.2	64845	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	46148096	46148185	46148140	Y	NA	RP1-30G7.2	NA	NA	NA	NA	RP1-30G7.2	36895	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	46182516	46182747	46182636	Y	NA	RP1-30G7.2	NA	NA	NA	NA	RP1-30G7.2	2333	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	7.68433748526712
chrX	46278987	46279293	46279130	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18856	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	46989082	46989431	46989227	Y	NA	RBM10,NDUFB11	NA	NA	NA	NA	RBM10	12837	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	48571549	48571765	48571661	Y	NA	SUV39H1	NA	NA	NA	NA	SUV39H1	19604	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	48782253	48782568	48782411	Y	NA	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2,OTUD5	NA	NA	NA	NA	PIM2	7952	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	52949996	52950343	52950129	Y	TSPYL2,KDM5C,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	31660	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chrX	53292881	53293274	53292937	Y	NA	KDM5C	NA	NA	NA	NA	KDM5C	40277	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chrX	53741584	53742291	53741941	Y	KDM5C,SMC1A,HUWE1,PHF8	HUWE1	HUWE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	HUWE1	29911	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	56269843	56269989	56269918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBQLN2	318037	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	57421884	57422193	57422039	Y	FAAH2	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-323P24.3	275789	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	62728532	62728688	62728610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-357C3.3	50263	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	64683455	64683784	64683516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAS1L	68871	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	67728770	67728923	67728861	Y	NA	YIPF6	NA	NA	NA	NA	YIPF6	12605	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	67870380	67870574	67870477	Y	NA	STARD8	NA	NA	NA	NA	STARD8	4872	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	SERBP1P1,EFNB1	NA	NA	NA	NA	SERBP1P1	3040	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	3.01884686921208
chrX	69653784	69653948	69653832	Y	NA	DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8763	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chrX	70401853	70402134	70401993	Y	IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO	NA	NA	NA	NA	NA	MED12	65447	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	74960822	74961039	74960972	Y	NA	TTC3P1	NA	NA	NA	NA	TTC3P1	3710	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.64664374684296
chrX	92479084	92479478	92479382	Y	NA	RP13-88F20.1	NA	NA	NA	NA	RP13-88F20.1	1070	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chrX	100111421	100111452	100111441	Y	NA	CSTF2	NA	NA	NA	NA	CSTF2	38037	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	106595667	106595822	106595802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM41	235610	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	108883543	108883897	108883721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL4	90735	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	116850069	116850456	116850264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR44	627580	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	117896439	117896822	117896632	Y	NA	IL13RA1	NA	NA	NA	NA	IL13RA1	36904	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	120331489	120331718	120331553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	569484	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	2.74440624473826
chrX	120337126	120337342	120337247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	575121	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	1.0977624978953
chrX	128893807	128894053	128893941	Y	ELF4,ELF4,SASH3	NA	SASH3	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC9	81832	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	129400519	129400680	129400638	Y	NA	ZNF280C	NA	NA	NA	NA	ZNF280C	193	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.823321873421478
chrX	129982936	129983220	129983074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX2	51988	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	139822532	139822722	139822571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11C	797097	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	149369210	149369612	149369376	Y	MAMLD1	NA	MIR2114,LOC100272228	IMR90	Hi-C	24141950	MAMLD1	158077	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	149862815	149863170	149863006	Y	MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	3380	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	149863384	149863571	149863479	Y	NA	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	3949	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.548881248947652
chrX	153828728	153829141	153828914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	G6PD	54941	CAGE	SW 1573	hg19	FANTOM5	0.274440624473826